More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3631 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  85.71 
 
 		 399 aa  706    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  100 
 
 		 399 aa  818    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  88.16 
 
 		 399 aa  739    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  72.29 
 
 		 398 aa  604  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  74.24 
 
 		 398 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  38.85 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  37.96 
 
 		 390 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  36.46 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  32.69 
 
 		 426 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4979  cytochrome P450  33.92 
 
 		 406 aa  210  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  32.16 
 
 		 421 aa  210  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  34.26 
 
 		 380 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  32.11 
 
 		 407 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1768  cytochrome P450  33.67 
 
 		 405 aa  206  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  35.4 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4052  cytochrome P450  36.16 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal  0.478412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  32.28 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1021  cytochrome P450  33.42 
 
 		 415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  33.51 
 
 		 395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  34.6 
 
 		 392 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  32.59 
 
 		 418 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  34.7 
 
 		 410 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  32.83 
 
 		 398 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  33.97 
 
 		 418 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  36.05 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  32.45 
 
 		 427 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0997  cytochrome P450  33.15 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148456  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  37.38 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  34.58 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  36.27 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  31.76 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  32.99 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  34.18 
 
 		 420 aa  189  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  33.33 
 
 		 464 aa  189  8e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4131  cytochrome P450  29.97 
 
 		 406 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  32.56 
 
 		 404 aa  189  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  29.35 
 
 		 412 aa  189  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6858  cytochrome P450  32 
 
 		 409 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1964  cytochrome P450  31.51 
 
 		 421 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.512147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  32.05 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  32.58 
 
 		 398 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  32.32 
 
 		 398 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4028  cytochrome P450  34.03 
 
 		 392 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  31.73 
 
 		 409 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  33.74 
 
 		 418 aa  187  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  33.08 
 
 		 399 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3533  cytochrome P450  31.34 
 
 		 398 aa  186  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  31.77 
 
 		 417 aa  186  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  29.87 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  33.92 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  33.33 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  31.93 
 
 		 417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  30.12 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  31.31 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  29.92 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  33.42 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3682  cytochrome P450  32.43 
 
 		 410 aa  184  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  32.44 
 
 		 406 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  33.52 
 
 		 401 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  33.08 
 
 		 404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  33.08 
 
 		 404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  32.61 
 
 		 418 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  33.08 
 
 		 404 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  30.46 
 
 		 405 aa  183  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  31.34 
 
 		 406 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  31.88 
 
 		 398 aa  182  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1796  cytochrome P450  31.86 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222543  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6896  cytochrome P450  30.03 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1843  cytochrome P450  31.86 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.491191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1777  cytochrome P450  31.86 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  32.59 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  31.63 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  33.57 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  34.32 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  31.13 
 
 		 403 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  30.62 
 
 		 410 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  30.47 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  32.63 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11815  cytochrome P450 143 cyp143  33.05 
 
 		 393 aa  180  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.581255  normal  0.84811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  31.03 
 
 		 407 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  33.42 
 
 		 395 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  32.41 
 
 		 409 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  31.97 
 
 		 408 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  31.93 
 
 		 410 aa  179  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  31.69 
 
 		 407 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  31.2 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  33.15 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  32.09 
 
 		 443 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  32.82 
 
 		 449 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  33.75 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  31.19 
 
 		 408 aa  176  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  29.17 
 
 		 406 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  31.65 
 
 		 408 aa  176  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1274  hypothetical protein  30.69 
 
 		 461 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0903  cytochrome P450  31.21 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0338626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  32.63 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  32.63 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  34.95 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2895  cytochrome P450  32.86 
 
 		 401 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  32.63 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>