More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3025 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3025  cytochrome P450  100 
 
 		 391 aa  787    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1225  putative cytochrome P450  39.29 
 
 		 392 aa  281  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0890739  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3393  ferredoxin  38.06 
 
 		 754 aa  264  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0729  putative cytochrome P450  35.14 
 
 		 409 aa  232  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1727  cytochrome P450  36.43 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0767  cytochrome P450  35.5 
 
 		 389 aa  226  7e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000633357 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7683  cytochrome P450 hydroxylase  33.95 
 
 		 405 aa  223  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2077  cytochrome P450  34.28 
 
 		 412 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3613  cytochrome P450  33.25 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235331  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3269  cytochrome P450  33.85 
 
 		 410 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  32.71 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  30.63 
 
 		 404 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  30.63 
 
 		 404 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  31.58 
 
 		 395 aa  172  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  30.63 
 
 		 404 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  31.03 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  30.98 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  30.94 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  30.52 
 
 		 401 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  30.52 
 
 		 401 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  32.78 
 
 		 404 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  30.67 
 
 		 395 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  30.08 
 
 		 395 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  29.7 
 
 		 398 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  29.67 
 
 		 398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  30.27 
 
 		 401 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  30.65 
 
 		 388 aa  166  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  29.76 
 
 		 414 aa  166  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  32.55 
 
 		 464 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  29.97 
 
 		 395 aa  166  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  29.17 
 
 		 418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  29.17 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  29.17 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  30.46 
 
 		 405 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  29.83 
 
 		 397 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  29.83 
 
 		 397 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  29.83 
 
 		 397 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  29.07 
 
 		 398 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  30.25 
 
 		 396 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  27.65 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  31.68 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  29.53 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  28.88 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  30.19 
 
 		 413 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  31.35 
 
 		 395 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  29.9 
 
 		 784 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  29.9 
 
 		 784 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  29.38 
 
 		 794 aa  159  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  27.93 
 
 		 405 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  27.93 
 
 		 405 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  27.93 
 
 		 405 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  29.66 
 
 		 784 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  29.66 
 
 		 784 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  27.65 
 
 		 380 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  30.33 
 
 		 396 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  29.66 
 
 		 784 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  28.08 
 
 		 412 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  29.66 
 
 		 784 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  29.66 
 
 		 784 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  27.53 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  31.84 
 
 		 401 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  28.36 
 
 		 788 aa  155  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  31.94 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  28.86 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  29.66 
 
 		 392 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  29.17 
 
 		 783 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  27.68 
 
 		 412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  31.27 
 
 		 409 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  30.68 
 
 		 390 aa  154  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  31 
 
 		 400 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  31 
 
 		 400 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  31 
 
 		 400 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  29.32 
 
 		 405 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  28.33 
 
 		 399 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  29.19 
 
 		 394 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  26.84 
 
 		 399 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  29.52 
 
 		 394 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  30.67 
 
 		 400 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  26.62 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2825  cytochrome P450  30.79 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  28.85 
 
 		 780 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  27.65 
 
 		 782 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  26.38 
 
 		 405 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  29.87 
 
 		 417 aa  149  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  29.53 
 
 		 408 aa  149  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  28.75 
 
 		 393 aa  149  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  25.31 
 
 		 405 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  25.31 
 
 		 405 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  30.49 
 
 		 774 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  28.01 
 
 		 788 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  26.88 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  31.87 
 
 		 419 aa  146  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  27 
 
 		 411 aa  146  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0603  cytochrome P450  31.46 
 
 		 397 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  27.61 
 
 		 418 aa  145  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  31.2 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  31.86 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  30.86 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  27.98 
 
 		 400 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  29.66 
 
 		 398 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>