More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0361 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0361  cytochrome P450  100 
 
 
406 aa  816    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6896  cytochrome P450  50.38 
 
 
406 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6858  cytochrome P450  44.84 
 
 
409 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.775 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3533  cytochrome P450  41.16 
 
 
398 aa  289  5.0000000000000004e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1743  cytochrome P450  38.44 
 
 
409 aa  277  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1478  cytochrome P450  39.51 
 
 
417 aa  277  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128323  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0514  cytochrome P450  37.16 
 
 
421 aa  266  7e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3682  cytochrome P450  38.29 
 
 
410 aa  261  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2249  cytochrome P450  37.88 
 
 
396 aa  256  5e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.274245  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0872  cytochrome P450  34.37 
 
 
397 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  34.36 
 
 
390 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  33.24 
 
 
397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  31.72 
 
 
421 aa  180  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  33.33 
 
 
418 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4052  cytochrome P450  30.9 
 
 
401 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal  0.478412 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0903  cytochrome P450  29.17 
 
 
425 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0338626  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1274  hypothetical protein  32.19 
 
 
461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  28.54 
 
 
399 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11815  cytochrome P450 143 cyp143  31.61 
 
 
393 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.581255  normal  0.84811 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1929  cytochrome P450  30.21 
 
 
414 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.12886  normal  0.128389 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  28.61 
 
 
399 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3600  cytochrome P450  32.98 
 
 
422 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7140  cytochrome P450 CYP124E1  29.68 
 
 
428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  30.25 
 
 
399 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  29.13 
 
 
398 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  27.45 
 
 
403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4422  cytochrome P450  31.81 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4509  cytochrome P450  31.81 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4803  cytochrome P450  32.06 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173439  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  31.08 
 
 
401 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  27.57 
 
 
399 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1201  cytochrome P450  29.23 
 
 
395 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0703508  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2431  cytochrome P450  28.4 
 
 
424 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  29.55 
 
 
407 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  30.12 
 
 
412 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  31.74 
 
 
412 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  27.95 
 
 
404 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  30.41 
 
 
418 aa  144  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  27.95 
 
 
404 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  27.95 
 
 
404 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  30.97 
 
 
406 aa  143  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4160  cytochrome P450  30.23 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  27.72 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  27.75 
 
 
400 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4983  cytochrome P450  31.03 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  28.57 
 
 
398 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  29.73 
 
 
398 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  32.67 
 
 
426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1995  cytochrome P450  30.03 
 
 
417 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228695  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1062  cytochrome P450  27.95 
 
 
411 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2014  cytochrome P450  29.75 
 
 
417 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2060  cytochrome P450  29.75 
 
 
417 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.340582  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  28.77 
 
 
402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  28.44 
 
 
403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1764  cytochrome P450  31.69 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  27.94 
 
 
417 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2720  cytochrome P450  31.2 
 
 
408 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  26.7 
 
 
411 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  28.75 
 
 
412 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  28.53 
 
 
403 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  29.11 
 
 
418 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  31.12 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  29.33 
 
 
415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7659  cytochrome P450 CYP124E1  30.77 
 
 
412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  26.98 
 
 
411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  28.41 
 
 
417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  27.66 
 
 
418 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  29.72 
 
 
395 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  26.46 
 
 
398 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  28.06 
 
 
398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  28.24 
 
 
392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1259  cytochrome P450  28.78 
 
 
448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.922035  hitchhiker  0.00766496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  29.44 
 
 
395 aa  133  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  27.84 
 
 
396 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  30.03 
 
 
407 aa  133  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  29.92 
 
 
405 aa  133  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  26.7 
 
 
411 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1021  cytochrome P450  30.4 
 
 
415 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0644973 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  28.21 
 
 
388 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3006  linalool 8-monooxygenase  28.49 
 
 
433 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106832 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  30.23 
 
 
404 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1964  cytochrome P450  27.97 
 
 
421 aa  132  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.512147  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  28.31 
 
 
412 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2640  cytochrome P450  28.4 
 
 
425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  28.4 
 
 
401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  29.1 
 
 
409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  26.78 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  29.08 
 
 
427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1777  cytochrome P450  28.46 
 
 
413 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4028  cytochrome P450  29.58 
 
 
392 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7141  cytochrome P450 CYP124E1  28 
 
 
416 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  30.47 
 
 
405 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  28.9 
 
 
398 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1796  cytochrome P450  28.46 
 
 
413 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222543  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  29.08 
 
 
427 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1843  cytochrome P450  28.46 
 
 
413 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.491191  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  29.08 
 
 
427 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  27.35 
 
 
412 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4979  cytochrome P450  25.66 
 
 
406 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  30.21 
 
 
406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>