More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0029 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  100 
 
 
417 aa  860    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0759  cytochrome P450  48.13 
 
 
403 aa  350  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  42.05 
 
 
418 aa  316  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  42.67 
 
 
400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1951  cytochrome P450  44.94 
 
 
437 aa  308  9e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.94104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6659  cytochrome P-450  42.71 
 
 
431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337384  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0020  cytochrome P450  42.68 
 
 
422 aa  306  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0467456  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2128  cytochrome P450  42.55 
 
 
423 aa  306  6e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1782  cytochrome P450  42.21 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.114444 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  43.58 
 
 
427 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  43.58 
 
 
427 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  43.58 
 
 
427 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  42.47 
 
 
401 aa  300  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  41.28 
 
 
406 aa  298  9e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  42.07 
 
 
434 aa  297  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  41.11 
 
 
414 aa  296  5e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  42.17 
 
 
415 aa  295  8e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  40.66 
 
 
428 aa  293  4e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  40 
 
 
406 aa  292  7e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  40.66 
 
 
433 aa  290  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1765  cytochrome P450  41.59 
 
 
421 aa  289  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3006  linalool 8-monooxygenase  40.51 
 
 
433 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2991  linalool 8-monooxygenase  40.25 
 
 
433 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  38.67 
 
 
414 aa  287  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3035  linalool 8-monooxygenase  40.25 
 
 
433 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6660  cytochrome P-450  40.56 
 
 
423 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388051  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1803  cytochrome P450  41.47 
 
 
421 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.677425  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5301  cytochrome P450  41.87 
 
 
418 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.717822  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3694  cytochrome P450  41.21 
 
 
421 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3934  cytochrome P450  40.16 
 
 
421 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.184448  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4264  cytochrome P450  41.73 
 
 
421 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  39.44 
 
 
401 aa  280  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3593  putative cytochrome P450  41.83 
 
 
420 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0025  cytochrome P450  40.62 
 
 
422 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498673  normal  0.104962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  38.12 
 
 
412 aa  276  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2786  cytochrome P450  37.65 
 
 
422 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00511123  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  37.05 
 
 
447 aa  273  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0600  cytochrome P450  40.58 
 
 
470 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0220  cytochrome P450  38.64 
 
 
445 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0773  putative cytochrome P450  37.07 
 
 
416 aa  267  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  0.121605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7140  cytochrome P450 CYP124E1  40.19 
 
 
428 aa  265  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3218  cytochrome P450  39.95 
 
 
462 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.232743  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3229  cytochrome P450  39.95 
 
 
462 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29754  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3280  cytochrome P450  39.95 
 
 
462 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.692519  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4955  cytochrome P450  35.64 
 
 
411 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4572  cytochrome P450  35.4 
 
 
411 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347976  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  36.56 
 
 
418 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4660  cytochrome P450  35.4 
 
 
411 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.026328  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  37.05 
 
 
442 aa  262  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5296  cytochrome P450  40.55 
 
 
422 aa  260  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7141  cytochrome P450 CYP124E1  40.05 
 
 
416 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  39.6 
 
 
415 aa  259  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  36.52 
 
 
408 aa  259  7e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  37.07 
 
 
408 aa  257  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4592  cytochrome P450  39.06 
 
 
463 aa  257  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3821  cytochrome P450 monooxygenase  36.12 
 
 
407 aa  257  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1821  cytochrome P450  38.73 
 
 
410 aa  256  7e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  38.44 
 
 
404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0012  cytochrome P450  35.51 
 
 
422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13578  cytochrome P450 125 cyp125  33.41 
 
 
433 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0110795 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2865  linalool 8-monooxygenase  36.82 
 
 
418 aa  251  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.961693  normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5151  cytochrome P450  34.65 
 
 
410 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7865  cytochrome P450-terp  34.92 
 
 
433 aa  250  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.790452  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2431  cytochrome P450  37.47 
 
 
424 aa  250  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3012  cytochrome P450  34.87 
 
 
419 aa  249  6e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.839799  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5258  cytochrome P450  35.44 
 
 
419 aa  249  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1508  cytochrome P450  34.78 
 
 
420 aa  249  8e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4565  cytochrome P450  39.8 
 
 
402 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4653  cytochrome P450  39.8 
 
 
402 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.974362  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4043  cytochrome P450  38.67 
 
 
430 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  38.28 
 
 
409 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5062  cytochrome P450  34.78 
 
 
427 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268876  normal  0.872733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1607  cytochrome P450  33.91 
 
 
414 aa  247  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798045  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4677  cytochrome P450  34.78 
 
 
427 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4763  cytochrome P450  34.78 
 
 
427 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  35.37 
 
 
420 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3290  cytochrome P450  34.79 
 
 
417 aa  247  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121591  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  35.37 
 
 
420 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.60659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  35 
 
 
424 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  35.37 
 
 
420 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4948  cytochrome P450  39.31 
 
 
402 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3970  cytochrome P450  35.14 
 
 
436 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  34.73 
 
 
418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2723  putative cytochrome P450  34.56 
 
 
423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.538168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2767  putative cytochrome P450  34.56 
 
 
423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.052524  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5053  cytochrome P450  35.96 
 
 
419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  35.05 
 
 
412 aa  244  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  36.43 
 
 
416 aa  243  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1670  cytochrome P450  32.46 
 
 
455 aa  242  7e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0452772  normal  0.0820261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5144  cytochrome P450  35.89 
 
 
409 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623851  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2739  cytochrome P450 CYP125  35.59 
 
 
413 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.251289  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2753  putative cytochrome P450  34.56 
 
 
423 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  0.16215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4652  cytochrome P450  34.81 
 
 
424 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5035  cytochrome P450  34.81 
 
 
424 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854522  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4740  cytochrome P450  34.81 
 
 
424 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59592  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1301  cytochrome P450  35.37 
 
 
420 aa  240  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.559778  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  34.23 
 
 
412 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3721  cytochrome P450  34.13 
 
 
419 aa  238  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.540203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2640  cytochrome P450  36.63 
 
 
425 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1777  cytochrome P450  34.28 
 
 
413 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>