More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4979 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1768  cytochrome P450  88.37 
 
 
405 aa  742    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4979  cytochrome P450  100 
 
 
406 aa  836    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  35.95 
 
 
407 aa  236  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  35.81 
 
 
418 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  35.83 
 
 
412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1274  hypothetical protein  36.76 
 
 
461 aa  216  8e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  34.81 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  34.42 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  34.85 
 
 
398 aa  212  9e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  33.92 
 
 
399 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  35.11 
 
 
398 aa  209  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  34.52 
 
 
388 aa  193  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1964  cytochrome P450  32.12 
 
 
421 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.512147  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  31.69 
 
 
380 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  33.68 
 
 
403 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  32.63 
 
 
421 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  33.24 
 
 
390 aa  184  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4880  cytochrome P450  30.52 
 
 
450 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0997  cytochrome P450  31.37 
 
 
400 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148456  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  32.04 
 
 
392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  30.85 
 
 
401 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6858  cytochrome P450  30.77 
 
 
409 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  31.17 
 
 
397 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5317  cytochrome P450  31.84 
 
 
451 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1854  cytochrome P450  30.15 
 
 
449 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259336  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  31.81 
 
 
412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1259  cytochrome P450  31.21 
 
 
448 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.922035  hitchhiker  0.00766496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  32.28 
 
 
398 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  31.4 
 
 
399 aa  172  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  30.08 
 
 
411 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  33.85 
 
 
403 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  31.46 
 
 
398 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  29.81 
 
 
417 aa  169  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  29.17 
 
 
410 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  33.23 
 
 
418 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5516  cytochrome P450  27.64 
 
 
429 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4052  cytochrome P450  34.65 
 
 
401 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal  0.478412 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  31.95 
 
 
407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1021  cytochrome P450  31.43 
 
 
415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0644973 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  31.95 
 
 
407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  28.57 
 
 
420 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4936  cytochrome P450  31.39 
 
 
451 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5024  cytochrome P450  31.39 
 
 
451 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  29.7 
 
 
420 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  29.7 
 
 
420 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.60659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  31.12 
 
 
406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1301  cytochrome P450  29.7 
 
 
420 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.559778  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  29.46 
 
 
420 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  32.73 
 
 
404 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  27.56 
 
 
408 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3600  cytochrome P450  30.89 
 
 
422 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2498  cytochrome P450  32.92 
 
 
471 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  27.03 
 
 
418 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3682  cytochrome P450  30.62 
 
 
410 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  31.18 
 
 
396 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  30.13 
 
 
412 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  30.89 
 
 
426 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  30.73 
 
 
405 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5053  cytochrome P450  29.03 
 
 
419 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  30.73 
 
 
405 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  33.7 
 
 
394 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4160  cytochrome P450  33.54 
 
 
456 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  30.6 
 
 
404 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  29.73 
 
 
412 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  30.35 
 
 
404 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7141  cytochrome P450 CYP124E1  33.7 
 
 
416 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  31.27 
 
 
434 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  31.36 
 
 
409 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  30.35 
 
 
404 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  31.65 
 
 
406 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  30.48 
 
 
406 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7140  cytochrome P450 CYP124E1  32.65 
 
 
428 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  30.47 
 
 
408 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  29.6 
 
 
402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  31.02 
 
 
406 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  31.09 
 
 
398 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  29.37 
 
 
407 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  29.77 
 
 
405 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2720  cytochrome P450  27.66 
 
 
408 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  28.68 
 
 
449 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  31.49 
 
 
407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3693  cytochrome P450  32.51 
 
 
457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452097  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3680  cytochrome P450  32.51 
 
 
457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3753  cytochrome P450  32.51 
 
 
457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.821382  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  31.08 
 
 
400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  30.07 
 
 
417 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  29 
 
 
416 aa  154  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  31.49 
 
 
407 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  32.72 
 
 
427 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  31.49 
 
 
407 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  30.91 
 
 
404 aa  154  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  28.29 
 
 
412 aa  153  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  28.65 
 
 
387 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  30.3 
 
 
406 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  28.11 
 
 
403 aa  153  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4131  cytochrome P450  30.08 
 
 
406 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  32.23 
 
 
411 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  30.71 
 
 
398 aa  152  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  29.23 
 
 
398 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  33.25 
 
 
406 aa  152  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>