More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4732 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  100 
 
 
398 aa  810    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  72.82 
 
 
398 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  69.92 
 
 
396 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  65.31 
 
 
408 aa  548  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  63.94 
 
 
399 aa  524  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  61.95 
 
 
398 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  61.62 
 
 
401 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  61.62 
 
 
401 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  61.36 
 
 
401 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  56.12 
 
 
404 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  55.87 
 
 
404 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  55.87 
 
 
404 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  54.89 
 
 
400 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  54.87 
 
 
413 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  57.98 
 
 
397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  57.98 
 
 
397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  54.64 
 
 
400 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  57.98 
 
 
397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  54.99 
 
 
406 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  54.64 
 
 
400 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  54.99 
 
 
406 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  54.99 
 
 
418 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  53.92 
 
 
396 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  55.73 
 
 
396 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  53.03 
 
 
403 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  54.8 
 
 
411 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  54.94 
 
 
394 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  53.9 
 
 
395 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  54.43 
 
 
394 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  52.41 
 
 
393 aa  420  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  49.37 
 
 
395 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  51.27 
 
 
427 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  47.98 
 
 
395 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  48.86 
 
 
395 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  47.85 
 
 
395 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  42.46 
 
 
395 aa  295  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  41.06 
 
 
401 aa  291  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  39.22 
 
 
405 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  39.22 
 
 
405 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  39.22 
 
 
405 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  38.44 
 
 
412 aa  286  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  39.2 
 
 
405 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  39.2 
 
 
405 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  39.2 
 
 
405 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2001  cytochrome P450  39.39 
 
 
405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  38.4 
 
 
398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  38.15 
 
 
398 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  37.5 
 
 
392 aa  260  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2479  cytochrome P450  37.4 
 
 
400 aa  255  8e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3709  cytochrome P450  36.64 
 
 
400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681823  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  36.64 
 
 
400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  36.64 
 
 
400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4175  cytochrome P450  36.11 
 
 
400 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498623  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  36.76 
 
 
402 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  36.76 
 
 
402 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  36.76 
 
 
402 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4786  cytochrome P450 monooxygenase  53.05 
 
 
335 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  37.62 
 
 
774 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  35.24 
 
 
402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10781  cytochrome P450 123 cyp123  36.87 
 
 
402 aa  232  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  35.75 
 
 
402 aa  229  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3437  cytochrome P450  35.01 
 
 
418 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.701371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  37.18 
 
 
409 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1201  cytochrome P450  34.33 
 
 
395 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0703508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  35.26 
 
 
387 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1062  cytochrome P450  33.24 
 
 
411 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  35.09 
 
 
390 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  32.9 
 
 
380 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  33.94 
 
 
388 aa  210  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  33.25 
 
 
396 aa  209  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3845  cytochrome P450  32.67 
 
 
414 aa  207  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  32.85 
 
 
412 aa  206  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  35.04 
 
 
405 aa  203  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  33.84 
 
 
399 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  35.99 
 
 
404 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  32.24 
 
 
420 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  34.01 
 
 
403 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  31.34 
 
 
413 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  34.48 
 
 
406 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  33.82 
 
 
410 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  35.23 
 
 
398 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  30.85 
 
 
411 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  32.32 
 
 
399 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  32.05 
 
 
399 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  31.47 
 
 
408 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  30.08 
 
 
408 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  31.73 
 
 
426 aa  187  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  29.61 
 
 
403 aa  186  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  33.75 
 
 
409 aa  186  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3719  cytochrome P450  32.12 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  32.93 
 
 
414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  34.73 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  31.38 
 
 
404 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3706  cytochrome P450  32.12 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  34.81 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3779  cytochrome P450  32.12 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793715  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  34.81 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  32.55 
 
 
418 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0988  cytochrome P450 CYP124E1  35.81 
 
 
414 aa  182  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0798276  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  31.36 
 
 
398 aa  182  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>