More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2128 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2128  cytochrome P450  100 
 
 
423 aa  879    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1782  cytochrome P450  65.69 
 
 
417 aa  573  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.114444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0020  cytochrome P450  68.38 
 
 
422 aa  561  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0467456  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1765  cytochrome P450  63.76 
 
 
421 aa  556  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5301  cytochrome P450  65.45 
 
 
418 aa  553  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.717822  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0025  cytochrome P450  63.36 
 
 
422 aa  525  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498673  normal  0.104962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6659  cytochrome P-450  61.76 
 
 
431 aa  518  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337384  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3934  cytochrome P450  61.39 
 
 
421 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.184448  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6660  cytochrome P-450  60.74 
 
 
423 aa  518  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388051  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1803  cytochrome P450  61.39 
 
 
421 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.677425  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3694  cytochrome P450  60.43 
 
 
421 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4264  cytochrome P450  60.84 
 
 
421 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1951  cytochrome P450  55.92 
 
 
437 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.94104 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5296  cytochrome P450  59.32 
 
 
422 aa  458  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0600  cytochrome P450  52.98 
 
 
470 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4592  cytochrome P450  53.68 
 
 
463 aa  433  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3593  putative cytochrome P450  52.29 
 
 
420 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3229  cytochrome P450  53.56 
 
 
462 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29754  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3218  cytochrome P450  53.56 
 
 
462 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.232743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3280  cytochrome P450  53.56 
 
 
462 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.692519  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2865  linalool 8-monooxygenase  44.83 
 
 
418 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.961693  normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0220  cytochrome P450  46.01 
 
 
445 aa  358  9e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1821  cytochrome P450  43.36 
 
 
410 aa  328  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  42.55 
 
 
417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0759  cytochrome P450  36.82 
 
 
403 aa  249  6e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  32.39 
 
 
418 aa  217  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  33.01 
 
 
414 aa  216  7e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  31.16 
 
 
424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  31.81 
 
 
414 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  31.69 
 
 
418 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  33.25 
 
 
447 aa  209  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2786  cytochrome P450  33.49 
 
 
422 aa  206  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00511123  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  31.97 
 
 
420 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  31.97 
 
 
420 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  31.97 
 
 
420 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.60659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  31.5 
 
 
415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1301  cytochrome P450  31.88 
 
 
420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.559778  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5053  cytochrome P450  32.64 
 
 
419 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7865  cytochrome P450-terp  29.04 
 
 
433 aa  196  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.790452  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3721  cytochrome P450  32.39 
 
 
419 aa  193  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.540203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4565  cytochrome P450  33.81 
 
 
402 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4653  cytochrome P450  33.81 
 
 
402 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.974362  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4948  cytochrome P450  34.12 
 
 
402 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  31.46 
 
 
416 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  30.55 
 
 
434 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  31.78 
 
 
408 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  32.51 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5144  cytochrome P450  32.51 
 
 
409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623851  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  31.63 
 
 
428 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  31.63 
 
 
416 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  31.63 
 
 
416 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4652  cytochrome P450  34.94 
 
 
424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5035  cytochrome P450  34.94 
 
 
424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854522  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4740  cytochrome P450  34.94 
 
 
424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59592  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  30.07 
 
 
418 aa  183  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  33.25 
 
 
404 aa  183  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5151  cytochrome P450  31.42 
 
 
410 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  31.92 
 
 
414 aa  182  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  30.98 
 
 
401 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  34.19 
 
 
409 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  29.76 
 
 
406 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1302  cytochrome P450  30.71 
 
 
420 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  29.95 
 
 
412 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3069  cytochrome P450  29.26 
 
 
422 aa  180  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0012  cytochrome P450  33.57 
 
 
422 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1777  cytochrome P450  30.95 
 
 
413 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1796  cytochrome P450  30.95 
 
 
413 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1843  cytochrome P450  30.95 
 
 
413 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.491191  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  30.75 
 
 
427 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1670  cytochrome P450  28.97 
 
 
455 aa  179  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0452772  normal  0.0820261 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  30.75 
 
 
427 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  30.49 
 
 
401 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  30.36 
 
 
412 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1021  cytochrome P450  29 
 
 
425 aa  177  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0609813  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  29.74 
 
 
412 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  30.75 
 
 
427 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  30.3 
 
 
433 aa  176  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1607  cytochrome P450  30.81 
 
 
414 aa  176  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798045  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1508  cytochrome P450  32.22 
 
 
420 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5516  cytochrome P450  31.04 
 
 
429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4677  cytochrome P450  32.05 
 
 
427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5062  cytochrome P450  32.05 
 
 
427 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268876  normal  0.872733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4763  cytochrome P450  32.05 
 
 
427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  30.66 
 
 
408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2967  cytochrome P450  30.48 
 
 
434 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5258  cytochrome P450  32.47 
 
 
419 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  28.35 
 
 
428 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4043  cytochrome P450  30.98 
 
 
430 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2917  cytochrome P450 family protein  30.12 
 
 
418 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.136725 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2608  cytochrome P450 family protein  30.28 
 
 
421 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2720  cytochrome P450  29.27 
 
 
408 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3012  cytochrome P450  31.09 
 
 
419 aa  170  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.839799  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7155  cytochrome P450 CYP124E1  32.21 
 
 
407 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.486175  normal  0.0237063 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3162  cytochrome P450  30.92 
 
 
430 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.394046  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2640  cytochrome P450  31.88 
 
 
425 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4572  cytochrome P450  29.35 
 
 
411 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4660  cytochrome P450  29.35 
 
 
411 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.026328  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4955  cytochrome P450  29.46 
 
 
411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1995  cytochrome P450  31.04 
 
 
417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228695  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  28.64 
 
 
442 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>