More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2708 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_1062  cytochrome P450  83.94 
 
 
411 aa  684    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0298  cytochrome P450  82.35 
 
 
392 aa  676    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1201  cytochrome P450  83.2 
 
 
395 aa  685    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0703508  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2708  putative cytochrome P450  100 
 
 
387 aa  805    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  62.14 
 
 
396 aa  501  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  38.24 
 
 
398 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  39.17 
 
 
392 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  38.24 
 
 
398 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  35.23 
 
 
404 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  35.23 
 
 
404 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  34.64 
 
 
396 aa  229  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  35.23 
 
 
404 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  34.81 
 
 
393 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  34.97 
 
 
394 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  34.97 
 
 
411 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  34.46 
 
 
394 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  33.33 
 
 
396 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  33.88 
 
 
398 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  32.56 
 
 
396 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  34.95 
 
 
395 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  33.07 
 
 
406 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  33.07 
 
 
406 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  33.07 
 
 
418 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  34.15 
 
 
398 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  35.89 
 
 
401 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  35.89 
 
 
401 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  34.1 
 
 
395 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  33.59 
 
 
427 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  35.62 
 
 
401 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  32.61 
 
 
395 aa  202  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  31.35 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  33.51 
 
 
399 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  35.48 
 
 
774 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  32.17 
 
 
408 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  31.97 
 
 
395 aa  196  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  35.13 
 
 
404 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  34.21 
 
 
390 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  32.31 
 
 
395 aa  192  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  34.01 
 
 
387 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  32.43 
 
 
403 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  30.13 
 
 
395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  34 
 
 
388 aa  189  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  31.35 
 
 
413 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  33.42 
 
 
402 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  30.65 
 
 
400 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  34.84 
 
 
409 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  33.51 
 
 
405 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  33.51 
 
 
405 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  33.51 
 
 
405 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  33.69 
 
 
405 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  33.69 
 
 
405 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  33.69 
 
 
405 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  32.74 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  30.4 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  32.74 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  30.4 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  32.74 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  32.16 
 
 
412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  30.35 
 
 
380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10781  cytochrome P450 123 cyp123  32.4 
 
 
402 aa  182  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983786 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  29.11 
 
 
411 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  31.58 
 
 
412 aa  180  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  32.56 
 
 
405 aa  180  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  30.29 
 
 
401 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  33.6 
 
 
401 aa  179  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  32.66 
 
 
406 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  32.79 
 
 
405 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  29.11 
 
 
411 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  28.61 
 
 
411 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  33.6 
 
 
412 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  32.45 
 
 
398 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  32.05 
 
 
413 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  28.61 
 
 
411 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  28.61 
 
 
403 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  28.35 
 
 
411 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  28.35 
 
 
411 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  31.5 
 
 
411 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  28.35 
 
 
411 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  31.02 
 
 
443 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  28.35 
 
 
411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  31.65 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2001  cytochrome P450  33.42 
 
 
405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  32.15 
 
 
390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  28.61 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  34.51 
 
 
427 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  31.99 
 
 
397 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  31.99 
 
 
397 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  34.51 
 
 
427 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  31.99 
 
 
397 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  34.51 
 
 
427 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  28.35 
 
 
411 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  31.54 
 
 
398 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  31.22 
 
 
408 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  32.44 
 
 
406 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  31.92 
 
 
398 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  33.82 
 
 
434 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  31.49 
 
 
403 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  31.49 
 
 
404 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  30.45 
 
 
402 aa  170  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  31.12 
 
 
407 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>