More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7683 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7683  cytochrome P450 hydroxylase  100 
 
 		 405 aa  822    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0729  putative cytochrome P450  45.5 
 
 		 409 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2077  cytochrome P450  45.01 
 
 		 412 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3613  cytochrome P450  44.47 
 
 		 410 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235331  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3269  cytochrome P450  42.24 
 
 		 410 aa  339  5e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1727  cytochrome P450  40.16 
 
 		 399 aa  298  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1950  hypothetical protein  34.37 
 
 		 392 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.726447  unclonable  0.000000370327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1225  putative cytochrome P450  35.04 
 
 		 392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0890739  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3025  cytochrome P450  33.95 
 
 		 391 aa  223  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3393  ferredoxin  32.23 
 
 		 754 aa  219  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205639 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0767  cytochrome P450  32.16 
 
 		 389 aa  211  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000633357 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  31.33 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  28.68 
 
 		 412 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  29.9 
 
 		 417 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12295  cytochrome P450 128 cyp128  30.51 
 
 		 489 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  30.1 
 
 		 417 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  28.08 
 
 		 402 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  30.27 
 
 		 399 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  28.75 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  27.71 
 
 		 408 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  27.16 
 
 		 399 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  28.72 
 
 		 405 aa  154  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  30.87 
 
 		 409 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  30.77 
 
 		 409 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  28.46 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  31.02 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  28.86 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  29.6 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  28.14 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  28.53 
 
 		 418 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  27.74 
 
 		 399 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  26.4 
 
 		 411 aa  150  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5525  cytochrome P450  29.72 
 
 		 435 aa  149  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  29.28 
 
 		 403 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  28.46 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  27.76 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  27.79 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  27.59 
 
 		 402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  26.41 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  27.27 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  28.61 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  29.41 
 
 		 412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  28.94 
 
 		 405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  28.53 
 
 		 406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  26.6 
 
 		 407 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  29.86 
 
 		 396 aa  146  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  28.91 
 
 		 424 aa  146  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  29.71 
 
 		 401 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  29.5 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  27.91 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  28.25 
 
 		 410 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  26.2 
 
 		 411 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  28.67 
 
 		 420 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  27.06 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  26.55 
 
 		 407 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  27.27 
 
 		 408 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  27.06 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  26.55 
 
 		 407 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  28.53 
 
 		 409 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  27.06 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  27.61 
 
 		 411 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  28.39 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  28.67 
 
 		 420 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  28.67 
 
 		 420 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.60659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  29.6 
 
 		 426 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  28.42 
 
 		 405 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  28.87 
 
 		 413 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  28.42 
 
 		 405 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  28.42 
 
 		 405 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  29.7 
 
 		 443 aa  143  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  28.91 
 
 		 398 aa  143  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  28.77 
 
 		 396 aa  143  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  29.69 
 
 		 419 aa  142  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  27.59 
 
 		 395 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  30.68 
 
 		 417 aa  142  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  29.46 
 
 		 450 aa  142  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5516  cytochrome P450  29.71 
 
 		 429 aa  142  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  29.33 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  27.4 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2003  cytochrome P450  27.3 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  26.47 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2656  cytochrome P450 family protein  27.7 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  28.9 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1995  cytochrome P450  30.79 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  27.95 
 
 		 398 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  29.02 
 
 		 421 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  25.36 
 
 		 420 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2377  cytochrome P450 family protein  27.27 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3721  cytochrome P450  25.5 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.540203 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  28.57 
 
 		 418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2668  cytochrome P450 family protein  27.98 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061482 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  29.07 
 
 		 417 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2020  cytochrome P450  27.3 
 
 		 418 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2066  cytochrome P450  27.3 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  25.34 
 
 		 380 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  29.26 
 
 		 406 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5053  cytochrome P450  28.4 
 
 		 419 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1994  cytochrome P450  27.68 
 
 		 425 aa  140  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269689  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  29.17 
 
 		 390 aa  140  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2799  cytochrome P450  28.43 
 
 		 409 aa  139  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>