More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1201 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_1062  cytochrome P450  90.63 
 
 
411 aa  753    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0298  cytochrome P450  78.77 
 
 
392 aa  655    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2708  putative cytochrome P450  83.2 
 
 
387 aa  659    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1201  cytochrome P450  100 
 
 
395 aa  814    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0703508  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  62.2 
 
 
396 aa  498  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  38.02 
 
 
398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  37.99 
 
 
392 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  38.29 
 
 
398 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  35.57 
 
 
393 aa  229  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  35.57 
 
 
394 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  35.57 
 
 
411 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  33.42 
 
 
396 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  35.05 
 
 
394 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  34.53 
 
 
395 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  33.85 
 
 
404 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  34.33 
 
 
398 aa  216  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  33.85 
 
 
404 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  33.85 
 
 
404 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  33.24 
 
 
396 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  32.75 
 
 
395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  32.9 
 
 
418 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  32.9 
 
 
406 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  32.9 
 
 
406 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  32.21 
 
 
396 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  35.77 
 
 
774 aa  209  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  33.33 
 
 
398 aa  209  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  35.79 
 
 
401 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  35.79 
 
 
401 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  33.88 
 
 
398 aa  206  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  33.84 
 
 
427 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  35.87 
 
 
405 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  35.87 
 
 
405 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  35.87 
 
 
405 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  35.52 
 
 
401 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  36.57 
 
 
388 aa  203  6e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  33.86 
 
 
395 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  32.07 
 
 
395 aa  199  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  33.51 
 
 
399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  32.04 
 
 
403 aa  193  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  34.37 
 
 
405 aa  192  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  31.52 
 
 
413 aa  192  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  31.54 
 
 
380 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  30.57 
 
 
395 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  32.05 
 
 
395 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  33.15 
 
 
405 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  33.15 
 
 
405 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  33.15 
 
 
405 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  34.97 
 
 
427 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  34.97 
 
 
427 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  34.97 
 
 
427 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  34.11 
 
 
390 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  32.31 
 
 
400 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  33.15 
 
 
390 aa  186  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  32.05 
 
 
400 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  32.05 
 
 
400 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  33.58 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  34.88 
 
 
434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  31.3 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  34.15 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  32.15 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  34.09 
 
 
402 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  32.43 
 
 
412 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  33.6 
 
 
387 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  29.79 
 
 
421 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  29.92 
 
 
408 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  31.55 
 
 
412 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  29.06 
 
 
403 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  33.99 
 
 
409 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  32.4 
 
 
402 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  32.4 
 
 
402 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  32.4 
 
 
402 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  32.14 
 
 
413 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5035  cytochrome P450  32.71 
 
 
424 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854522  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4652  cytochrome P450  32.71 
 
 
424 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4740  cytochrome P450  32.71 
 
 
424 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59592  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  32.43 
 
 
433 aa  177  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  33.25 
 
 
398 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  32.24 
 
 
428 aa  176  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  30.93 
 
 
405 aa  176  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  32.66 
 
 
403 aa  175  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2001  cytochrome P450  33.78 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  31.81 
 
 
406 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10781  cytochrome P450 123 cyp123  31.54 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  32.07 
 
 
407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  32.07 
 
 
407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  32.07 
 
 
407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  31.4 
 
 
407 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  31.74 
 
 
412 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  31.7 
 
 
399 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  32.8 
 
 
412 aa  172  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  31.79 
 
 
397 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  30.48 
 
 
417 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3006  linalool 8-monooxygenase  32.16 
 
 
433 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  31.79 
 
 
397 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  31.44 
 
 
400 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  32.99 
 
 
398 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  31.44 
 
 
400 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  32.99 
 
 
398 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0012  cytochrome P450  31.98 
 
 
422 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  28.53 
 
 
411 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>