More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3863 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  100 
 
 
408 aa  835    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  70.99 
 
 
398 aa  586  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  69.9 
 
 
396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  67.59 
 
 
399 aa  554  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  65.31 
 
 
398 aa  548  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  57.14 
 
 
404 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  57.39 
 
 
404 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  57.39 
 
 
404 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  59.69 
 
 
398 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  58.79 
 
 
401 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  58.79 
 
 
401 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  58.54 
 
 
401 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  58.98 
 
 
397 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  58.98 
 
 
397 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  58.98 
 
 
397 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  55.31 
 
 
413 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  53.54 
 
 
400 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  53.28 
 
 
400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  53.28 
 
 
400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  55.5 
 
 
396 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  54.36 
 
 
403 aa  450  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  53.47 
 
 
396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  54.22 
 
 
418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  54.22 
 
 
406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  54.22 
 
 
406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  52.44 
 
 
411 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  52.05 
 
 
395 aa  428  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  52.44 
 
 
394 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  52.44 
 
 
394 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  52.06 
 
 
393 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  47.97 
 
 
395 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  44.67 
 
 
395 aa  368  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  45.27 
 
 
427 aa  368  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  45.69 
 
 
395 aa  359  5e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  45.41 
 
 
395 aa  357  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4786  cytochrome P450 monooxygenase  40.97 
 
 
335 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  39.9 
 
 
401 aa  288  8e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  36.59 
 
 
405 aa  275  7e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  36.59 
 
 
405 aa  275  7e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  36.34 
 
 
405 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  38.62 
 
 
395 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  37.19 
 
 
412 aa  270  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  37.63 
 
 
405 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  37.63 
 
 
405 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  37.63 
 
 
405 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2001  cytochrome P450  37.4 
 
 
405 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  37.97 
 
 
402 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  37.97 
 
 
402 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  37.97 
 
 
402 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  36.5 
 
 
392 aa  252  7e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  36.48 
 
 
398 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10781  cytochrome P450 123 cyp123  37.59 
 
 
402 aa  249  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4175  cytochrome P450  34.85 
 
 
400 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498623  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  36.48 
 
 
398 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3709  cytochrome P450  34.53 
 
 
400 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681823  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2479  cytochrome P450  35.04 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  34.27 
 
 
400 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  34.27 
 
 
400 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  36.32 
 
 
402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  35.84 
 
 
402 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3437  cytochrome P450  34.25 
 
 
418 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.701371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  34.28 
 
 
388 aa  216  7e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  32.62 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3845  cytochrome P450  33.49 
 
 
414 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  34.04 
 
 
774 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  32.94 
 
 
426 aa  209  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  33.51 
 
 
390 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  33.83 
 
 
387 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  30.65 
 
 
380 aa  207  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  33.74 
 
 
398 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  33.99 
 
 
398 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  33.99 
 
 
398 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  31.12 
 
 
413 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  34.84 
 
 
406 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  33.15 
 
 
396 aa  196  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  29.72 
 
 
411 aa  196  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  32.38 
 
 
403 aa  196  9e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  29.38 
 
 
411 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  33 
 
 
405 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  33.42 
 
 
409 aa  193  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  29.63 
 
 
408 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  33.08 
 
 
398 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  29.33 
 
 
420 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  33.5 
 
 
414 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3706  cytochrome P450  33.78 
 
 
435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3779  cytochrome P450  33.78 
 
 
435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793715  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3719  cytochrome P450  33.78 
 
 
435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  31.68 
 
 
417 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  32.35 
 
 
407 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  30.17 
 
 
403 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  33.24 
 
 
395 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  29.78 
 
 
411 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  31.19 
 
 
417 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4689  cytochrome P450  33.24 
 
 
444 aa  186  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110488  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  31.77 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0729  putative cytochrome P450  32.06 
 
 
409 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  34.52 
 
 
417 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  34.52 
 
 
407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  34.52 
 
 
407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4149  cytochrome P450  30.18 
 
 
431 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>