More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2865 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2865  linalool 8-monooxygenase  100 
 
 
418 aa  870    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.961693  normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0220  cytochrome P450  56.69 
 
 
445 aa  472  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1821  cytochrome P450  48.18 
 
 
410 aa  383  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6659  cytochrome P-450  47.83 
 
 
431 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337384  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1782  cytochrome P450  46.4 
 
 
417 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.114444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0020  cytochrome P450  48.31 
 
 
422 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0467456  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2128  cytochrome P450  44.83 
 
 
423 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5301  cytochrome P450  46.04 
 
 
418 aa  364  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.717822  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1765  cytochrome P450  45.19 
 
 
421 aa  362  7.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3934  cytochrome P450  46.09 
 
 
421 aa  358  7e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.184448  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6660  cytochrome P-450  49.1 
 
 
423 aa  358  8e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388051  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1803  cytochrome P450  46.34 
 
 
421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.677425  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3694  cytochrome P450  46.34 
 
 
421 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0025  cytochrome P450  46.91 
 
 
422 aa  347  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498673  normal  0.104962 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1951  cytochrome P450  44.28 
 
 
437 aa  341  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.94104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4264  cytochrome P450  44.79 
 
 
421 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0600  cytochrome P450  43.8 
 
 
470 aa  329  5.0000000000000004e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3593  putative cytochrome P450  40.81 
 
 
420 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3229  cytochrome P450  41.71 
 
 
462 aa  312  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29754  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3218  cytochrome P450  41.71 
 
 
462 aa  312  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.232743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3280  cytochrome P450  41.71 
 
 
462 aa  312  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.692519  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4592  cytochrome P450  41.93 
 
 
463 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5296  cytochrome P450  42.08 
 
 
422 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  36.82 
 
 
417 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0759  cytochrome P450  33.82 
 
 
403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  30.24 
 
 
447 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  30.34 
 
 
433 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1670  cytochrome P450  30.88 
 
 
455 aa  177  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0452772  normal  0.0820261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  30.77 
 
 
427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  30.73 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  30.77 
 
 
427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5035  cytochrome P450  32.63 
 
 
424 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854522  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4652  cytochrome P450  32.63 
 
 
424 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  30.77 
 
 
427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4740  cytochrome P450  32.63 
 
 
424 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59592  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  31.48 
 
 
414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  30.4 
 
 
412 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0012  cytochrome P450  33.76 
 
 
422 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  29.93 
 
 
415 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  31.83 
 
 
418 aa  171  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  30.32 
 
 
428 aa  169  9e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3721  cytochrome P450  31.04 
 
 
419 aa  169  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.540203 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  29.29 
 
 
414 aa  169  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3821  cytochrome P450 monooxygenase  28.78 
 
 
407 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  30.17 
 
 
417 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  29.72 
 
 
418 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2786  cytochrome P450  30.77 
 
 
422 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00511123  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2723  putative cytochrome P450  28.71 
 
 
423 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.538168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2767  putative cytochrome P450  28.71 
 
 
423 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.052524  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2753  putative cytochrome P450  28.47 
 
 
423 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  0.16215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1508  cytochrome P450  29.84 
 
 
420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  30.33 
 
 
412 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  28.89 
 
 
412 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2014  cytochrome P450  29.05 
 
 
417 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2060  cytochrome P450  29.05 
 
 
417 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.340582  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  28.64 
 
 
401 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4948  cytochrome P450  32.82 
 
 
402 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169294 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4565  cytochrome P450  33.07 
 
 
402 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4653  cytochrome P450  33.07 
 
 
402 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.974362  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3012  cytochrome P450  29.97 
 
 
419 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.839799  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3290  cytochrome P450  29.52 
 
 
417 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121591  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5258  cytochrome P450  28.88 
 
 
419 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4677  cytochrome P450  29.57 
 
 
427 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5062  cytochrome P450  29.57 
 
 
427 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268876  normal  0.872733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4763  cytochrome P450  29.57 
 
 
427 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2640  cytochrome P450  30.48 
 
 
425 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  29.33 
 
 
406 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  31.57 
 
 
415 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1301  cytochrome P450  28.97 
 
 
420 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.559778  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7140  cytochrome P450 CYP124E1  31.21 
 
 
428 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1995  cytochrome P450  28.81 
 
 
417 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228695  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  29.25 
 
 
442 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7141  cytochrome P450 CYP124E1  32.37 
 
 
416 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5053  cytochrome P450  29.32 
 
 
419 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  30.55 
 
 
392 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  28.46 
 
 
420 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  28.46 
 
 
420 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  28.46 
 
 
420 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.60659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  29.1 
 
 
400 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1796  cytochrome P450  29.64 
 
 
413 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222543  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1777  cytochrome P450  29.64 
 
 
413 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1843  cytochrome P450  29.64 
 
 
413 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.491191  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  29.19 
 
 
418 aa  154  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13578  cytochrome P450 125 cyp125  28.57 
 
 
433 aa  153  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0110795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  27.76 
 
 
401 aa  153  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  31.74 
 
 
414 aa  153  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  28.5 
 
 
424 aa  153  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3420  cytochrome P450  29.61 
 
 
406 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00557634  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  30.53 
 
 
404 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  27.85 
 
 
416 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  27.85 
 
 
428 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  27.85 
 
 
416 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3006  linalool 8-monooxygenase  27.72 
 
 
433 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106832 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  28.12 
 
 
408 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2991  linalool 8-monooxygenase  28.29 
 
 
433 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  28.67 
 
 
406 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3035  linalool 8-monooxygenase  28.29 
 
 
433 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0813  cytochrome P450  27.82 
 
 
427 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  29.34 
 
 
402 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  29.26 
 
 
408 aa  150  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>