More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0988 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0988  cytochrome P450 CYP124E1  100 
 
 
414 aa  826    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0798276  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  65.85 
 
 
398 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  65.61 
 
 
398 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  65.61 
 
 
398 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  63.66 
 
 
412 aa  490  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  62.44 
 
 
413 aa  484  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  63.11 
 
 
405 aa  474  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  60.89 
 
 
403 aa  461  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  62.67 
 
 
1046 aa  364  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  39.73 
 
 
392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  36.41 
 
 
404 aa  229  9e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  36.41 
 
 
404 aa  229  9e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  36.41 
 
 
404 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  38.21 
 
 
398 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  38.99 
 
 
398 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  37.57 
 
 
388 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  38.67 
 
 
427 aa  216  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  38.24 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  35.57 
 
 
408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  38.2 
 
 
404 aa  212  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  36.46 
 
 
395 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  36.09 
 
 
405 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  36 
 
 
400 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  36.09 
 
 
405 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  36 
 
 
400 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  36.97 
 
 
395 aa  209  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  36 
 
 
400 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  36.09 
 
 
405 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  36.87 
 
 
409 aa  206  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  35.83 
 
 
413 aa  206  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.87 
 
 
420 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2479  cytochrome P450  34.26 
 
 
400 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  33.58 
 
 
405 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  33.58 
 
 
405 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  33.58 
 
 
405 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  33.95 
 
 
403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  37.23 
 
 
395 aa  201  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  36.6 
 
 
395 aa  200  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  33.77 
 
 
406 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4175  cytochrome P450  33.74 
 
 
400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498623  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  34.95 
 
 
401 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2001  cytochrome P450  35.86 
 
 
405 aa  196  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  37.6 
 
 
395 aa  196  7e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  34.27 
 
 
400 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  34.27 
 
 
400 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  35.2 
 
 
406 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  35.62 
 
 
418 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  35.81 
 
 
398 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  35.2 
 
 
406 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  35.53 
 
 
396 aa  195  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  34.42 
 
 
402 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  34.42 
 
 
402 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  34.66 
 
 
411 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  34.42 
 
 
402 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3709  cytochrome P450  33.76 
 
 
400 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681823  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  33.75 
 
 
402 aa  192  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  34.92 
 
 
395 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  35.29 
 
 
395 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  33.51 
 
 
380 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  34.52 
 
 
400 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  34.86 
 
 
436 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  31.3 
 
 
411 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  35.44 
 
 
412 aa  189  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  33.92 
 
 
398 aa  189  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  33.5 
 
 
423 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  34.16 
 
 
402 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  33.85 
 
 
409 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  33.42 
 
 
402 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  35.19 
 
 
411 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  35.19 
 
 
394 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  33.93 
 
 
417 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  34.22 
 
 
399 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  33.25 
 
 
404 aa  186  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  35.37 
 
 
394 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  29.66 
 
 
411 aa  186  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  31.74 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  29.9 
 
 
411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  29.9 
 
 
411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  35.32 
 
 
387 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  34.38 
 
 
401 aa  184  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3845  cytochrome P450  32.98 
 
 
414 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  34.11 
 
 
407 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  29.66 
 
 
411 aa  183  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  29.66 
 
 
411 aa  183  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  35.66 
 
 
433 aa  183  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  29.66 
 
 
411 aa  182  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  33.68 
 
 
426 aa  182  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  31.23 
 
 
405 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  31.03 
 
 
411 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  32.55 
 
 
408 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  32.98 
 
 
398 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  31.92 
 
 
410 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  32.84 
 
 
401 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  35.66 
 
 
401 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  33.5 
 
 
402 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  33.16 
 
 
405 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  33.03 
 
 
418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  33.84 
 
 
393 aa  180  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  35.09 
 
 
395 aa  180  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  30.61 
 
 
411 aa  179  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>