More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7099 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  100 
 
 
396 aa  812    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  72.7 
 
 
395 aa  616  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  69.64 
 
 
411 aa  577  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  70.15 
 
 
394 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  69.64 
 
 
394 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  69.82 
 
 
393 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  58.16 
 
 
404 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  58.16 
 
 
404 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  58.16 
 
 
404 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  57.54 
 
 
398 aa  488  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  57.22 
 
 
396 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  59.14 
 
 
396 aa  488  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  56.82 
 
 
418 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  56.82 
 
 
406 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  56.82 
 
 
406 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  55.38 
 
 
400 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  55.13 
 
 
400 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  55.13 
 
 
400 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  53.92 
 
 
398 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  52.93 
 
 
413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  53.47 
 
 
408 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  53.88 
 
 
399 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  53.03 
 
 
403 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  50.64 
 
 
398 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  50.5 
 
 
401 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  50.5 
 
 
401 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  50.5 
 
 
401 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  48.6 
 
 
397 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  48.6 
 
 
397 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  48.6 
 
 
397 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  46.85 
 
 
395 aa  358  6e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  46.37 
 
 
395 aa  358  9e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  47 
 
 
395 aa  356  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  45.57 
 
 
395 aa  346  3e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  45.84 
 
 
427 aa  343  4e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  41.88 
 
 
395 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  40.39 
 
 
398 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  40.2 
 
 
398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  38.6 
 
 
405 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  38.6 
 
 
405 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  38.35 
 
 
405 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  38.25 
 
 
401 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  38.12 
 
 
405 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  38.12 
 
 
405 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  38.12 
 
 
405 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  37.93 
 
 
392 aa  255  8e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  37.59 
 
 
412 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2001  cytochrome P450  37.69 
 
 
405 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2479  cytochrome P450  37 
 
 
400 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  38.1 
 
 
402 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  38.1 
 
 
402 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  38.1 
 
 
402 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  37 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  37 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3709  cytochrome P450  36.75 
 
 
400 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681823  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4175  cytochrome P450  35.5 
 
 
400 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498623  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  36.97 
 
 
402 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3845  cytochrome P450  36.79 
 
 
414 aa  236  7e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10781  cytochrome P450 123 cyp123  38.35 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983786 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4786  cytochrome P450 monooxygenase  49.76 
 
 
335 aa  232  9e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  37.97 
 
 
387 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  36.21 
 
 
402 aa  226  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1201  cytochrome P450  33.42 
 
 
395 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0703508  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1062  cytochrome P450  33.42 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  35.5 
 
 
396 aa  219  8.999999999999998e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3437  cytochrome P450  35.52 
 
 
418 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.701371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2708  putative cytochrome P450  34.64 
 
 
387 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  34.69 
 
 
774 aa  206  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0298  cytochrome P450  31.2 
 
 
392 aa  206  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  31.25 
 
 
380 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  34.1 
 
 
403 aa  200  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  33.77 
 
 
388 aa  199  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  32.56 
 
 
412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  36.75 
 
 
395 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  32.71 
 
 
426 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  33.41 
 
 
405 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  32.03 
 
 
413 aa  193  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  34.34 
 
 
409 aa  193  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  33.95 
 
 
398 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  33.95 
 
 
398 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  32.49 
 
 
412 aa  192  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  32.28 
 
 
401 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  30.91 
 
 
408 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  30.67 
 
 
411 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  33.95 
 
 
398 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  34.37 
 
 
405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  30.35 
 
 
411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  31.17 
 
 
417 aa  189  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  34.47 
 
 
400 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1995  cytochrome P450  34.46 
 
 
417 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228695  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  34.38 
 
 
390 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  31.56 
 
 
403 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  30.23 
 
 
420 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  34.18 
 
 
406 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  34.91 
 
 
409 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  33.99 
 
 
417 aa  186  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  30.32 
 
 
411 aa  186  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2014  cytochrome P450  33.6 
 
 
417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2060  cytochrome P450  33.6 
 
 
417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.340582  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  32.62 
 
 
464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>