More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0025 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0025  cytochrome P450  100 
 
 
422 aa  874    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498673  normal  0.104962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0020  cytochrome P450  73.76 
 
 
422 aa  644    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0467456  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1765  cytochrome P450  70.15 
 
 
421 aa  602  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5301  cytochrome P450  65.95 
 
 
418 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.717822  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4264  cytochrome P450  62.75 
 
 
421 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2128  cytochrome P450  64.56 
 
 
423 aa  536  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1803  cytochrome P450  63.73 
 
 
421 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.677425  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1782  cytochrome P450  63.57 
 
 
417 aa  537  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.114444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3934  cytochrome P450  62.25 
 
 
421 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.184448  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3694  cytochrome P450  62.68 
 
 
421 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5296  cytochrome P450  64.62 
 
 
422 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6659  cytochrome P-450  61.07 
 
 
431 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337384  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6660  cytochrome P-450  60.73 
 
 
423 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388051  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1951  cytochrome P450  56.34 
 
 
437 aa  461  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.94104 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0600  cytochrome P450  55.28 
 
 
470 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3218  cytochrome P450  53.92 
 
 
462 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.232743  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3229  cytochrome P450  53.92 
 
 
462 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29754  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3280  cytochrome P450  53.92 
 
 
462 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.692519  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3593  putative cytochrome P450  54.68 
 
 
420 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4592  cytochrome P450  54.66 
 
 
463 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0220  cytochrome P450  48.77 
 
 
445 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2865  linalool 8-monooxygenase  46.91 
 
 
418 aa  353  2e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.961693  normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1821  cytochrome P450  42.23 
 
 
410 aa  306  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  40.62 
 
 
417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0759  cytochrome P450  34.57 
 
 
403 aa  229  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  32.7 
 
 
447 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  33.17 
 
 
414 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  32.53 
 
 
434 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  32.93 
 
 
433 aa  216  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  33.98 
 
 
415 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  32.37 
 
 
427 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  32.37 
 
 
427 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  32.37 
 
 
427 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  34.65 
 
 
401 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5144  cytochrome P450  33.09 
 
 
409 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623851  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  31.63 
 
 
414 aa  205  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  31.58 
 
 
424 aa  203  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  30.1 
 
 
418 aa  199  9e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  31.13 
 
 
406 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  32.81 
 
 
395 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1670  cytochrome P450  31.78 
 
 
455 aa  193  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0452772  normal  0.0820261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  32.27 
 
 
406 aa  192  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1607  cytochrome P450  32.06 
 
 
414 aa  192  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798045  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  33.59 
 
 
400 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  34.03 
 
 
404 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  31.33 
 
 
412 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  31.17 
 
 
412 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5062  cytochrome P450  33.16 
 
 
427 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268876  normal  0.872733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4677  cytochrome P450  33.16 
 
 
427 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4763  cytochrome P450  33.16 
 
 
427 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1796  cytochrome P450  32.82 
 
 
413 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222543  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1777  cytochrome P450  32.82 
 
 
413 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1843  cytochrome P450  32.82 
 
 
413 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.491191  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  30.67 
 
 
428 aa  189  7e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  31.87 
 
 
401 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  33.33 
 
 
408 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4572  cytochrome P450  32.38 
 
 
411 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4660  cytochrome P450  32.38 
 
 
411 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.026328  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5258  cytochrome P450  31.97 
 
 
419 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13578  cytochrome P450 125 cyp125  31.4 
 
 
433 aa  187  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0110795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  32.35 
 
 
408 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1508  cytochrome P450  32.39 
 
 
420 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4955  cytochrome P450  32.3 
 
 
411 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4948  cytochrome P450  32.36 
 
 
402 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169294 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4565  cytochrome P450  32.27 
 
 
402 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4653  cytochrome P450  32.27 
 
 
402 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.974362  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5151  cytochrome P450  32.12 
 
 
410 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3821  cytochrome P450 monooxygenase  31.3 
 
 
407 aa  184  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  31.62 
 
 
388 aa  184  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  30.28 
 
 
442 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2640  cytochrome P450  34.44 
 
 
425 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3721  cytochrome P450  31.73 
 
 
419 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.540203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2739  cytochrome P450 CYP125  33.33 
 
 
413 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.251289  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  29.93 
 
 
412 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  29.07 
 
 
418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  30.07 
 
 
420 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4652  cytochrome P450  31.7 
 
 
424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5035  cytochrome P450  31.7 
 
 
424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854522  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4740  cytochrome P450  31.7 
 
 
424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59592  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  30.07 
 
 
420 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  30.07 
 
 
420 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.60659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2786  cytochrome P450  31.37 
 
 
422 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00511123  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  28.96 
 
 
402 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  32.13 
 
 
414 aa  179  9e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2967  cytochrome P450  30.79 
 
 
434 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  32.04 
 
 
409 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1301  cytochrome P450  29.61 
 
 
420 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.559778  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3006  linalool 8-monooxygenase  29.37 
 
 
433 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7865  cytochrome P450-terp  27.23 
 
 
433 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.790452  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0012  cytochrome P450  31.81 
 
 
422 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  30 
 
 
418 aa  178  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  29.32 
 
 
449 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7141  cytochrome P450 CYP124E1  33.09 
 
 
416 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2917  cytochrome P450 family protein  31.31 
 
 
418 aa  177  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.136725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  30.6 
 
 
416 aa  176  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2991  linalool 8-monooxygenase  29.13 
 
 
433 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3035  linalool 8-monooxygenase  29.13 
 
 
433 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  28.64 
 
 
416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  28.64 
 
 
428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  28.64 
 
 
416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.810593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>