More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1951 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1951  cytochrome P450  100 
 
 
437 aa  903    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.94104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1782  cytochrome P450  58.81 
 
 
417 aa  482  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.114444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0020  cytochrome P450  58.31 
 
 
422 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0467456  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1765  cytochrome P450  58.74 
 
 
421 aa  478  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2128  cytochrome P450  56.76 
 
 
423 aa  470  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6660  cytochrome P-450  52.89 
 
 
423 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388051  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0025  cytochrome P450  56.34 
 
 
422 aa  455  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498673  normal  0.104962 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5301  cytochrome P450  56.02 
 
 
418 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.717822  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3934  cytochrome P450  53.45 
 
 
421 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.184448  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1803  cytochrome P450  53.55 
 
 
421 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.677425  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3694  cytochrome P450  52.74 
 
 
421 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6659  cytochrome P-450  51.09 
 
 
431 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337384  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4264  cytochrome P450  52.22 
 
 
421 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0600  cytochrome P450  48.93 
 
 
470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5296  cytochrome P450  51.41 
 
 
422 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3593  putative cytochrome P450  50.12 
 
 
420 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3229  cytochrome P450  48.67 
 
 
462 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29754  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3218  cytochrome P450  48.67 
 
 
462 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.232743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3280  cytochrome P450  48.67 
 
 
462 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.692519  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4592  cytochrome P450  49.39 
 
 
463 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2865  linalool 8-monooxygenase  44.28 
 
 
418 aa  341  2e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.961693  normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0220  cytochrome P450  42.65 
 
 
445 aa  333  4e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  44.94 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1821  cytochrome P450  40.99 
 
 
410 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  36.21 
 
 
414 aa  249  7e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0759  cytochrome P450  37.37 
 
 
403 aa  242  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  33.02 
 
 
415 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  33.09 
 
 
414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  32.3 
 
 
447 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7865  cytochrome P450-terp  28.87 
 
 
433 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.790452  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  31.49 
 
 
424 aa  210  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  34.24 
 
 
404 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  32.54 
 
 
427 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  32.54 
 
 
427 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  32.54 
 
 
427 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  32.74 
 
 
433 aa  207  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  31.82 
 
 
434 aa  206  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1670  cytochrome P450  32.49 
 
 
455 aa  206  9e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0452772  normal  0.0820261 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  31.88 
 
 
418 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  33.25 
 
 
409 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3721  cytochrome P450  33.73 
 
 
419 aa  202  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.540203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  32.04 
 
 
401 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  30.83 
 
 
418 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2786  cytochrome P450  32.76 
 
 
422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00511123  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5516  cytochrome P450  32.13 
 
 
429 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  30.71 
 
 
395 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  31.27 
 
 
400 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  29.34 
 
 
428 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  29.34 
 
 
416 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  29.34 
 
 
416 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  31.46 
 
 
428 aa  193  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  32.55 
 
 
406 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4955  cytochrome P450  31.62 
 
 
411 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  31.41 
 
 
418 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4572  cytochrome P450  31.62 
 
 
411 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4660  cytochrome P450  31.62 
 
 
411 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.026328  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1302  cytochrome P450  29.34 
 
 
420 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  32.82 
 
 
414 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2917  cytochrome P450 family protein  31.03 
 
 
418 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.136725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  30.56 
 
 
412 aa  187  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4948  cytochrome P450  31.89 
 
 
402 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169294 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4565  cytochrome P450  32.12 
 
 
402 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4653  cytochrome P450  32.12 
 
 
402 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.974362  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5258  cytochrome P450  33.25 
 
 
419 aa  186  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3006  linalool 8-monooxygenase  30.79 
 
 
433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  28.85 
 
 
402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2739  cytochrome P450 CYP125  34.25 
 
 
413 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.251289  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  30.37 
 
 
404 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1508  cytochrome P450  32.72 
 
 
420 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1301  cytochrome P450  30.71 
 
 
420 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.559778  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2991  linalool 8-monooxygenase  30.79 
 
 
433 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3035  linalool 8-monooxygenase  30.79 
 
 
433 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  30.5 
 
 
417 aa  183  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  30.1 
 
 
404 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  30.1 
 
 
404 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  29.84 
 
 
403 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5151  cytochrome P450  30.23 
 
 
410 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  29.4 
 
 
420 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2640  cytochrome P450  33.97 
 
 
425 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  29.4 
 
 
420 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  29.4 
 
 
420 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.60659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1777  cytochrome P450  28.42 
 
 
413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1796  cytochrome P450  28.42 
 
 
413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222543  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5062  cytochrome P450  32.56 
 
 
427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268876  normal  0.872733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4677  cytochrome P450  32.56 
 
 
427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1843  cytochrome P450  28.42 
 
 
413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.491191  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4763  cytochrome P450  32.56 
 
 
427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  31.07 
 
 
401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1607  cytochrome P450  30.49 
 
 
414 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798045  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  29.81 
 
 
442 aa  180  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2014  cytochrome P450  30.46 
 
 
417 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2060  cytochrome P450  30.46 
 
 
417 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.340582  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  28.97 
 
 
416 aa  179  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  33.5 
 
 
408 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  28.87 
 
 
412 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  31.07 
 
 
392 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3821  cytochrome P450 monooxygenase  31.46 
 
 
407 aa  176  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  28.42 
 
 
412 aa  176  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5053  cytochrome P450  29.92 
 
 
419 aa  176  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  30.69 
 
 
388 aa  176  9e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>