More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1950 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1950  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  811    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.726447  unclonable  0.000000370327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0729  putative cytochrome P450  38.95 
 
 		 409 aa  272  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3269  cytochrome P450  36.1 
 
 		 410 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2077  cytochrome P450  36.69 
 
 		 412 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7683  cytochrome P450 hydroxylase  34.37 
 
 		 405 aa  256  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3613  cytochrome P450  36.27 
 
 		 410 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235331  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1727  cytochrome P450  33.16 
 
 		 399 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1225  putative cytochrome P450  32.64 
 
 		 392 aa  199  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0890739  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0767  cytochrome P450  31.44 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000633357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3393  ferredoxin  27.23 
 
 		 754 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  32.61 
 
 		 447 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  32.61 
 
 		 447 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0020  cytochrome P450  28.03 
 
 		 422 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0467456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  32.61 
 
 		 447 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17810  cytochrome P450  27.95 
 
 		 423 aa  146  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4553  cytochrome P450  30.06 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174977  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1765  cytochrome P450  31.17 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  27.56 
 
 		 417 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  29.34 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3934  cytochrome P450  26.42 
 
 		 421 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.184448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5525  cytochrome P450  29.5 
 
 		 435 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  27.12 
 
 		 414 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1782  cytochrome P450  28.88 
 
 		 417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114444 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3652  cytochrome P450  30.19 
 
 		 431 aa  139  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3694  cytochrome P450  28.84 
 
 		 421 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  30.75 
 
 		 438 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  29.14 
 
 		 401 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  29.14 
 
 		 401 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2720  cytochrome P450  30.86 
 
 		 408 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  29.14 
 
 		 401 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  27.46 
 
 		 401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6660  cytochrome P-450  27.39 
 
 		 423 aa  136  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  31.76 
 
 		 416 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  31.76 
 
 		 416 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  31.76 
 
 		 428 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2377  cytochrome P450 family protein  29.48 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  28.12 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1302  cytochrome P450  31.13 
 
 		 420 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  29.07 
 
 		 409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2656  cytochrome P450 family protein  28.92 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  30.03 
 
 		 464 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  30.05 
 
 		 449 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  27.94 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1803  cytochrome P450  28.12 
 
 		 421 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.677425  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  29.46 
 
 		 403 aa  133  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  30.34 
 
 		 450 aa  133  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7865  cytochrome P450-terp  29.61 
 
 		 433 aa  133  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.790452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  33.13 
 
 		 418 aa  133  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  27.37 
 
 		 388 aa  133  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1951  cytochrome P450  27.59 
 
 		 437 aa  133  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  31.03 
 
 		 406 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  27.85 
 
 		 402 aa  132  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2414  cytochrome P450  30.25 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000201211  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  29.05 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2452  cytochrome P450 family protein  30.25 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252404  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  26.3 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2632  cytochrome P450 family protein  30.25 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  32.72 
 
 		 436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2650  cytochrome P450 family protein  30.25 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000122634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  26.3 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  30 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  26.3 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  29.91 
 
 		 424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  27.49 
 
 		 409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  26.49 
 
 		 418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4592  cytochrome P450  26.37 
 
 		 463 aa  130  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  30.15 
 
 		 443 aa  130  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6659  cytochrome P-450  28.09 
 
 		 431 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0600  cytochrome P450  26.97 
 
 		 470 aa  129  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3593  putative cytochrome P450  27 
 
 		 420 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  27.76 
 
 		 413 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  28.46 
 
 		 398 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  30.82 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  27.18 
 
 		 413 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  27.9 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3025  cytochrome P450  26.25 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5144  cytochrome P450  28.49 
 
 		 409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  29.41 
 
 		 414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  31.79 
 
 		 417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2508  cytochrome P450  28.32 
 
 		 404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0157804  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  28.88 
 
 		 414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2668  cytochrome P450 family protein  28.38 
 
 		 404 aa  127  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061482 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5516  cytochrome P450  28.7 
 
 		 429 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  29.62 
 
 		 408 aa  126  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  28.49 
 
 		 406 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  26.43 
 
 		 405 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  26.43 
 
 		 405 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1994  cytochrome P450  26.1 
 
 		 425 aa  125  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269689  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  26.33 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  29.3 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  28.43 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1782  cytochrome P450  29.66 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  27.69 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1764  cytochrome P450  29.66 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  26.43 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1829  cytochrome P450  29.66 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  27.69 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2659  cytochrome P450 family protein  28.03 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00743758  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4955  cytochrome P450  25.65 
 
 		 411 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  27.9 
 
 		 412 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>