More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1225 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1225  putative cytochrome P450  100 
 
 
392 aa  801    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0890739  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3393  ferredoxin  42.49 
 
 
754 aa  318  7e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0205639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0729  putative cytochrome P450  38.46 
 
 
409 aa  285  9e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3025  cytochrome P450  39.29 
 
 
391 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2077  cytochrome P450  38.87 
 
 
412 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3613  cytochrome P450  38.46 
 
 
410 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235331  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3269  cytochrome P450  38.56 
 
 
410 aa  269  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0767  cytochrome P450  36.22 
 
 
389 aa  256  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000633357 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7683  cytochrome P450 hydroxylase  35.04 
 
 
405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  33.33 
 
 
405 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1727  cytochrome P450  33.68 
 
 
399 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1950  hypothetical protein  32.64 
 
 
392 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.726447  unclonable  0.000000370327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  31.2 
 
 
380 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  33.67 
 
 
398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  33.42 
 
 
406 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  33.25 
 
 
406 aa  182  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  31.83 
 
 
411 aa  182  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  31.07 
 
 
392 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  32.82 
 
 
398 aa  179  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  28.64 
 
 
411 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  29.9 
 
 
399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  33.66 
 
 
400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  30.29 
 
 
405 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  30.29 
 
 
405 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  30.29 
 
 
405 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  28.42 
 
 
411 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  31.66 
 
 
401 aa  171  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  32.74 
 
 
395 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  29.24 
 
 
401 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2656  cytochrome P450 family protein  29.47 
 
 
404 aa  170  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  29.2 
 
 
783 aa  170  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1994  cytochrome P450  28.64 
 
 
425 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2668  cytochrome P450 family protein  29.72 
 
 
404 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  30.05 
 
 
419 aa  169  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  28.17 
 
 
411 aa  169  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  28.17 
 
 
411 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  32.22 
 
 
409 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  27.59 
 
 
420 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  27.91 
 
 
411 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  27.91 
 
 
411 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3706  cytochrome P450  30.93 
 
 
435 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3779  cytochrome P450  30.93 
 
 
435 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793715  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  29.57 
 
 
412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  31.53 
 
 
417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  27.65 
 
 
411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  27.91 
 
 
411 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  27.91 
 
 
411 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  31.11 
 
 
405 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  31.11 
 
 
405 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  31.76 
 
 
399 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  31.11 
 
 
405 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3709  cytochrome P450  30.65 
 
 
400 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681823  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3719  cytochrome P450  30.7 
 
 
435 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4175  cytochrome P450  30.63 
 
 
400 aa  166  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498623  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  27.32 
 
 
411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  28.57 
 
 
403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  31.34 
 
 
417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  31.65 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2377  cytochrome P450 family protein  29.65 
 
 
404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  28.72 
 
 
782 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  27.06 
 
 
411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  30.65 
 
 
400 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  31.65 
 
 
408 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  30.65 
 
 
400 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  31.36 
 
 
447 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  29.64 
 
 
395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  30.2 
 
 
404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  30.2 
 
 
404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  30 
 
 
426 aa  163  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  30.2 
 
 
404 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  30.69 
 
 
412 aa  163  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  32.5 
 
 
398 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2659  cytochrome P450 family protein  28.75 
 
 
404 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00743758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  29.24 
 
 
410 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2414  cytochrome P450  28.72 
 
 
404 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000201211  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  29.16 
 
 
788 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  31.44 
 
 
398 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  31.94 
 
 
405 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  30.54 
 
 
407 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  28.39 
 
 
794 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  30.15 
 
 
780 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  28.81 
 
 
388 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3692  cytochrome P450  28.57 
 
 
433 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220019  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0619  cytochrome P450  29.97 
 
 
423 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0632  cytochrome P450  29.97 
 
 
423 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0610  cytochrome P450  29.97 
 
 
423 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537348  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2479  cytochrome P450  28.84 
 
 
400 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  30.48 
 
 
417 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  29.67 
 
 
396 aa  159  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  29.2 
 
 
408 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2508  cytochrome P450  28.5 
 
 
404 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0157804  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  29.62 
 
 
402 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  30.77 
 
 
396 aa  159  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  31.81 
 
 
395 aa  159  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  31.3 
 
 
396 aa  159  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  31 
 
 
412 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  31.7 
 
 
411 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  30.41 
 
 
418 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  29.57 
 
 
418 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  31.79 
 
 
413 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>