More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2532 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  100 
 
 
397 aa  815    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  100 
 
 
397 aa  815    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  100 
 
 
397 aa  815    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  68.84 
 
 
401 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  67.68 
 
 
398 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  68.84 
 
 
401 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  68.84 
 
 
401 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  63.04 
 
 
398 aa  518  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  59.54 
 
 
408 aa  510  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  60.41 
 
 
396 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  58.78 
 
 
398 aa  482  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  58.99 
 
 
399 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  52.93 
 
 
404 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  52.93 
 
 
404 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  52.93 
 
 
404 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  52.16 
 
 
396 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  50.13 
 
 
406 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  51.01 
 
 
403 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  50.13 
 
 
418 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  50.63 
 
 
413 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  50.13 
 
 
406 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  48.74 
 
 
400 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  48.48 
 
 
400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  48.48 
 
 
400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  48.98 
 
 
395 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  48.85 
 
 
411 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  48.85 
 
 
394 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  48.6 
 
 
396 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  48.35 
 
 
394 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  48.35 
 
 
393 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  45.57 
 
 
427 aa  347  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  45.06 
 
 
395 aa  347  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  45.32 
 
 
395 aa  343  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  45.43 
 
 
395 aa  342  5e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  45.04 
 
 
395 aa  338  7e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  41.79 
 
 
395 aa  297  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  38.46 
 
 
405 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  38.46 
 
 
405 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  38.46 
 
 
405 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  38.46 
 
 
401 aa  285  8e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  38.46 
 
 
405 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  38.46 
 
 
405 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  38.46 
 
 
405 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  36.57 
 
 
412 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  38.32 
 
 
392 aa  263  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  37.31 
 
 
398 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  38.65 
 
 
402 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  38.65 
 
 
402 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  38.65 
 
 
402 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3709  cytochrome P450  36.52 
 
 
400 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681823  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  37.06 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  36.27 
 
 
400 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  36.27 
 
 
400 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2479  cytochrome P450  36.52 
 
 
400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2001  cytochrome P450  35.7 
 
 
405 aa  250  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4175  cytochrome P450  35.5 
 
 
400 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498623  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10781  cytochrome P450 123 cyp123  38.64 
 
 
402 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983786 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4786  cytochrome P450 monooxygenase  51.83 
 
 
335 aa  244  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  37.68 
 
 
402 aa  244  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  36.66 
 
 
402 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3845  cytochrome P450  33.08 
 
 
414 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  35.97 
 
 
774 aa  216  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  35.37 
 
 
387 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3437  cytochrome P450  34.67 
 
 
418 aa  212  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.701371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  33.08 
 
 
412 aa  210  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  35.58 
 
 
405 aa  209  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  36.58 
 
 
409 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  35.34 
 
 
403 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  34.89 
 
 
396 aa  204  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  36.59 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  34.04 
 
 
398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  32.12 
 
 
380 aa  199  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  33.16 
 
 
413 aa  199  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  33.42 
 
 
399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  33.77 
 
 
398 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  33.77 
 
 
398 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  33.68 
 
 
390 aa  196  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  34.57 
 
 
388 aa  189  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1062  cytochrome P450  32.22 
 
 
411 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1201  cytochrome P450  32.22 
 
 
395 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0703508  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  30.71 
 
 
403 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  32.75 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  33.16 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  33.87 
 
 
417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  28.35 
 
 
411 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  35.84 
 
 
1046 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  32.23 
 
 
426 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  28.28 
 
 
411 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  33.43 
 
 
401 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  28.09 
 
 
411 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  28.87 
 
 
408 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3025  cytochrome P450  30.05 
 
 
391 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  31.36 
 
 
409 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  33 
 
 
398 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1021  cytochrome P450  32.18 
 
 
425 aa  176  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0609813  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  33.33 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1994  cytochrome P450  33.24 
 
 
425 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269689  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  31.95 
 
 
414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2014  cytochrome P450  31.99 
 
 
417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3706  cytochrome P450  30.81 
 
 
435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>