More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3533 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3533  cytochrome P450  100 
 
 
398 aa  807    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1478  cytochrome P450  45.66 
 
 
417 aa  348  9e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128323  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0514  cytochrome P450  44.39 
 
 
421 aa  328  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6858  cytochrome P450  43.18 
 
 
409 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0361  cytochrome P450  41.16 
 
 
406 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6896  cytochrome P450  38.48 
 
 
406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2249  cytochrome P450  35.95 
 
 
396 aa  256  7e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.274245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1743  cytochrome P450  34.94 
 
 
409 aa  243  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3682  cytochrome P450  34.42 
 
 
410 aa  225  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0872  cytochrome P450  35.4 
 
 
397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  35.04 
 
 
421 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  34.18 
 
 
390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  32.03 
 
 
397 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  31.34 
 
 
399 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  29.84 
 
 
399 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0903  cytochrome P450  30.77 
 
 
425 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0338626  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  32.13 
 
 
399 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4052  cytochrome P450  31.27 
 
 
401 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal  0.478412 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  32.17 
 
 
398 aa  176  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  31.16 
 
 
398 aa  173  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  29.16 
 
 
399 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  32.16 
 
 
407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  32.94 
 
 
418 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  31.58 
 
 
412 aa  159  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  33.33 
 
 
403 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11815  cytochrome P450 143 cyp143  30.59 
 
 
393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.581255  normal  0.84811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1764  cytochrome P450  32.61 
 
 
390 aa  142  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  29.35 
 
 
410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4160  cytochrome P450  31.98 
 
 
385 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4983  cytochrome P450  32.3 
 
 
387 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  31.06 
 
 
418 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4028  cytochrome P450  30.42 
 
 
392 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  26.72 
 
 
380 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6889  cytochrome P450  27.84 
 
 
414 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  28.42 
 
 
398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  28.7 
 
 
401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  28.36 
 
 
387 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4979  cytochrome P450  29.53 
 
 
406 aa  133  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4422  cytochrome P450  31.08 
 
 
394 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4509  cytochrome P450  31.08 
 
 
394 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  30.23 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  29.52 
 
 
421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4803  cytochrome P450  31.08 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173439  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17810  cytochrome P450  28.53 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  28.97 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  28.8 
 
 
388 aa  131  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  27.88 
 
 
415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  30.17 
 
 
395 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  31.85 
 
 
438 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  30.56 
 
 
396 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1274  hypothetical protein  28.03 
 
 
461 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  27.51 
 
 
412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  28.31 
 
 
428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  28.42 
 
 
411 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  29.05 
 
 
427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  32.06 
 
 
395 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  32.25 
 
 
405 aa  126  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  28.57 
 
 
411 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  30.24 
 
 
404 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  27.84 
 
 
420 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  31.31 
 
 
398 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  30.24 
 
 
404 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  30.24 
 
 
404 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  27.74 
 
 
411 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  29.97 
 
 
426 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  27.74 
 
 
411 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2668  cytochrome P450 family protein  26.87 
 
 
404 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061482 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  27.16 
 
 
411 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  27.74 
 
 
411 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  30.36 
 
 
443 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  27.42 
 
 
399 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  31.53 
 
 
411 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  27.74 
 
 
411 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  31.27 
 
 
413 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  27.3 
 
 
398 aa  124  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  31.65 
 
 
395 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  28.34 
 
 
400 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  27.4 
 
 
411 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  27.4 
 
 
411 aa  122  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  27.42 
 
 
398 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1768  cytochrome P450  28.11 
 
 
405 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2132  cytochrome P450  28.11 
 
 
417 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257002  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  31.08 
 
 
420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2659  cytochrome P450 family protein  26.04 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00743758  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  30.65 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  29.15 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  29.27 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  27.59 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  28.88 
 
 
406 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  28.92 
 
 
418 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1694  cytochrome P450 hydroxylase  27.27 
 
 
414 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2656  cytochrome P450 family protein  26.27 
 
 
404 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  28.88 
 
 
406 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  27.27 
 
 
417 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  29.31 
 
 
395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  27.75 
 
 
433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  29.08 
 
 
447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  29.08 
 
 
447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  29.76 
 
 
395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  25.71 
 
 
414 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>