More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3682 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3682  cytochrome P450  100 
 
 
410 aa  835    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6858  cytochrome P450  39.75 
 
 
409 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0361  cytochrome P450  38.29 
 
 
406 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6896  cytochrome P450  37.63 
 
 
406 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  37.06 
 
 
390 aa  240  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3533  cytochrome P450  34.42 
 
 
398 aa  225  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  34.46 
 
 
421 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  34.17 
 
 
397 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  36.29 
 
 
399 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4052  cytochrome P450  33.8 
 
 
401 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal  0.478412 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0872  cytochrome P450  32.7 
 
 
397 aa  202  9e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1743  cytochrome P450  33.08 
 
 
409 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1478  cytochrome P450  34.73 
 
 
417 aa  195  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128323  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  31.89 
 
 
399 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  35.42 
 
 
403 aa  184  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  32.43 
 
 
399 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11815  cytochrome P450 143 cyp143  33.16 
 
 
393 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.581255  normal  0.84811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  33.23 
 
 
418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0903  cytochrome P450  31.91 
 
 
425 aa  180  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0338626  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2249  cytochrome P450  32.59 
 
 
396 aa  179  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.274245  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  31.08 
 
 
399 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0514  cytochrome P450  32.72 
 
 
421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  31.95 
 
 
398 aa  168  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  31.2 
 
 
412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4028  cytochrome P450  32.68 
 
 
392 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  32.04 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  33 
 
 
399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  32.29 
 
 
408 aa  164  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  31.35 
 
 
398 aa  164  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2431  cytochrome P450  31.51 
 
 
424 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4979  cytochrome P450  30.62 
 
 
406 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  35.35 
 
 
426 aa  159  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7140  cytochrome P450 CYP124E1  30.39 
 
 
428 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  32.26 
 
 
405 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4983  cytochrome P450  32.54 
 
 
387 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4160  cytochrome P450  29.77 
 
 
385 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1768  cytochrome P450  30.45 
 
 
405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  30.75 
 
 
398 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  27.23 
 
 
410 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4131  cytochrome P450  29.27 
 
 
406 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1764  cytochrome P450  31.3 
 
 
390 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  32.48 
 
 
410 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3600  cytochrome P450  31.64 
 
 
422 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  30.18 
 
 
404 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4803  cytochrome P450  33.23 
 
 
394 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173439  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  29.04 
 
 
401 aa  149  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1274  hypothetical protein  29.29 
 
 
461 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  31.15 
 
 
405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  30.46 
 
 
407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4422  cytochrome P450  32.66 
 
 
394 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4509  cytochrome P450  32.66 
 
 
394 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  28.57 
 
 
420 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  30.05 
 
 
406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  30.47 
 
 
400 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  30.62 
 
 
398 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  32.47 
 
 
412 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  30.52 
 
 
409 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  30.25 
 
 
412 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1929  cytochrome P450  30.83 
 
 
414 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.12886  normal  0.128389 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  30.87 
 
 
412 aa  144  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  29.41 
 
 
412 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  30.26 
 
 
442 aa  142  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  28.89 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  29.75 
 
 
400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  29.41 
 
 
418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0813  cytochrome P450  29.2 
 
 
427 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1587  cytochrome P450  30.1 
 
 
426 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  29.13 
 
 
398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  27.79 
 
 
417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  31.64 
 
 
404 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7659  cytochrome P450 CYP124E1  32.58 
 
 
412 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  33.11 
 
 
416 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5170  cytochrome P450  30.03 
 
 
426 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199405  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  29.43 
 
 
405 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  28.8 
 
 
395 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1302  cytochrome P450  31.72 
 
 
420 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  28.5 
 
 
408 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  31.72 
 
 
391 aa  137  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  28.87 
 
 
403 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1021  cytochrome P450  31.68 
 
 
425 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0609813  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  30.38 
 
 
401 aa  136  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17810  cytochrome P450  26.22 
 
 
423 aa  136  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  28.24 
 
 
419 aa  136  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  28.77 
 
 
401 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  28.88 
 
 
783 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  31.72 
 
 
428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  32.02 
 
 
424 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  31.72 
 
 
416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  28.69 
 
 
415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  31.72 
 
 
416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  31.62 
 
 
413 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  32.92 
 
 
398 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  27.95 
 
 
395 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  27.23 
 
 
403 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  29.9 
 
 
395 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1995  cytochrome P450  30.81 
 
 
417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228695  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  30.39 
 
 
420 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  28.57 
 
 
402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  30.39 
 
 
420 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  30.39 
 
 
420 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.60659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>