More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2279 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  100 
 
 
398 aa  814    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  86.93 
 
 
398 aa  688    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  73.05 
 
 
399 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  72.29 
 
 
399 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  71.36 
 
 
399 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  37.24 
 
 
397 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  38.12 
 
 
390 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  38.62 
 
 
399 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  33.76 
 
 
421 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4052  cytochrome P450  36.96 
 
 
401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal  0.478412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  33.92 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4979  cytochrome P450  35.35 
 
 
406 aa  210  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1768  cytochrome P450  35.32 
 
 
405 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  38.31 
 
 
403 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0997  cytochrome P450  32.82 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148456  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  34.32 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  32.51 
 
 
418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  32.22 
 
 
380 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4131  cytochrome P450  30.39 
 
 
406 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  31.76 
 
 
395 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  33.7 
 
 
418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.62 
 
 
420 aa  189  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  31.36 
 
 
398 aa  189  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  33.59 
 
 
399 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6858  cytochrome P450  32.87 
 
 
409 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1964  cytochrome P450  30.56 
 
 
421 aa  186  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.512147  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  31.15 
 
 
395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  33.92 
 
 
412 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  32.19 
 
 
427 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  31.57 
 
 
398 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1274  hypothetical protein  32.32 
 
 
461 aa  183  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  30.15 
 
 
406 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  29.44 
 
 
426 aa  182  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  32.22 
 
 
392 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4983  cytochrome P450  31.2 
 
 
387 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  30.99 
 
 
410 aa  179  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  31.04 
 
 
396 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11815  cytochrome P450 143 cyp143  33.62 
 
 
393 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.581255  normal  0.84811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  32.32 
 
 
398 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  34.63 
 
 
405 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1021  cytochrome P450  30.69 
 
 
415 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0644973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  31.19 
 
 
406 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  32.02 
 
 
401 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3682  cytochrome P450  32.48 
 
 
410 aa  176  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  32.02 
 
 
401 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6896  cytochrome P450  29.17 
 
 
406 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  31.23 
 
 
395 aa  176  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1764  cytochrome P450  31.62 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  30.96 
 
 
409 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  30.17 
 
 
408 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  30.94 
 
 
443 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  32.58 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  30.43 
 
 
400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3533  cytochrome P450  31.41 
 
 
398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  32.4 
 
 
398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  31.76 
 
 
401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  29.87 
 
 
412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  30 
 
 
390 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  30.1 
 
 
398 aa  173  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  29.97 
 
 
395 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  34.15 
 
 
400 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0903  cytochrome P450  32.62 
 
 
425 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0338626  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  32.05 
 
 
417 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  34.82 
 
 
400 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  31.06 
 
 
411 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  31.78 
 
 
395 aa  170  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  31.77 
 
 
403 aa  170  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0872  cytochrome P450  29.79 
 
 
397 aa  170  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  31.63 
 
 
464 aa  169  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  30.99 
 
 
401 aa  169  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  34.39 
 
 
411 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1259  cytochrome P450  30.92 
 
 
448 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.922035  hitchhiker  0.00766496 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  30.56 
 
 
402 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  29.95 
 
 
405 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4422  cytochrome P450  30.46 
 
 
394 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  30.91 
 
 
404 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4509  cytochrome P450  30.46 
 
 
394 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3832  cytochrome P450  31.11 
 
 
396 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0796027  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  31.13 
 
 
406 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  31.12 
 
 
404 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  31.5 
 
 
397 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  30.99 
 
 
405 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  31.12 
 
 
404 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  30.91 
 
 
404 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  31.5 
 
 
397 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  31.58 
 
 
395 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  31.5 
 
 
397 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  30.99 
 
 
405 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  31.12 
 
 
404 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  30.91 
 
 
404 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  31.38 
 
 
402 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  29.59 
 
 
412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  29.38 
 
 
398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  31.52 
 
 
405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4028  cytochrome P450  32.39 
 
 
392 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3709  cytochrome P450  30.5 
 
 
400 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681823  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5317  cytochrome P450  29.88 
 
 
451 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4803  cytochrome P450  30.46 
 
 
394 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173439  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  32.72 
 
 
398 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  31.58 
 
 
449 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>