More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6537 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  80.51 
 
 
395 aa  659    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  100 
 
 
427 aa  872    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  75.51 
 
 
395 aa  630  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  76.46 
 
 
395 aa  627  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  73.79 
 
 
395 aa  597  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  51.27 
 
 
398 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  48.74 
 
 
396 aa  388  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  48.24 
 
 
398 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  49.75 
 
 
399 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  45.27 
 
 
408 aa  368  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  47.99 
 
 
398 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  46.87 
 
 
404 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  46.87 
 
 
404 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  46.87 
 
 
404 aa  354  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  47.1 
 
 
401 aa  349  4e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  47.1 
 
 
401 aa  349  4e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  45.69 
 
 
395 aa  349  5e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  44.81 
 
 
406 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  44.81 
 
 
418 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  44.81 
 
 
406 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  46.62 
 
 
394 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  46.38 
 
 
411 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  46.62 
 
 
394 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  46.85 
 
 
401 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  45.84 
 
 
396 aa  343  5e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  44.84 
 
 
396 aa  341  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  46.23 
 
 
413 aa  336  5e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  45 
 
 
400 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  44.75 
 
 
400 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  44.75 
 
 
400 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  44.47 
 
 
393 aa  332  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  46.46 
 
 
398 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  44.19 
 
 
403 aa  325  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  44.95 
 
 
397 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  44.95 
 
 
397 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  44.95 
 
 
397 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  46.17 
 
 
395 aa  316  4e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  46.46 
 
 
398 aa  312  9e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  43.95 
 
 
402 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  43.95 
 
 
402 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  43.95 
 
 
402 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  42.46 
 
 
387 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  43.54 
 
 
402 aa  293  5e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  42.89 
 
 
405 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  42.89 
 
 
405 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  42.89 
 
 
405 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  42 
 
 
392 aa  289  6e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  43.04 
 
 
402 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  42.68 
 
 
401 aa  286  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  40.9 
 
 
412 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10781  cytochrome P450 123 cyp123  42.78 
 
 
402 aa  279  5e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  41.21 
 
 
405 aa  278  9e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  41.21 
 
 
405 aa  278  9e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  41.21 
 
 
405 aa  278  9e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  41.37 
 
 
400 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  41.37 
 
 
400 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3709  cytochrome P450  41.12 
 
 
400 aa  276  7e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681823  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2479  cytochrome P450  40.36 
 
 
400 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3845  cytochrome P450  40.76 
 
 
414 aa  272  8.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2001  cytochrome P450  39.49 
 
 
405 aa  267  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4175  cytochrome P450  39.24 
 
 
400 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498623  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3437  cytochrome P450  39.34 
 
 
418 aa  259  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.701371 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  39.74 
 
 
405 aa  230  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  38.01 
 
 
412 aa  229  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  36.97 
 
 
390 aa  229  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  35.17 
 
 
774 aa  227  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  38.21 
 
 
398 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  36.48 
 
 
401 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  37.95 
 
 
398 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  37.95 
 
 
398 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  36.13 
 
 
413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4786  cytochrome P450 monooxygenase  37.37 
 
 
335 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  33.59 
 
 
380 aa  216  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  36.03 
 
 
388 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  33 
 
 
420 aa  213  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  36.72 
 
 
409 aa  212  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  38.24 
 
 
403 aa  211  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  36.36 
 
 
406 aa  211  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  34.24 
 
 
405 aa  206  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1201  cytochrome P450  33.84 
 
 
395 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0703508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  36.91 
 
 
399 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  36.01 
 
 
395 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  35.26 
 
 
406 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  35.94 
 
 
404 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0988  cytochrome P450 CYP124E1  38.83 
 
 
414 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0798276  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  34.44 
 
 
407 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  36.06 
 
 
390 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  36.27 
 
 
406 aa  203  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  36.96 
 
 
426 aa  203  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5144  cytochrome P450  36.8 
 
 
409 aa  203  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623851  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  34.18 
 
 
407 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  34.18 
 
 
407 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  33.68 
 
 
399 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  34.7 
 
 
402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  37.15 
 
 
395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1062  cytochrome P450  33.08 
 
 
411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  36.41 
 
 
418 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  42.47 
 
 
1046 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  33.73 
 
 
405 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  37.7 
 
 
406 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>