More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1062 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1201  cytochrome P450  90.63 
 
 
395 aa  753    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0703508  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1062  cytochrome P450  100 
 
 
411 aa  849    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0298  cytochrome P450  79.8 
 
 
392 aa  660    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2708  putative cytochrome P450  83.94 
 
 
387 aa  657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  62.53 
 
 
396 aa  504  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  38.29 
 
 
398 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  38.84 
 
 
398 aa  233  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  38.46 
 
 
392 aa  229  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  35.06 
 
 
393 aa  224  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  33.42 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  35.06 
 
 
394 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  35.06 
 
 
411 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  34.81 
 
 
394 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  33.24 
 
 
398 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  33.93 
 
 
395 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  32.32 
 
 
396 aa  210  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  32.64 
 
 
404 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  32.64 
 
 
404 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  31.74 
 
 
418 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  32.64 
 
 
404 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  32.57 
 
 
406 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  32.57 
 
 
406 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  32.16 
 
 
396 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  33.25 
 
 
398 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  35.11 
 
 
405 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  35.11 
 
 
405 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  35.11 
 
 
405 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  35.05 
 
 
774 aa  206  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  33.51 
 
 
398 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  34.54 
 
 
401 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  34.54 
 
 
401 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  31.47 
 
 
395 aa  202  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  34.26 
 
 
401 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  33.33 
 
 
395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  33.08 
 
 
427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  32.97 
 
 
399 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  31.79 
 
 
395 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  35.43 
 
 
388 aa  196  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  32.3 
 
 
403 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  34.08 
 
 
390 aa  193  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  31.78 
 
 
413 aa  193  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  32.35 
 
 
380 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  32.63 
 
 
405 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  32.63 
 
 
405 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  32.63 
 
 
405 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  32.22 
 
 
401 aa  189  9e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  33.94 
 
 
405 aa  189  9e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  32.88 
 
 
390 aa  188  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  32 
 
 
412 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  31.79 
 
 
395 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  29.62 
 
 
395 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  34.15 
 
 
401 aa  186  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  32.08 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  31.81 
 
 
400 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  31.81 
 
 
400 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  34.72 
 
 
404 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  35.08 
 
 
427 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  35.08 
 
 
427 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  32.58 
 
 
402 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  35.08 
 
 
427 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  33.86 
 
 
387 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  29.65 
 
 
408 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  32.82 
 
 
407 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  32.82 
 
 
407 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  32.82 
 
 
407 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  31.91 
 
 
412 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10781  cytochrome P450 123 cyp123  31.98 
 
 
402 aa  178  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983786 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  31 
 
 
405 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  33.8 
 
 
434 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  33.07 
 
 
412 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2001  cytochrome P450  33.78 
 
 
405 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  32.82 
 
 
402 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  32.82 
 
 
402 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  32.82 
 
 
402 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  33.05 
 
 
395 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  31.03 
 
 
398 aa  176  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  33.89 
 
 
409 aa  176  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  32.16 
 
 
403 aa  176  9e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  31.81 
 
 
406 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0012  cytochrome P450  31.81 
 
 
422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  31.78 
 
 
433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  29.23 
 
 
403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  29.75 
 
 
421 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4652  cytochrome P450  31.99 
 
 
424 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4740  cytochrome P450  31.99 
 
 
424 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59592  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5035  cytochrome P450  31.99 
 
 
424 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854522  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  32.12 
 
 
398 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  31.79 
 
 
413 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  30.75 
 
 
417 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  31.36 
 
 
399 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12295  cytochrome P450 128 cyp128  30.17 
 
 
489 aa  171  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  31.1 
 
 
400 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  31.1 
 
 
400 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3006  linalool 8-monooxygenase  31.52 
 
 
433 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106832 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  31.67 
 
 
428 aa  170  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  31.79 
 
 
397 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  31.79 
 
 
397 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  31.79 
 
 
397 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  31.82 
 
 
402 aa  170  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  30.11 
 
 
408 aa  169  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>