More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3269 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3269  cytochrome P450  100 
 
 
410 aa  825    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2077  cytochrome P450  60.1 
 
 
412 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3613  cytochrome P450  58.67 
 
 
410 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235331  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0729  putative cytochrome P450  60 
 
 
409 aa  478  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7683  cytochrome P450 hydroxylase  42.24 
 
 
405 aa  339  5e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1727  cytochrome P450  44.5 
 
 
399 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1225  putative cytochrome P450  38.56 
 
 
392 aa  269  8e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0890739  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1950  hypothetical protein  36.1 
 
 
392 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.726447  unclonable  0.000000370327 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3393  ferredoxin  35.79 
 
 
754 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0205639 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0767  cytochrome P450  36.84 
 
 
389 aa  224  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000633357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3025  cytochrome P450  33.85 
 
 
391 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  32.56 
 
 
392 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  30.16 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  30.56 
 
 
405 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  32.53 
 
 
414 aa  172  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  30.56 
 
 
405 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  30.56 
 
 
405 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  31.37 
 
 
411 aa  169  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  31.79 
 
 
398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  28.06 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2001  cytochrome P450  29.26 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  28.06 
 
 
411 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  31.89 
 
 
410 aa  163  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  30.95 
 
 
406 aa  163  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  32.56 
 
 
398 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  29.46 
 
 
406 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  27.81 
 
 
396 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  28.32 
 
 
411 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  29.46 
 
 
406 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  29.46 
 
 
418 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  32.1 
 
 
409 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  28.85 
 
 
412 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  30.77 
 
 
436 aa  160  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  29.31 
 
 
396 aa  159  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  29.92 
 
 
395 aa  159  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  30.49 
 
 
398 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  30.38 
 
 
407 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  30.5 
 
 
406 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  30.56 
 
 
399 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  29.87 
 
 
396 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  30.38 
 
 
407 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  30.28 
 
 
395 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  28.61 
 
 
408 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  29.44 
 
 
399 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  30.38 
 
 
407 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  29.95 
 
 
413 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  32.66 
 
 
399 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  30.23 
 
 
412 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  32.25 
 
 
414 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  32.62 
 
 
416 aa  157  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  27.06 
 
 
411 aa  155  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  32.11 
 
 
413 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  28.76 
 
 
403 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  29.49 
 
 
396 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  29.35 
 
 
401 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  29.93 
 
 
405 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  28.61 
 
 
405 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  30.5 
 
 
402 aa  154  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  30.38 
 
 
395 aa  153  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  31.44 
 
 
395 aa  153  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  29.52 
 
 
395 aa  153  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10781  cytochrome P450 123 cyp123  30.5 
 
 
402 aa  152  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  28.94 
 
 
404 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  28.94 
 
 
404 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  30.46 
 
 
398 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  29.03 
 
 
414 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1062  cytochrome P450  28.25 
 
 
411 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  30.26 
 
 
409 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  30.1 
 
 
401 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  28.94 
 
 
404 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  30.1 
 
 
401 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  30.95 
 
 
399 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  30.63 
 
 
426 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  26.79 
 
 
411 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  32.74 
 
 
418 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  29.1 
 
 
402 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  27.58 
 
 
405 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  27.58 
 
 
405 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1201  cytochrome P450  29.41 
 
 
395 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0703508  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  26.85 
 
 
411 aa  150  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  26.85 
 
 
411 aa  150  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2825  cytochrome P450  30.62 
 
 
430 aa  149  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  26.6 
 
 
411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  29.26 
 
 
410 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  30.13 
 
 
405 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  28.5 
 
 
412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  30.9 
 
 
401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  29.97 
 
 
419 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  26.58 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  27.27 
 
 
405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  26.79 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  29.52 
 
 
411 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  27.09 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  28.86 
 
 
407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  26.79 
 
 
411 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  30.99 
 
 
413 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  29.38 
 
 
398 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  29.49 
 
 
417 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  29.46 
 
 
394 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3665  cytochrome P450  26.72 
 
 
411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>