More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4932 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  62.39 
 
 		 775 aa  972    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  74.68 
 
 		 788 aa  1231    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  71.97 
 
 		 784 aa  1154    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  71.97 
 
 		 784 aa  1152    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  80.26 
 
 		 783 aa  1330    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  71.97 
 
 		 784 aa  1151    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  74.05 
 
 		 783 aa  1181    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  71.97 
 
 		 784 aa  1154    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  58.72 
 
 		 769 aa  934    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  74.32 
 
 		 794 aa  1201    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  75.22 
 
 		 782 aa  1258    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  100 
 
 		 780 aa  1611    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  63.14 
 
 		 784 aa  997    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  65.42 
 
 		 788 aa  1080    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  72.49 
 
 		 784 aa  1160    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  71.97 
 
 		 784 aa  1154    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  71.97 
 
 		 784 aa  1154    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  34.49 
 
 		 774 aa  372  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3393  ferredoxin  30.72 
 
 		 754 aa  298  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  46.52 
 
 		 333 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  46.52 
 
 		 333 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  35.9 
 
 		 418 aa  269  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  48.29 
 
 		 328 aa  266  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  43.49 
 
 		 316 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  43.49 
 
 		 316 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  42.86 
 
 		 318 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  45.98 
 
 		 333 aa  254  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  42.48 
 
 		 319 aa  253  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1994  cytochrome P450  34.19 
 
 		 425 aa  253  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269689  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  44.41 
 
 		 316 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  42.39 
 
 		 322 aa  246  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  43.97 
 
 		 321 aa  244  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  41.9 
 
 		 320 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  45.18 
 
 		 315 aa  239  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  40.49 
 
 		 323 aa  237  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  41.21 
 
 		 320 aa  234  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  39.38 
 
 		 322 aa  229  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  43 
 
 		 327 aa  228  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  38.17 
 
 		 1069 aa  224  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  38.89 
 
 		 323 aa  224  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  42.12 
 
 		 321 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  42.12 
 
 		 321 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  38.59 
 
 		 316 aa  222  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  42.77 
 
 		 321 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  38.59 
 
 		 316 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  38.59 
 
 		 316 aa  220  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  38.56 
 
 		 321 aa  220  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5925  ferredoxin  41.75 
 
 		 315 aa  220  8.999999999999998e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0144605  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  38.64 
 
 		 316 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  38.31 
 
 		 318 aa  218  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  39.03 
 
 		 320 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  38.27 
 
 		 322 aa  217  7e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  42.81 
 
 		 331 aa  216  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  39.43 
 
 		 319 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  38.31 
 
 		 316 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40.6 
 
 		 322 aa  214  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  40.25 
 
 		 317 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  40.25 
 
 		 317 aa  214  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  38.85 
 
 		 1070 aa  213  9e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  35.67 
 
 		 326 aa  212  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  39.81 
 
 		 321 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2259  ferredoxin  39.43 
 
 		 315 aa  211  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379114  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2298  ferredoxin  39.43 
 
 		 315 aa  211  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  38.71 
 
 		 321 aa  211  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2306  ferredoxin  39.43 
 
 		 315 aa  211  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.91 
 
 		 316 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  40.13 
 
 		 319 aa  209  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  39.03 
 
 		 315 aa  208  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0888  ferredoxin  40.19 
 
 		 657 aa  207  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.986677  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  39.75 
 
 		 319 aa  206  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  37.93 
 
 		 321 aa  206  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  38.24 
 
 		 321 aa  206  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  37.34 
 
 		 317 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  40.76 
 
 		 321 aa  206  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3213  ferredoxin  37.92 
 
 		 344 aa  205  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289084  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  38.24 
 
 		 334 aa  204  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  38.49 
 
 		 588 aa  204  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3180  ferredoxin  40.13 
 
 		 365 aa  203  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  37.62 
 
 		 321 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  37.11 
 
 		 325 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  36.69 
 
 		 320 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1542  ferredoxin  32.5 
 
 		 330 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  37.3 
 
 		 321 aa  202  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  37.3 
 
 		 321 aa  202  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  37.3 
 
 		 321 aa  201  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  37.3 
 
 		 321 aa  201  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  37.3 
 
 		 321 aa  201  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  39.81 
 
 		 317 aa  200  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  38.14 
 
 		 332 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  38.21 
 
 		 324 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4341  ferredoxin  35.26 
 
 		 379 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  36.99 
 
 		 321 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2905  ferredoxin  37.62 
 
 		 368 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2919  ferredoxin  37.62 
 
 		 368 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  40.57 
 
 		 318 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  39.09 
 
 		 321 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2875  ferredoxin  37.62 
 
 		 368 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555524  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4832  ferredoxin  40.32 
 
 		 309 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000030603  hitchhiker  0.00755842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  38.05 
 
 		 351 aa  198  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  37.22 
 
 		 317 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>