More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1544 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  100 
 
 
418 aa  869    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  56.09 
 
 
424 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  50.6 
 
 
418 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1777  cytochrome P450  50.48 
 
 
413 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1796  cytochrome P450  50.48 
 
 
413 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1843  cytochrome P450  50.48 
 
 
413 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.491191  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  50.71 
 
 
428 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  50.71 
 
 
416 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  50.71 
 
 
416 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  50.49 
 
 
420 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  50.49 
 
 
420 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.60659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  50.49 
 
 
420 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3069  cytochrome P450  48.31 
 
 
422 aa  428  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  48.33 
 
 
416 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  50.74 
 
 
449 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7865  cytochrome P450-terp  51.3 
 
 
433 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.790452  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  48.21 
 
 
412 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2720  cytochrome P450  48.89 
 
 
408 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5053  cytochrome P450  48.89 
 
 
419 aa  411  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1301  cytochrome P450  48.28 
 
 
420 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.559778  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  48.89 
 
 
412 aa  411  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1302  cytochrome P450  47.64 
 
 
420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  48.89 
 
 
428 aa  394  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5516  cytochrome P450  45.24 
 
 
429 aa  388  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3162  cytochrome P450  46.81 
 
 
430 aa  364  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.394046  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7766  cytochrome P450  43.13 
 
 
430 aa  359  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  36.13 
 
 
400 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  36.67 
 
 
442 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1995  cytochrome P450  36.52 
 
 
417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228695  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2014  cytochrome P450  36.52 
 
 
417 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2060  cytochrome P450  36.52 
 
 
417 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.340582  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  35.82 
 
 
401 aa  249  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  35.4 
 
 
417 aa  249  9e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  35.41 
 
 
415 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  34.33 
 
 
414 aa  246  6e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  34.73 
 
 
417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  35.8 
 
 
406 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  34.65 
 
 
415 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  33.74 
 
 
401 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2786  cytochrome P450  33.73 
 
 
422 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00511123  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  34.83 
 
 
414 aa  230  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7140  cytochrome P450 CYP124E1  33.79 
 
 
428 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3006  linalool 8-monooxygenase  33.84 
 
 
433 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2640  cytochrome P450  33.25 
 
 
425 aa  230  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0012  cytochrome P450  34.32 
 
 
422 aa  229  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  32.76 
 
 
418 aa  229  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  33.59 
 
 
428 aa  229  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2991  linalool 8-monooxygenase  33.84 
 
 
433 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3035  linalool 8-monooxygenase  33.84 
 
 
433 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4652  cytochrome P450  34.32 
 
 
424 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4740  cytochrome P450  34.32 
 
 
424 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59592  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5035  cytochrome P450  34.32 
 
 
424 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854522  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1021  cytochrome P450  32.85 
 
 
425 aa  227  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0609813  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4955  cytochrome P450  33.67 
 
 
411 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4572  cytochrome P450  33.67 
 
 
411 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4660  cytochrome P450  33.67 
 
 
411 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.026328  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  34.41 
 
 
408 aa  223  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  33.17 
 
 
427 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  33.17 
 
 
427 aa  222  8e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  33.17 
 
 
427 aa  222  8e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0759  cytochrome P450  34.49 
 
 
403 aa  219  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  31.91 
 
 
433 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1508  cytochrome P450  33.25 
 
 
420 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  32.58 
 
 
408 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2431  cytochrome P450  32 
 
 
424 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5151  cytochrome P450  33.92 
 
 
410 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4043  cytochrome P450  33.5 
 
 
430 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2128  cytochrome P450  32.39 
 
 
423 aa  216  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0813  cytochrome P450  32.38 
 
 
427 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  35.11 
 
 
402 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2722  cytochrome P450  33.42 
 
 
407 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  32.75 
 
 
412 aa  216  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6659  cytochrome P-450  32.14 
 
 
431 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337384  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  32.41 
 
 
434 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5258  cytochrome P450  32.92 
 
 
419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4264  cytochrome P450  33.16 
 
 
421 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3970  cytochrome P450  33.5 
 
 
436 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1607  cytochrome P450  32.66 
 
 
414 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798045  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  32.27 
 
 
447 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3974  cytochrome P450  32.99 
 
 
412 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7141  cytochrome P450 CYP124E1  31.11 
 
 
416 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4677  cytochrome P450  32.67 
 
 
427 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4763  cytochrome P450  32.67 
 
 
427 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5062  cytochrome P450  32.67 
 
 
427 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268876  normal  0.872733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  33.59 
 
 
404 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3721  cytochrome P450  31.17 
 
 
419 aa  209  5e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.540203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  33 
 
 
406 aa  209  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13578  cytochrome P450 125 cyp125  31.7 
 
 
433 aa  209  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0110795 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  34.69 
 
 
398 aa  209  9e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  33.5 
 
 
409 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3600  cytochrome P450  33.16 
 
 
422 aa  207  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0020  cytochrome P450  32.52 
 
 
422 aa  206  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0467456  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1803  cytochrome P450  32.16 
 
 
421 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.677425  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  34.06 
 
 
403 aa  206  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3593  putative cytochrome P450  31.31 
 
 
420 aa  206  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3694  cytochrome P450  32.15 
 
 
421 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3425  cytochrome P450  32.2 
 
 
421 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3934  cytochrome P450  32.13 
 
 
421 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.184448  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1951  cytochrome P450  31.88 
 
 
437 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.94104 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1929  cytochrome P450  32.43 
 
 
414 aa  203  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.12886  normal  0.128389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>