More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1911 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  100 
 
 
442 aa  874    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7254  cytochrome P450  54.38 
 
 
431 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2786  cytochrome P450  43.74 
 
 
422 aa  299  5e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00511123  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  42.11 
 
 
415 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  41.47 
 
 
414 aa  294  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  39.16 
 
 
400 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  41.97 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  38.69 
 
 
414 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  38.89 
 
 
418 aa  276  5e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  40.14 
 
 
406 aa  276  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  38.62 
 
 
408 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  39.71 
 
 
427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  37.7 
 
 
408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  39.71 
 
 
427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  39.71 
 
 
427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  39.81 
 
 
415 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4955  cytochrome P450  37.39 
 
 
411 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4572  cytochrome P450  37.39 
 
 
411 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4660  cytochrome P450  37.39 
 
 
411 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.026328  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  37.05 
 
 
417 aa  262  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  38.35 
 
 
433 aa  262  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5258  cytochrome P450  38.03 
 
 
419 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  39.13 
 
 
406 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1508  cytochrome P450  37.91 
 
 
420 aa  260  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  36.45 
 
 
418 aa  260  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2739  cytochrome P450 CYP125  33.92 
 
 
413 aa  259  7e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.251289  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0773  putative cytochrome P450  35.81 
 
 
416 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  0.121605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  36.67 
 
 
418 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3970  cytochrome P450  35.32 
 
 
436 aa  257  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0813  cytochrome P450  39.76 
 
 
427 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13578  cytochrome P450 125 cyp125  36.47 
 
 
433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0110795 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4677  cytochrome P450  37.91 
 
 
427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4763  cytochrome P450  37.91 
 
 
427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5062  cytochrome P450  37.91 
 
 
427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268876  normal  0.872733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  38.5 
 
 
428 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  38.01 
 
 
434 aa  252  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  38.67 
 
 
402 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7140  cytochrome P450 CYP124E1  37.83 
 
 
428 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  38.34 
 
 
412 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5151  cytochrome P450  36.09 
 
 
410 aa  249  6e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4565  cytochrome P450  38.6 
 
 
402 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4653  cytochrome P450  38.6 
 
 
402 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.974362  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3290  cytochrome P450  35.71 
 
 
417 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121591  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3006  linalool 8-monooxygenase  36.39 
 
 
433 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1607  cytochrome P450  34.17 
 
 
414 aa  247  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798045  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4948  cytochrome P450  38.37 
 
 
402 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  35.58 
 
 
412 aa  246  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  34.92 
 
 
447 aa  246  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2991  linalool 8-monooxygenase  35.9 
 
 
433 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3035  linalool 8-monooxygenase  35.9 
 
 
433 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  35.25 
 
 
412 aa  244  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2640  cytochrome P450  38.22 
 
 
425 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2723  putative cytochrome P450  36.24 
 
 
423 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.538168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2767  putative cytochrome P450  36.24 
 
 
423 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.052524  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3721  cytochrome P450  34.65 
 
 
419 aa  239  5e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.540203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3821  cytochrome P450 monooxygenase  35.17 
 
 
407 aa  239  5.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2917  cytochrome P450 family protein  35.27 
 
 
418 aa  239  8e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.136725 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2753  putative cytochrome P450  35.63 
 
 
423 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  0.16215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  36.22 
 
 
420 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7142  cytochrome P450 CYP124E1  38.39 
 
 
418 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3012  cytochrome P450  36.24 
 
 
419 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.839799  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  35.1 
 
 
416 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  36.22 
 
 
420 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  36.22 
 
 
420 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.60659 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  35.1 
 
 
416 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5144  cytochrome P450  35.91 
 
 
409 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623851  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  38.13 
 
 
409 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  35.1 
 
 
428 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  37.26 
 
 
417 aa  237  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  37.44 
 
 
404 aa  236  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  34.3 
 
 
416 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7141  cytochrome P450 CYP124E1  36.43 
 
 
416 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2431  cytochrome P450  37.18 
 
 
424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1301  cytochrome P450  35.76 
 
 
420 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.559778  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7865  cytochrome P450-terp  35.15 
 
 
433 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.790452  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3600  cytochrome P450  39 
 
 
422 aa  233  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  36.99 
 
 
398 aa  233  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  37.27 
 
 
414 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1796  cytochrome P450  34.31 
 
 
413 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222543  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  36.16 
 
 
424 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1843  cytochrome P450  34.31 
 
 
413 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.491191  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1777  cytochrome P450  34.31 
 
 
413 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4553  cytochrome P450  37.64 
 
 
404 aa  231  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174977  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1995  cytochrome P450  37.89 
 
 
417 aa  229  8e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228695  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5053  cytochrome P450  35.15 
 
 
419 aa  229  9e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  34.5 
 
 
449 aa  226  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2014  cytochrome P450  37.63 
 
 
417 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2060  cytochrome P450  37.63 
 
 
417 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.340582  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3974  cytochrome P450  33.49 
 
 
412 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  36.15 
 
 
399 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  35.4 
 
 
428 aa  224  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  36 
 
 
401 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2720  cytochrome P450  34.01 
 
 
408 aa  223  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1929  cytochrome P450  35.08 
 
 
414 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.12886  normal  0.128389 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1021  cytochrome P450  33.49 
 
 
425 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0609813  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2967  cytochrome P450  36.87 
 
 
434 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1302  cytochrome P450  32.69 
 
 
420 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  34.41 
 
 
405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4043  cytochrome P450  34.62 
 
 
430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  36.05 
 
 
402 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>