More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1836 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  86.65 
 
 		 399 aa  716    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  88.16 
 
 		 399 aa  739    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  100 
 
 		 399 aa  823    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  71.36 
 
 		 398 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  73.23 
 
 		 398 aa  587  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  38.56 
 
 		 399 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  38.48 
 
 		 390 aa  258  9e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  37.11 
 
 		 397 aa  252  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  31.74 
 
 		 426 aa  222  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  34.27 
 
 		 407 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  35.67 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4979  cytochrome P450  34.81 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  33.93 
 
 		 418 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  33.76 
 
 		 380 aa  212  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  36.19 
 
 		 388 aa  210  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  35.92 
 
 		 398 aa  209  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1768  cytochrome P450  34.77 
 
 		 405 aa  209  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  34.02 
 
 		 398 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1021  cytochrome P450  33.59 
 
 		 415 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  34.26 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4052  cytochrome P450  36.81 
 
 		 401 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal  0.478412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  32.72 
 
 		 395 aa  203  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  33.84 
 
 		 398 aa  202  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  33.76 
 
 		 392 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0997  cytochrome P450  31.61 
 
 		 400 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148456  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  33.68 
 
 		 427 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  34.7 
 
 		 410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  33.76 
 
 		 398 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  33.59 
 
 		 396 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4028  cytochrome P450  34.99 
 
 		 392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  38.25 
 
 		 403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  31.19 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1964  cytochrome P450  32.12 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.512147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  32.11 
 
 		 395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  29.6 
 
 		 412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  32.98 
 
 		 395 aa  197  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  34.57 
 
 		 418 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  36.36 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  33.25 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  37.58 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  33.59 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4131  cytochrome P450  30.33 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  34.17 
 
 		 412 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  33.06 
 
 		 403 aa  193  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  32.37 
 
 		 395 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  34.12 
 
 		 401 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  34.12 
 
 		 401 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  33.68 
 
 		 398 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  31.37 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.03 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  33.96 
 
 		 401 aa  190  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  32.84 
 
 		 464 aa  189  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6896  cytochrome P450  31.43 
 
 		 406 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  33.86 
 
 		 401 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  36.33 
 
 		 405 aa  189  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11815  cytochrome P450 143 cyp143  34.1 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.581255  normal  0.84811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  32.31 
 
 		 404 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  33.6 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  33.07 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  33.07 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  34.13 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  31.09 
 
 		 411 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  33.07 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  32.47 
 
 		 398 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3682  cytochrome P450  31.89 
 
 		 410 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  36.7 
 
 		 412 aa  187  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  33.6 
 
 		 404 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  33.6 
 
 		 404 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  33.08 
 
 		 436 aa  186  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6858  cytochrome P450  32.3 
 
 		 409 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  31.68 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  33.42 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  31.36 
 
 		 408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  33.42 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0903  cytochrome P450  32.73 
 
 		 425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0338626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  34.41 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  33.42 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  31.22 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  31.42 
 
 		 406 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3533  cytochrome P450  29.84 
 
 		 398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  34.19 
 
 		 404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  31.02 
 
 		 417 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  33.6 
 
 		 402 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  33.51 
 
 		 395 aa  182  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1259  cytochrome P450  31.66 
 
 		 448 aa  182  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.922035  hitchhiker  0.00766496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  32.56 
 
 		 449 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  32.01 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  33.54 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  30.79 
 
 		 410 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  34.36 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2479  cytochrome P450  33.58 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1274  hypothetical protein  31.82 
 
 		 461 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2249  cytochrome P450  30.05 
 
 		 396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.274245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  30.05 
 
 		 405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  30.37 
 
 		 410 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  31.38 
 
 		 405 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2007  cytochrome P450  31.93 
 
 		 404 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  31.62 
 
 		 408 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  35.62 
 
 		 411 aa  179  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4983  cytochrome P450  30.4 
 
 		 387 aa  179  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>