More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3778 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  100 
 
 
403 aa  816    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  69.87 
 
 
412 aa  551  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  67.68 
 
 
413 aa  531  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  68.43 
 
 
398 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  68.18 
 
 
398 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  68.18 
 
 
398 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  66.83 
 
 
405 aa  520  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0988  cytochrome P450 CYP124E1  60.89 
 
 
414 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0798276  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  67.22 
 
 
1046 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  39.58 
 
 
392 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  38.68 
 
 
398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  35.35 
 
 
404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  35.35 
 
 
404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  35.35 
 
 
404 aa  236  8e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  38.16 
 
 
398 aa  230  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  39.22 
 
 
405 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  38.14 
 
 
401 aa  229  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  39.22 
 
 
405 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  39.22 
 
 
405 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  36.04 
 
 
400 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  36.04 
 
 
400 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  36.04 
 
 
400 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  38.15 
 
 
404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  36.05 
 
 
388 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  36.02 
 
 
409 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  33.84 
 
 
398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  37.87 
 
 
395 aa  213  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  35.25 
 
 
396 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  35.82 
 
 
405 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  35.82 
 
 
405 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  35.82 
 
 
405 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  38.24 
 
 
427 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4175  cytochrome P450  35.51 
 
 
400 aa  209  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498623  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  37.03 
 
 
395 aa  209  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  34.63 
 
 
400 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  34.63 
 
 
400 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2479  cytochrome P450  34.1 
 
 
400 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3709  cytochrome P450  34.29 
 
 
400 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681823  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  34.93 
 
 
413 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  35.51 
 
 
398 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  35.68 
 
 
401 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  34.98 
 
 
399 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  35.75 
 
 
394 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  37.05 
 
 
412 aa  203  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  35.75 
 
 
394 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  38.24 
 
 
387 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  37.33 
 
 
395 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  34.77 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  33.68 
 
 
403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  34.1 
 
 
396 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  35.5 
 
 
411 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  35.2 
 
 
401 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  35.2 
 
 
401 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  36.15 
 
 
398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  34.69 
 
 
401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  32.97 
 
 
417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  33.88 
 
 
418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  35.19 
 
 
397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  35.19 
 
 
397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  35.19 
 
 
397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2001  cytochrome P450  36.79 
 
 
405 aa  196  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  30.95 
 
 
380 aa  196  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3437  cytochrome P450  37.16 
 
 
418 aa  196  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.701371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  32.38 
 
 
408 aa  196  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  35.9 
 
 
395 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  33.91 
 
 
410 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3845  cytochrome P450  33.41 
 
 
414 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7155  cytochrome P450 CYP124E1  37.12 
 
 
407 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.486175  normal  0.0237063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  34.01 
 
 
398 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  32.41 
 
 
398 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  35.45 
 
 
399 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  33.08 
 
 
414 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  34.5 
 
 
393 aa  193  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  35.99 
 
 
395 aa  193  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  35.86 
 
 
426 aa  193  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  34.96 
 
 
395 aa  193  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  31.88 
 
 
402 aa  192  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  34.46 
 
 
442 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  33.87 
 
 
407 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  34.48 
 
 
412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  33.87 
 
 
407 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  33.42 
 
 
402 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  33.77 
 
 
404 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  33.87 
 
 
407 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  33.16 
 
 
406 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  34.79 
 
 
406 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  33.59 
 
 
396 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10781  cytochrome P450 123 cyp123  33.99 
 
 
402 aa  189  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  33.77 
 
 
404 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  33.77 
 
 
404 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  35.39 
 
 
415 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  30.37 
 
 
410 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  32.83 
 
 
406 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  32.83 
 
 
418 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  32.83 
 
 
406 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  34.57 
 
 
398 aa  187  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  32.51 
 
 
402 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  31.37 
 
 
405 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  36.11 
 
 
406 aa  186  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  31.82 
 
 
401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>