More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3694 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_3934  cytochrome P450  94.3 
 
 
421 aa  833    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.184448  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4264  cytochrome P450  84.09 
 
 
421 aa  756    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3694  cytochrome P450  100 
 
 
421 aa  872    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1803  cytochrome P450  90.74 
 
 
421 aa  800    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.677425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6660  cytochrome P-450  77.8 
 
 
423 aa  684    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388051  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6659  cytochrome P-450  67.14 
 
 
431 aa  584  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337384  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0020  cytochrome P450  67.08 
 
 
422 aa  554  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0467456  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1765  cytochrome P450  62.8 
 
 
421 aa  539  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5301  cytochrome P450  63.46 
 
 
418 aa  527  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.717822  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0025  cytochrome P450  62.68 
 
 
422 aa  521  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498673  normal  0.104962 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2128  cytochrome P450  61.12 
 
 
423 aa  506  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1782  cytochrome P450  58.37 
 
 
417 aa  498  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.114444 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5296  cytochrome P450  58.47 
 
 
422 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1951  cytochrome P450  52.74 
 
 
437 aa  433  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.94104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3593  putative cytochrome P450  50.5 
 
 
420 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0600  cytochrome P450  50.75 
 
 
470 aa  395  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4592  cytochrome P450  49.27 
 
 
463 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3218  cytochrome P450  51.01 
 
 
462 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.232743  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3229  cytochrome P450  51.01 
 
 
462 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29754  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3280  cytochrome P450  51.01 
 
 
462 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.692519  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0220  cytochrome P450  48.35 
 
 
445 aa  359  5e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2865  linalool 8-monooxygenase  46.34 
 
 
418 aa  355  5.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.961693  normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1821  cytochrome P450  44.97 
 
 
410 aa  318  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  41.21 
 
 
417 aa  283  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0759  cytochrome P450  35.26 
 
 
403 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  35.21 
 
 
415 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  34.65 
 
 
414 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  33.17 
 
 
414 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  36.18 
 
 
404 aa  207  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  33.86 
 
 
401 aa  206  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  32.15 
 
 
418 aa  206  9e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  31.49 
 
 
424 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  30.91 
 
 
418 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5062  cytochrome P450  33.25 
 
 
427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268876  normal  0.872733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1508  cytochrome P450  32.99 
 
 
420 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4677  cytochrome P450  33.25 
 
 
427 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4763  cytochrome P450  33.25 
 
 
427 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5258  cytochrome P450  33.51 
 
 
419 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  31.34 
 
 
420 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  31.34 
 
 
420 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.60659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  31.34 
 
 
420 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  35.37 
 
 
409 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1301  cytochrome P450  30.85 
 
 
420 aa  192  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.559778  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  31.44 
 
 
416 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1796  cytochrome P450  31.34 
 
 
413 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222543  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1777  cytochrome P450  31.34 
 
 
413 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  31.4 
 
 
418 aa  190  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1843  cytochrome P450  31.34 
 
 
413 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.491191  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5053  cytochrome P450  30.98 
 
 
419 aa  189  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2786  cytochrome P450  33.08 
 
 
422 aa  189  8e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00511123  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5516  cytochrome P450  31.97 
 
 
429 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7865  cytochrome P450-terp  28.88 
 
 
433 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.790452  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  32.04 
 
 
406 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  30.2 
 
 
428 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  30.2 
 
 
416 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  30.2 
 
 
416 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  31.25 
 
 
447 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  31.85 
 
 
412 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5144  cytochrome P450  33.06 
 
 
409 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623851  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1302  cytochrome P450  30.55 
 
 
420 aa  186  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  32.73 
 
 
406 aa  186  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  30.69 
 
 
401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1670  cytochrome P450  30.58 
 
 
455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0452772  normal  0.0820261 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  31.41 
 
 
388 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0012  cytochrome P450  34.51 
 
 
422 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  32.16 
 
 
434 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  33.58 
 
 
414 aa  184  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  30 
 
 
412 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  31.46 
 
 
433 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4565  cytochrome P450  31.56 
 
 
402 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7155  cytochrome P450 CYP124E1  33.16 
 
 
407 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.486175  normal  0.0237063 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4653  cytochrome P450  31.56 
 
 
402 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.974362  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  31.65 
 
 
427 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  31.7 
 
 
427 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  31.7 
 
 
427 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4948  cytochrome P450  31.56 
 
 
402 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169294 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  31.65 
 
 
442 aa  180  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  31.35 
 
 
400 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2722  cytochrome P450  30.63 
 
 
407 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5035  cytochrome P450  33.92 
 
 
424 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854522  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4652  cytochrome P450  33.92 
 
 
424 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4740  cytochrome P450  33.92 
 
 
424 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59592  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3012  cytochrome P450  32.6 
 
 
419 aa  176  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.839799  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3425  cytochrome P450  32.56 
 
 
421 aa  176  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3721  cytochrome P450  30.36 
 
 
419 aa  176  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.540203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2723  putative cytochrome P450  32.77 
 
 
423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.538168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2767  putative cytochrome P450  32.77 
 
 
423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.052524  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  30.92 
 
 
417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2753  putative cytochrome P450  32.77 
 
 
423 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  0.16215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  30.18 
 
 
402 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  29.74 
 
 
428 aa  173  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13578  cytochrome P450 125 cyp125  30.57 
 
 
433 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0110795 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2917  cytochrome P450 family protein  29.77 
 
 
418 aa  172  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.136725 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  32.05 
 
 
408 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1995  cytochrome P450  31.03 
 
 
417 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228695  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2739  cytochrome P450 CYP125  35.09 
 
 
413 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.251289  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0773  putative cytochrome P450  30.14 
 
 
416 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  0.121605 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1021  cytochrome P450  31.13 
 
 
425 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0609813  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  30.64 
 
 
428 aa  170  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7254  cytochrome P450  31.64 
 
 
431 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>