More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1932 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  100 
 
 		 399 aa  818    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  85.71 
 
 		 399 aa  706    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  86.65 
 
 		 399 aa  716    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  73.05 
 
 		 398 aa  610  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  74.24 
 
 		 398 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  38.16 
 
 		 399 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  36.34 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  36.88 
 
 		 390 aa  240  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1768  cytochrome P450  35.25 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  33.5 
 
 		 407 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4979  cytochrome P450  34.42 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  34.39 
 
 		 380 aa  209  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  32.16 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  30.97 
 
 		 426 aa  203  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  32.24 
 
 		 418 aa  202  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0997  cytochrome P450  32.13 
 
 		 400 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148456  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  34.32 
 
 		 388 aa  195  9e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  34.07 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  33.83 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  37.9 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  30.88 
 
 		 402 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4052  cytochrome P450  36.39 
 
 		 401 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal  0.478412 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  34.01 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  31.92 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  33.23 
 
 		 410 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  36.27 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  31.87 
 
 		 400 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6858  cytochrome P450  32.58 
 
 		 409 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4131  cytochrome P450  30.49 
 
 		 406 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  32.05 
 
 		 398 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1021  cytochrome P450  32.32 
 
 		 415 aa  186  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  30.05 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  32.75 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  31.94 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  33.59 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  32.56 
 
 		 404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1964  cytochrome P450  31.02 
 
 		 421 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.512147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  32.56 
 
 		 404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  32.56 
 
 		 404 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  32.61 
 
 		 401 aa  182  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  32.44 
 
 		 464 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  34.06 
 
 		 404 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  30.05 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4028  cytochrome P450  34.46 
 
 		 392 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  33.24 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  30.45 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  29.9 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  31.67 
 
 		 398 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  31.46 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  35.06 
 
 		 418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  30.89 
 
 		 395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  32.55 
 
 		 401 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  32.55 
 
 		 401 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  34.15 
 
 		 449 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  33.5 
 
 		 450 aa  179  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3682  cytochrome P450  31.08 
 
 		 410 aa  179  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  30.97 
 
 		 395 aa  179  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  32.75 
 
 		 417 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  36.7 
 
 		 412 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  31.58 
 
 		 427 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  34.48 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  32.44 
 
 		 406 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  28.93 
 
 		 412 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  32.28 
 
 		 401 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2479  cytochrome P450  32.57 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  35.76 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  31.61 
 
 		 398 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  33.16 
 
 		 404 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  36.7 
 
 		 412 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  32.47 
 
 		 397 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  30.86 
 
 		 410 aa  176  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  32.47 
 
 		 397 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  32.47 
 
 		 397 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  30.73 
 
 		 409 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  30.93 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  32.3 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  31.39 
 
 		 436 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  29.75 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  32.47 
 
 		 395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  31.28 
 
 		 430 aa  173  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  29.69 
 
 		 390 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  31.66 
 
 		 424 aa  172  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  29.04 
 
 		 411 aa  172  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  32.35 
 
 		 404 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  30.2 
 
 		 407 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  30.28 
 
 		 408 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  30.69 
 
 		 406 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1274  hypothetical protein  31.55 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  31.54 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  31.2 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  32.35 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  32.35 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  33 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  32.66 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  29.14 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  30.9 
 
 		 411 aa  171  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3832  cytochrome P450  30.22 
 
 		 396 aa  170  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0796027  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4983  cytochrome P450  29.71 
 
 		 387 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  27.79 
 
 		 417 aa  170  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  35.96 
 
 		 395 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>