More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5516 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5516  cytochrome P450  100 
 
 		 429 aa  889    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  45.24 
 
 		 418 aa  388  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  46.21 
 
 		 418 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  42.52 
 
 		 424 aa  351  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  44.1 
 
 		 416 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  44.1 
 
 		 416 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  44.1 
 
 		 428 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  42.69 
 
 		 412 aa  335  9e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  42.75 
 
 		 420 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  42.75 
 
 		 420 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.60659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  42.75 
 
 		 420 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  42.93 
 
 		 412 aa  332  5e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5053  cytochrome P450  42.51 
 
 		 419 aa  333  5e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7865  cytochrome P450-terp  40.94 
 
 		 433 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.790452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1302  cytochrome P450  43.24 
 
 		 420 aa  328  8e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  43.07 
 
 		 416 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1301  cytochrome P450  41.03 
 
 		 420 aa  325  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.559778  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1777  cytochrome P450  41.83 
 
 		 413 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1796  cytochrome P450  41.83 
 
 		 413 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1843  cytochrome P450  41.83 
 
 		 413 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.491191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  41.5 
 
 		 449 aa  316  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2720  cytochrome P450  41 
 
 		 408 aa  315  7e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7766  cytochrome P450  40.14 
 
 		 430 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3069  cytochrome P450  38.55 
 
 		 422 aa  302  9e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  41.25 
 
 		 428 aa  296  7e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3162  cytochrome P450  39.47 
 
 		 430 aa  265  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.394046  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  35.7 
 
 		 414 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  34.75 
 
 		 417 aa  230  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  35.19 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  34.06 
 
 		 418 aa  227  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  33.1 
 
 		 415 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  33.93 
 
 		 412 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  34.67 
 
 		 406 aa  222  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  35.28 
 
 		 414 aa  221  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  34.24 
 
 		 415 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  35.15 
 
 		 401 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  34.05 
 
 		 428 aa  216  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5035  cytochrome P450  33.33 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4652  cytochrome P450  33.33 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4740  cytochrome P450  33.33 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3006  linalool 8-monooxygenase  33.25 
 
 		 433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.106832 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  34.04 
 
 		 427 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  34.04 
 
 		 427 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  34.04 
 
 		 427 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0020  cytochrome P450  33.25 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0467456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  35.61 
 
 		 434 aa  210  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2991  linalool 8-monooxygenase  32.78 
 
 		 433 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3035  linalool 8-monooxygenase  32.78 
 
 		 433 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  33.75 
 
 		 414 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  32.93 
 
 		 417 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  34.05 
 
 		 433 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0012  cytochrome P450  32.86 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  32.78 
 
 		 442 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  33.75 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3721  cytochrome P450  29.04 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.540203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5258  cytochrome P450  32.78 
 
 		 419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1508  cytochrome P450  33.01 
 
 		 420 aa  199  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4948  cytochrome P450  32.43 
 
 		 402 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3593  putative cytochrome P450  31.81 
 
 		 420 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4565  cytochrome P450  31.93 
 
 		 402 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  31.01 
 
 		 401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4653  cytochrome P450  31.93 
 
 		 402 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.974362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  32.44 
 
 		 408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5301  cytochrome P450  33.41 
 
 		 418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.717822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0813  cytochrome P450  31.15 
 
 		 427 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  34.1 
 
 		 404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5062  cytochrome P450  33.02 
 
 		 427 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268876  normal  0.872733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4677  cytochrome P450  33.02 
 
 		 427 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4763  cytochrome P450  33.02 
 
 		 427 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13578  cytochrome P450 125 cyp125  32.34 
 
 		 433 aa  196  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0110795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1995  cytochrome P450  32.33 
 
 		 417 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4592  cytochrome P450  30.94 
 
 		 463 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  33.5 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1951  cytochrome P450  32.13 
 
 		 437 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94104 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0759  cytochrome P450  31.7 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2786  cytochrome P450  32.49 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00511123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2014  cytochrome P450  32.33 
 
 		 417 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2060  cytochrome P450  32.33 
 
 		 417 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.340582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1803  cytochrome P450  32.91 
 
 		 421 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.677425  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  32.91 
 
 		 409 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1765  cytochrome P450  32.14 
 
 		 421 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2917  cytochrome P450 family protein  29.07 
 
 		 418 aa  192  7e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.136725 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4955  cytochrome P450  30.22 
 
 		 411 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5144  cytochrome P450  33.17 
 
 		 409 aa  192  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4572  cytochrome P450  30.87 
 
 		 411 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347976  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  33.82 
 
 		 447 aa  192  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4660  cytochrome P450  30.87 
 
 		 411 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.026328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5151  cytochrome P450  31.12 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3229  cytochrome P450  30.5 
 
 		 462 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1782  cytochrome P450  31.79 
 
 		 417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3218  cytochrome P450  30.5 
 
 		 462 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.232743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3280  cytochrome P450  30.5 
 
 		 462 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6660  cytochrome P-450  31.17 
 
 		 423 aa  190  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6659  cytochrome P-450  30.15 
 
 		 431 aa  190  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1607  cytochrome P450  29.98 
 
 		 414 aa  190  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3694  cytochrome P450  31.97 
 
 		 421 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0773  putative cytochrome P450  30.9 
 
 		 416 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  0.121605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4264  cytochrome P450  31.71 
 
 		 421 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0600  cytochrome P450  31.41 
 
 		 470 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  30.02 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>