More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6858 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  100 
 
 
412 aa  844    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  62.28 
 
 
418 aa  525  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  57.43 
 
 
407 aa  475  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1274  hypothetical protein  35.96 
 
 
461 aa  224  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1768  cytochrome P450  35.85 
 
 
405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1964  cytochrome P450  31.65 
 
 
421 aa  223  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.512147  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4131  cytochrome P450  31.63 
 
 
406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4979  cytochrome P450  35.83 
 
 
406 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  35.48 
 
 
390 aa  217  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  35.49 
 
 
399 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  35.09 
 
 
380 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  34.48 
 
 
401 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  33.15 
 
 
397 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  31.19 
 
 
399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  32.42 
 
 
421 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  36.44 
 
 
392 aa  192  9e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1021  cytochrome P450  33.84 
 
 
415 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0644973 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6896  cytochrome P450  30.89 
 
 
406 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  30.96 
 
 
412 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  30.2 
 
 
399 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4880  cytochrome P450  31.77 
 
 
450 aa  186  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  30.45 
 
 
399 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6858  cytochrome P450  31.64 
 
 
409 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.775 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  32.56 
 
 
398 aa  184  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  30.56 
 
 
398 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0997  cytochrome P450  29.97 
 
 
400 aa  183  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148456  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3832  cytochrome P450  33.33 
 
 
396 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0796027  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4141  cytochrome P450  30.68 
 
 
394 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  33.42 
 
 
402 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  34.72 
 
 
400 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  33.43 
 
 
388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  33.87 
 
 
404 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  35 
 
 
406 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  34.05 
 
 
411 aa  179  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  31.94 
 
 
417 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  32.29 
 
 
403 aa  179  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0903  cytochrome P450  34.8 
 
 
425 aa  179  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0338626  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  33.6 
 
 
404 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  33.6 
 
 
404 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  32.87 
 
 
406 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  33.72 
 
 
396 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  30.58 
 
 
398 aa  178  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  32.13 
 
 
411 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  32.82 
 
 
411 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  31.88 
 
 
411 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  31.88 
 
 
411 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  33.07 
 
 
404 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  31.43 
 
 
411 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  32.49 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  32.15 
 
 
418 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  33.63 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  31.43 
 
 
411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  33.51 
 
 
411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  31.36 
 
 
411 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  32.04 
 
 
403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  33.66 
 
 
418 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  31.11 
 
 
411 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1259  cytochrome P450  30.86 
 
 
448 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.922035  hitchhiker  0.00766496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5317  cytochrome P450  29.95 
 
 
451 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  33.87 
 
 
399 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  30.77 
 
 
411 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2579  cytochrome P450  33.72 
 
 
386 aa  172  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  29.7 
 
 
398 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  33.33 
 
 
409 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1854  cytochrome P450  31.28 
 
 
449 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259336  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  31.01 
 
 
402 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  31.52 
 
 
415 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  31.15 
 
 
774 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4052  cytochrome P450  31.87 
 
 
401 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal  0.478412 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  32.28 
 
 
410 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  32.14 
 
 
427 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  36.34 
 
 
395 aa  170  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  32.14 
 
 
427 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  30.5 
 
 
398 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  32.14 
 
 
427 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  29.35 
 
 
447 aa  169  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  30.53 
 
 
387 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5516  cytochrome P450  31.39 
 
 
429 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1995  cytochrome P450  30.81 
 
 
417 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228695  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4936  cytochrome P450  29.9 
 
 
451 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5024  cytochrome P450  29.9 
 
 
451 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  30.46 
 
 
418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  33.62 
 
 
407 aa  167  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3226  cytochrome P450  33.14 
 
 
386 aa  167  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.787623  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  34.52 
 
 
408 aa  167  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0388  heme-thiolate monooxygenase, putative  30.26 
 
 
387 aa  166  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3682  cytochrome P450  31.2 
 
 
410 aa  167  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  31.3 
 
 
427 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1895  cytochrome P450  27.32 
 
 
384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  29.64 
 
 
424 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  32.29 
 
 
395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  31.83 
 
 
395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  30.94 
 
 
401 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  32.31 
 
 
406 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  31.25 
 
 
434 aa  166  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  31.04 
 
 
433 aa  166  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  29.84 
 
 
414 aa  166  9e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  30.62 
 
 
442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  31.12 
 
 
417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  30.29 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>