More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6395 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  100 
 
 
399 aa  817    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  67.59 
 
 
408 aa  554  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  68.29 
 
 
398 aa  548  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  64.82 
 
 
396 aa  538  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  63.94 
 
 
398 aa  524  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  60.05 
 
 
398 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  58.4 
 
 
401 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  58.4 
 
 
401 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  55.33 
 
 
404 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  58.4 
 
 
401 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  55.33 
 
 
404 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  55.08 
 
 
404 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  55.7 
 
 
413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  53.92 
 
 
400 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  58.58 
 
 
397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  53.67 
 
 
400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  58.58 
 
 
397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  53.67 
 
 
400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  58.58 
 
 
397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  53.88 
 
 
396 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  54.77 
 
 
396 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  55.19 
 
 
403 aa  433  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  54.14 
 
 
411 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  53 
 
 
418 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  53 
 
 
406 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  54.31 
 
 
394 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  54.57 
 
 
394 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  53 
 
 
406 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  53.55 
 
 
393 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  52.64 
 
 
395 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  49.75 
 
 
427 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  47.87 
 
 
395 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  47.74 
 
 
395 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  46.35 
 
 
395 aa  362  9e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  47.97 
 
 
395 aa  355  8.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4786  cytochrome P450 monooxygenase  43.29 
 
 
335 aa  301  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  42.64 
 
 
395 aa  288  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  38.93 
 
 
401 aa  267  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  38.88 
 
 
398 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  38.46 
 
 
405 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  38.46 
 
 
405 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  38.46 
 
 
405 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  40.05 
 
 
392 aa  260  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  37.75 
 
 
405 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  37.75 
 
 
405 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  37.75 
 
 
405 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  38.27 
 
 
412 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2001  cytochrome P450  38.75 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  38.29 
 
 
398 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10781  cytochrome P450 123 cyp123  38.75 
 
 
402 aa  246  4e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  38.4 
 
 
402 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  38.4 
 
 
402 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  38.4 
 
 
402 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  36.95 
 
 
402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  36.21 
 
 
402 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3709  cytochrome P450  36.05 
 
 
400 aa  235  9e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681823  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  35.8 
 
 
400 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  35.8 
 
 
400 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2479  cytochrome P450  36.14 
 
 
400 aa  230  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3437  cytochrome P450  37.63 
 
 
418 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.701371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4175  cytochrome P450  34.92 
 
 
400 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498623  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  35.92 
 
 
390 aa  216  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  34.92 
 
 
387 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  36.07 
 
 
388 aa  213  7e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  32.82 
 
 
380 aa  209  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  35.58 
 
 
774 aa  209  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3845  cytochrome P450  34.49 
 
 
414 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  33.91 
 
 
412 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1201  cytochrome P450  33.51 
 
 
395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0703508  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1062  cytochrome P450  32.97 
 
 
411 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  35.46 
 
 
405 aa  196  9e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  35.65 
 
 
395 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  35.37 
 
 
398 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  35.45 
 
 
403 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  35.37 
 
 
398 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  35.81 
 
 
401 aa  193  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  35.37 
 
 
398 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  34.32 
 
 
426 aa  193  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  38.92 
 
 
395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  30.28 
 
 
411 aa  189  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  29.53 
 
 
408 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  32.97 
 
 
396 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  33.33 
 
 
413 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  33.86 
 
 
406 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  37.6 
 
 
406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  34.86 
 
 
412 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2708  putative cytochrome P450  33.51 
 
 
387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  30.35 
 
 
411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  34.63 
 
 
410 aa  182  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2003  cytochrome P450  33.5 
 
 
410 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  36.56 
 
 
400 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2020  cytochrome P450  33.17 
 
 
418 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  36.9 
 
 
406 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2066  cytochrome P450  33.5 
 
 
410 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  33.87 
 
 
417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  28.68 
 
 
411 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  34.88 
 
 
409 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  36.34 
 
 
404 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0298  cytochrome P450  30.38 
 
 
392 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3025  cytochrome P450  32.71 
 
 
391 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>