More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4218 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  79.75 
 
 
395 aa  658    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  100 
 
 
395 aa  808    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  76.46 
 
 
427 aa  627  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  71.17 
 
 
395 aa  585  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  69.47 
 
 
395 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  47.73 
 
 
396 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  47.85 
 
 
398 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  47.72 
 
 
398 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  47.74 
 
 
399 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  45.69 
 
 
408 aa  359  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  47.12 
 
 
411 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  47.12 
 
 
394 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  46.87 
 
 
394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  47 
 
 
396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  45.71 
 
 
404 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  45.71 
 
 
404 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  45.71 
 
 
404 aa  352  8e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  46.48 
 
 
393 aa  349  5e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  46.68 
 
 
401 aa  349  5e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  46.85 
 
 
398 aa  349  5e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  46.68 
 
 
401 aa  349  5e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  45.82 
 
 
406 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  45.82 
 
 
406 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  46.43 
 
 
401 aa  346  4e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  45.82 
 
 
418 aa  346  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  44.95 
 
 
395 aa  342  5e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  44.47 
 
 
396 aa  339  4e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  46.1 
 
 
413 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  47.06 
 
 
395 aa  330  4e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  44.3 
 
 
403 aa  323  4e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  44.15 
 
 
397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  44.15 
 
 
397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  44.15 
 
 
397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  43.83 
 
 
400 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  46.17 
 
 
398 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  43.58 
 
 
400 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  43.58 
 
 
400 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  46.17 
 
 
398 aa  297  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  43.14 
 
 
405 aa  292  9e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  43.14 
 
 
405 aa  292  9e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  42.89 
 
 
405 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  42.93 
 
 
401 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  43.86 
 
 
392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  40.95 
 
 
405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  40.95 
 
 
405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  40.95 
 
 
405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  41.65 
 
 
402 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  41.65 
 
 
402 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  41.65 
 
 
402 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  40.85 
 
 
412 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  41.62 
 
 
400 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  41.62 
 
 
400 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3709  cytochrome P450  41.37 
 
 
400 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681823  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2479  cytochrome P450  40.36 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2001  cytochrome P450  41.01 
 
 
405 aa  272  9e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  40.25 
 
 
402 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4175  cytochrome P450  39.24 
 
 
400 aa  265  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498623  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10781  cytochrome P450 123 cyp123  42.28 
 
 
402 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  38.62 
 
 
387 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  38.99 
 
 
402 aa  257  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3437  cytochrome P450  38.58 
 
 
418 aa  249  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.701371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3845  cytochrome P450  37.97 
 
 
414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  38.52 
 
 
390 aa  239  8e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  37.98 
 
 
388 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  37.59 
 
 
774 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  33.67 
 
 
420 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  36.29 
 
 
401 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  37.89 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  37.89 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  37.89 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  35.16 
 
 
412 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  39.66 
 
 
395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4786  cytochrome P450 monooxygenase  36.48 
 
 
335 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  35.71 
 
 
406 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  38.11 
 
 
405 aa  212  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  32.81 
 
 
380 aa  209  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  37.03 
 
 
403 aa  209  9e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  35.06 
 
 
400 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  36.51 
 
 
426 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  34.77 
 
 
404 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  34.18 
 
 
413 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  35.83 
 
 
406 aa  204  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  37.34 
 
 
399 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  34.69 
 
 
412 aa  202  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0729  putative cytochrome P450  32.73 
 
 
409 aa  202  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1201  cytochrome P450  33.86 
 
 
395 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0703508  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  34.66 
 
 
401 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  33.51 
 
 
408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  35.03 
 
 
409 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2077  cytochrome P450  33.59 
 
 
412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  33.76 
 
 
402 aa  199  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  35.79 
 
 
406 aa  199  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  34.48 
 
 
405 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  36.05 
 
 
412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1062  cytochrome P450  33.33 
 
 
411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  33.17 
 
 
417 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  30.83 
 
 
411 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  33.16 
 
 
417 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  33.08 
 
 
407 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  32.44 
 
 
405 aa  195  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>