More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3934 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6660  cytochrome P-450  78.69 
 
 		 423 aa  684    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3934  cytochrome P450  100 
 
 		 421 aa  877    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.184448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4264  cytochrome P450  82.66 
 
 		 421 aa  749    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3694  cytochrome P450  94.3 
 
 		 421 aa  833    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1803  cytochrome P450  91.69 
 
 		 421 aa  808    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.677425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6659  cytochrome P-450  66.19 
 
 		 431 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0020  cytochrome P450  66.58 
 
 		 422 aa  559  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0467456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1765  cytochrome P450  61.84 
 
 		 421 aa  538  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5301  cytochrome P450  63.46 
 
 		 418 aa  528  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.717822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0025  cytochrome P450  62.25 
 
 		 422 aa  521  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498673  normal  0.104962 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2128  cytochrome P450  62.1 
 
 		 423 aa  518  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1782  cytochrome P450  58.13 
 
 		 417 aa  504  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114444 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5296  cytochrome P450  58.95 
 
 		 422 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1951  cytochrome P450  53.45 
 
 		 437 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3593  putative cytochrome P450  50.25 
 
 		 420 aa  428  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0600  cytochrome P450  50 
 
 		 470 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3229  cytochrome P450  51.64 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3218  cytochrome P450  51.64 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.232743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3280  cytochrome P450  51.64 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4592  cytochrome P450  50.38 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0220  cytochrome P450  48.09 
 
 		 445 aa  365  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2865  linalool 8-monooxygenase  46.09 
 
 		 418 aa  358  7e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.961693  normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1821  cytochrome P450  44.44 
 
 		 410 aa  320  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  40.16 
 
 		 417 aa  282  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0759  cytochrome P450  34.76 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  34.48 
 
 		 415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  33.42 
 
 		 414 aa  211  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  32.69 
 
 		 414 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  33.6 
 
 		 401 aa  206  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  32.13 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  31.49 
 
 		 424 aa  199  9e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  30.65 
 
 		 418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  34.63 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5062  cytochrome P450  32.65 
 
 		 427 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268876  normal  0.872733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4677  cytochrome P450  32.65 
 
 		 427 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4763  cytochrome P450  32.65 
 
 		 427 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1508  cytochrome P450  33.25 
 
 		 420 aa  192  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  30.95 
 
 		 447 aa  192  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1670  cytochrome P450  31 
 
 		 455 aa  190  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0452772  normal  0.0820261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  30.45 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  30.45 
 
 		 416 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  30.27 
 
 		 420 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  30.27 
 
 		 420 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  30.27 
 
 		 420 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.60659 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  30.45 
 
 		 416 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5258  cytochrome P450  32.4 
 
 		 419 aa  189  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1777  cytochrome P450  30.33 
 
 		 413 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1796  cytochrome P450  30.33 
 
 		 413 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1843  cytochrome P450  30.33 
 
 		 413 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.491191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  30.2 
 
 		 416 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1302  cytochrome P450  30.29 
 
 		 420 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  33.83 
 
 		 409 aa  186  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5516  cytochrome P450  31.46 
 
 		 429 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7865  cytochrome P450-terp  29.06 
 
 		 433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.790452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5053  cytochrome P450  30.58 
 
 		 419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1301  cytochrome P450  29.53 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.559778  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2786  cytochrome P450  33.08 
 
 		 422 aa  183  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00511123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  30.61 
 
 		 388 aa  183  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  31.94 
 
 		 406 aa  182  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  31.41 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  31.41 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  32.56 
 
 		 414 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  29.63 
 
 		 401 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  29.56 
 
 		 412 aa  179  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  29.95 
 
 		 412 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7155  cytochrome P450 CYP124E1  32.2 
 
 		 407 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.486175  normal  0.0237063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  31.41 
 
 		 434 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0012  cytochrome P450  33.33 
 
 		 422 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5144  cytochrome P450  31.68 
 
 		 409 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  30.31 
 
 		 400 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3721  cytochrome P450  30.71 
 
 		 419 aa  175  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.540203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  31.18 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4565  cytochrome P450  31.11 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4653  cytochrome P450  31.11 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.974362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2917  cytochrome P450 family protein  30.13 
 
 		 418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.136725 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  30.41 
 
 		 427 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4948  cytochrome P450  31.11 
 
 		 402 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169294 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  30.41 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  30.41 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3425  cytochrome P450  31.97 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1021  cytochrome P450  29.1 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0609813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  30.61 
 
 		 433 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  30 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  29.4 
 
 		 402 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5035  cytochrome P450  32.75 
 
 		 424 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4652  cytochrome P450  32.75 
 
 		 424 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4740  cytochrome P450  32.75 
 
 		 424 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3012  cytochrome P450  32.04 
 
 		 419 aa  170  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.839799  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2722  cytochrome P450  29.65 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  30.26 
 
 		 417 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  30.12 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2739  cytochrome P450 CYP125  34.78 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.251289  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7254  cytochrome P450  31.81 
 
 		 431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3290  cytochrome P450  30.87 
 
 		 417 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121591  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13578  cytochrome P450 125 cyp125  29.56 
 
 		 433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0110795 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  31.51 
 
 		 408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2753  putative cytochrome P450  33.24 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  0.16215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2723  putative cytochrome P450  33.24 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.538168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2767  putative cytochrome P450  33.24 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.052524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  30.41 
 
 		 380 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>