More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4491 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  100 
 
 
421 aa  874    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  40.21 
 
 
397 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  41.71 
 
 
390 aa  300  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  41.43 
 
 
399 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  37.92 
 
 
403 aa  247  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4052  cytochrome P450  35.79 
 
 
401 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal  0.478412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  38.69 
 
 
418 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0903  cytochrome P450  34.88 
 
 
425 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0338626  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6858  cytochrome P450  34.19 
 
 
409 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  35.67 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6896  cytochrome P450  32.48 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3682  cytochrome P450  34.46 
 
 
410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  33.5 
 
 
398 aa  213  7e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  35.92 
 
 
398 aa  212  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3533  cytochrome P450  35.04 
 
 
398 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  32.16 
 
 
399 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  32.16 
 
 
399 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  33.42 
 
 
398 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0872  cytochrome P450  33.14 
 
 
397 aa  199  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  34.22 
 
 
407 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4028  cytochrome P450  35.74 
 
 
392 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11815  cytochrome P450 143 cyp143  31.4 
 
 
393 aa  193  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.581255  normal  0.84811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  32.42 
 
 
412 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  29.97 
 
 
398 aa  190  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  34.97 
 
 
392 aa  189  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  32.38 
 
 
418 aa  189  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4983  cytochrome P450  30.94 
 
 
387 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  33.68 
 
 
398 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4979  cytochrome P450  32.63 
 
 
406 aa  186  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1274  hypothetical protein  34.23 
 
 
461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  29.67 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1768  cytochrome P450  31.2 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  31.83 
 
 
387 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  32.33 
 
 
412 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4160  cytochrome P450  30.4 
 
 
385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  32.87 
 
 
427 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  32.97 
 
 
404 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  32.97 
 
 
404 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1201  cytochrome P450  29.79 
 
 
395 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0703508  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  32.97 
 
 
404 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  33.8 
 
 
395 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0361  cytochrome P450  31.72 
 
 
406 aa  180  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  31.41 
 
 
402 aa  179  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0514  cytochrome P450  31.69 
 
 
421 aa  179  9e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  30.84 
 
 
403 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  29.23 
 
 
411 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  30.17 
 
 
418 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  36.68 
 
 
398 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  31.17 
 
 
410 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  29.09 
 
 
411 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  29.09 
 
 
411 aa  177  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1478  cytochrome P450  31.01 
 
 
417 aa  177  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128323  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  32.57 
 
 
405 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  32.17 
 
 
411 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  32.16 
 
 
409 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  28.19 
 
 
405 aa  176  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4131  cytochrome P450  31.67 
 
 
406 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  30.35 
 
 
402 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3600  cytochrome P450  32.74 
 
 
422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  32.17 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  32.17 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  31.04 
 
 
401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  31.25 
 
 
408 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  34.8 
 
 
406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  32.17 
 
 
411 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1062  cytochrome P450  29.75 
 
 
411 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  32.58 
 
 
405 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  31.97 
 
 
395 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  32.17 
 
 
411 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1929  cytochrome P450  34.24 
 
 
414 aa  172  9e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.12886  normal  0.128389 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  31.66 
 
 
395 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  31.12 
 
 
407 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  31.53 
 
 
411 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  30.59 
 
 
380 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4803  cytochrome P450  29.83 
 
 
394 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173439  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4422  cytochrome P450  29.83 
 
 
394 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1764  cytochrome P450  29.83 
 
 
390 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  31.55 
 
 
395 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4509  cytochrome P450  29.83 
 
 
394 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  33.33 
 
 
774 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  29.63 
 
 
426 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  31.53 
 
 
411 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  30.65 
 
 
395 aa  170  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  31.73 
 
 
395 aa  170  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6889  cytochrome P450  32.84 
 
 
414 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  28.87 
 
 
419 aa  169  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  31.89 
 
 
403 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1743  cytochrome P450  30.97 
 
 
409 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  30.5 
 
 
417 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  29.95 
 
 
401 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  29.17 
 
 
405 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  29.17 
 
 
405 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  30.61 
 
 
400 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  31.35 
 
 
395 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  32.44 
 
 
408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  29.46 
 
 
415 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  30.18 
 
 
408 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  32.44 
 
 
394 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  31.54 
 
 
396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  32.34 
 
 
413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>