More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3721 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2917  cytochrome P450 family protein  74.7 
 
 		 418 aa  664    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.136725 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3721  cytochrome P450  100 
 
 		 419 aa  877    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.540203 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2608  cytochrome P450 family protein  55.26 
 
 		 421 aa  474  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  39.9 
 
 		 415 aa  326  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  38.93 
 
 		 414 aa  324  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  38.2 
 
 		 414 aa  296  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  38.98 
 
 		 418 aa  286  7e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  36.34 
 
 		 401 aa  259  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  34.04 
 
 		 418 aa  246  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  34.62 
 
 		 412 aa  242  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  34.71 
 
 		 406 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  32.58 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  34.65 
 
 		 442 aa  239  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  34.13 
 
 		 417 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5035  cytochrome P450  34.72 
 
 		 424 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4652  cytochrome P450  34.72 
 
 		 424 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4740  cytochrome P450  34.72 
 
 		 424 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4572  cytochrome P450  34.7 
 
 		 411 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4660  cytochrome P450  34.7 
 
 		 411 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.026328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4955  cytochrome P450  34.46 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  36.3 
 
 		 427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  36.3 
 
 		 427 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  36.3 
 
 		 427 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1607  cytochrome P450  33.65 
 
 		 414 aa  229  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  34.83 
 
 		 415 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  35.45 
 
 		 434 aa  227  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  34.67 
 
 		 428 aa  226  8e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0012  cytochrome P450  33.87 
 
 		 422 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  33.33 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4565  cytochrome P450  36.08 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4653  cytochrome P450  36.08 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.974362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  35.49 
 
 		 414 aa  223  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  35.37 
 
 		 433 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5151  cytochrome P450  33.57 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4494  cytochrome P450  32.86 
 
 		 427 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  34.41 
 
 		 404 aa  219  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4948  cytochrome P450  35.68 
 
 		 402 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7140  cytochrome P450 CYP124E1  33.97 
 
 		 428 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  33.74 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1777  cytochrome P450  32.58 
 
 		 413 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1796  cytochrome P450  32.58 
 
 		 413 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1843  cytochrome P450  32.58 
 
 		 413 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.491191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  32.15 
 
 		 428 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2786  cytochrome P450  33.01 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00511123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  32.15 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  32.15 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  30.68 
 
 		 408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7254  cytochrome P450  32.79 
 
 		 431 aa  212  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0813  cytochrome P450  34.57 
 
 		 427 aa  212  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1995  cytochrome P450  32.66 
 
 		 417 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2014  cytochrome P450  32.66 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2739  cytochrome P450 CYP125  31.21 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.251289  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2060  cytochrome P450  32.66 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.340582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  30.71 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  31.17 
 
 		 418 aa  209  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2640  cytochrome P450  33.02 
 
 		 425 aa  209  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3970  cytochrome P450  31.1 
 
 		 436 aa  209  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  32.66 
 
 		 449 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7142  cytochrome P450 CYP124E1  34.26 
 
 		 418 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  33.66 
 
 		 409 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3974  cytochrome P450  32.06 
 
 		 412 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  30.46 
 
 		 412 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  32.13 
 
 		 401 aa  207  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1301  cytochrome P450  31.58 
 
 		 420 aa  206  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.559778  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0020  cytochrome P450  33.59 
 
 		 422 aa  206  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0467456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13578  cytochrome P450 125 cyp125  29.67 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0110795 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1021  cytochrome P450  30.62 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0609813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3821  cytochrome P450 monooxygenase  29.86 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7141  cytochrome P450 CYP124E1  33.51 
 
 		 416 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1951  cytochrome P450  33.73 
 
 		 437 aa  202  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1508  cytochrome P450  31.09 
 
 		 420 aa  202  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  32.26 
 
 		 408 aa  202  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  33.09 
 
 		 428 aa  202  9e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5516  cytochrome P450  29.04 
 
 		 429 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1302  cytochrome P450  31.12 
 
 		 420 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3593  putative cytochrome P450  35.03 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5144  cytochrome P450  33.25 
 
 		 409 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7865  cytochrome P450-terp  29.65 
 
 		 433 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.790452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2723  putative cytochrome P450  30.05 
 
 		 423 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.538168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2767  putative cytochrome P450  30.05 
 
 		 423 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.052524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5258  cytochrome P450  30.4 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2431  cytochrome P450  32.17 
 
 		 424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0773  putative cytochrome P450  30.31 
 
 		 416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  0.121605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  30.02 
 
 		 416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4043  cytochrome P450  32.28 
 
 		 430 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2753  putative cytochrome P450  30.05 
 
 		 423 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  0.16215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  29.93 
 
 		 424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6659  cytochrome P-450  31.97 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3006  linalool 8-monooxygenase  31.86 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.106832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3012  cytochrome P450  30.05 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.839799  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5062  cytochrome P450  29.9 
 
 		 427 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268876  normal  0.872733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4677  cytochrome P450  29.9 
 
 		 427 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4763  cytochrome P450  29.9 
 
 		 427 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2991  linalool 8-monooxygenase  31.37 
 
 		 433 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3035  linalool 8-monooxygenase  31.37 
 
 		 433 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1765  cytochrome P450  31.9 
 
 		 421 aa  193  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7766  cytochrome P450  29.6 
 
 		 430 aa  192  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2128  cytochrome P450  32.39 
 
 		 423 aa  192  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5053  cytochrome P450  30.79 
 
 		 419 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5301  cytochrome P450  31.95 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.717822  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>