More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4620 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  100 
 
 		 1046 aa  2043    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  56.2 
 
 		 574 aa  592  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  54.58 
 
 		 577 aa  570  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  70.37 
 
 		 405 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  68.11 
 
 		 412 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  69.93 
 
 		 398 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  69.26 
 
 		 398 aa  399  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  69.26 
 
 		 398 aa  399  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  67.22 
 
 		 403 aa  393  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  65.45 
 
 		 413 aa  392  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0988  cytochrome P450 CYP124E1  62.67 
 
 		 414 aa  348  3e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0798276  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10791  hypothetical protein  58.26 
 
 		 259 aa  270  8.999999999999999e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4567  hypothetical protein  53.94 
 
 		 242 aa  244  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4655  hypothetical protein  53.94 
 
 		 242 aa  244  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4950  hypothetical protein  53.94 
 
 		 242 aa  244  7e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.33122  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  41.78 
 
 		 404 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  41.78 
 
 		 404 aa  226  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  41.78 
 
 		 404 aa  226  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  43.49 
 
 		 392 aa  222  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  38.21 
 
 		 398 aa  207  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  42.59 
 
 		 404 aa  207  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  40.96 
 
 		 398 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  37.76 
 
 		 388 aa  200  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  42.03 
 
 		 398 aa  198  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  40.88 
 
 		 395 aa  197  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  41.08 
 
 		 398 aa  197  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  42.47 
 
 		 427 aa  196  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  39.18 
 
 		 413 aa  193  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  40.78 
 
 		 396 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  38.49 
 
 		 403 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  39.46 
 
 		 400 aa  191  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  41.14 
 
 		 395 aa  190  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  41.3 
 
 		 401 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  41.3 
 
 		 401 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  40.56 
 
 		 409 aa  189  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  39.12 
 
 		 400 aa  188  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  39.12 
 
 		 400 aa  188  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  39.67 
 
 		 398 aa  188  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  40.96 
 
 		 401 aa  188  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  41 
 
 		 395 aa  187  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  38.13 
 
 		 402 aa  184  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.58 
 
 		 420 aa  184  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  33.11 
 
 		 410 aa  182  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  35.84 
 
 		 397 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  35.84 
 
 		 397 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  35.84 
 
 		 397 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  38.54 
 
 		 401 aa  181  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  40.14 
 
 		 390 aa  181  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  40.91 
 
 		 400 aa  180  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  36.96 
 
 		 408 aa  180  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  36.73 
 
 		 406 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  37.13 
 
 		 426 aa  179  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  39.74 
 
 		 395 aa  178  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  41.22 
 
 		 450 aa  177  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  39.46 
 
 		 412 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  36.05 
 
 		 405 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  41.61 
 
 		 395 aa  176  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  34.24 
 
 		 411 aa  174  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  36.67 
 
 		 401 aa  174  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  36.18 
 
 		 401 aa  174  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  37.58 
 
 		 394 aa  174  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  37.13 
 
 		 398 aa  174  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  34.01 
 
 		 411 aa  174  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  37.38 
 
 		 394 aa  173  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  34.32 
 
 		 408 aa  173  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  35.71 
 
 		 418 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  40 
 
 		 395 aa  173  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  37.62 
 
 		 399 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  39.53 
 
 		 387 aa  172  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  35.57 
 
 		 411 aa  172  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  37.75 
 
 		 411 aa  172  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  39.24 
 
 		 394 aa  172  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  34.32 
 
 		 405 aa  172  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  31.27 
 
 		 380 aa  172  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  34.32 
 
 		 405 aa  172  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  34.32 
 
 		 405 aa  172  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  37.12 
 
 		 405 aa  171  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  36.93 
 
 		 407 aa  171  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  41.41 
 
 		 409 aa  171  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  38.99 
 
 		 423 aa  171  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  36.39 
 
 		 393 aa  170  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  37.12 
 
 		 405 aa  171  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  37.58 
 
 		 418 aa  170  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  37.12 
 
 		 405 aa  171  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  30.3 
 
 		 411 aa  169  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  37.22 
 
 		 406 aa  170  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  37.22 
 
 		 406 aa  170  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  35.6 
 
 		 410 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  30.2 
 
 		 411 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  33.11 
 
 		 417 aa  168  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  41.11 
 
 		 399 aa  168  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  39.04 
 
 		 395 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  34.15 
 
 		 399 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  30.54 
 
 		 411 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  36.15 
 
 		 408 aa  167  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  30.54 
 
 		 411 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  36.12 
 
 		 406 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  30.2 
 
 		 411 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4028  cytochrome P450  36.58 
 
 		 392 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  36.57 
 
 		 396 aa  167  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>