More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4264 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3934  cytochrome P450  82.66 
 
 		 421 aa  749    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.184448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1803  cytochrome P450  84.09 
 
 		 421 aa  759    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.677425  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4264  cytochrome P450  100 
 
 		 421 aa  876    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3694  cytochrome P450  84.09 
 
 		 421 aa  756    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6660  cytochrome P-450  77.33 
 
 		 423 aa  693    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6659  cytochrome P-450  66.58 
 
 		 431 aa  580  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0020  cytochrome P450  65.85 
 
 		 422 aa  556  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0467456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5301  cytochrome P450  64.71 
 
 		 418 aa  547  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.717822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1765  cytochrome P450  61.72 
 
 		 421 aa  543  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0025  cytochrome P450  62.75 
 
 		 422 aa  525  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498673  normal  0.104962 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2128  cytochrome P450  60.84 
 
 		 423 aa  505  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1782  cytochrome P450  57.92 
 
 		 417 aa  500  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114444 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5296  cytochrome P450  61.19 
 
 		 422 aa  491  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1951  cytochrome P450  52.22 
 
 		 437 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3593  putative cytochrome P450  49.75 
 
 		 420 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0600  cytochrome P450  49.01 
 
 		 470 aa  395  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4592  cytochrome P450  48.4 
 
 		 463 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3218  cytochrome P450  48.64 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.232743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3280  cytochrome P450  48.64 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3229  cytochrome P450  48.64 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0220  cytochrome P450  47.03 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2865  linalool 8-monooxygenase  44.79 
 
 		 418 aa  338  9.999999999999999e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.961693  normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1821  cytochrome P450  42.33 
 
 		 410 aa  305  8.000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  41.73 
 
 		 417 aa  280  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0759  cytochrome P450  34.51 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  35.56 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  37.89 
 
 		 404 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  34.31 
 
 		 414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  33.16 
 
 		 418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  31.74 
 
 		 424 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  33.09 
 
 		 414 aa  204  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  32.28 
 
 		 401 aa  200  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  35.98 
 
 		 409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2786  cytochrome P450  33.59 
 
 		 422 aa  193  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00511123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5258  cytochrome P450  32.82 
 
 		 419 aa  192  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5062  cytochrome P450  33.16 
 
 		 427 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268876  normal  0.872733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1508  cytochrome P450  33.42 
 
 		 420 aa  192  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4677  cytochrome P450  33.16 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4763  cytochrome P450  33.16 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  29.1 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  30.26 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  29.1 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  29.1 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.60659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  32.72 
 
 		 406 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  31 
 
 		 447 aa  189  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1777  cytochrome P450  30.33 
 
 		 413 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1796  cytochrome P450  30.33 
 
 		 413 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1843  cytochrome P450  30.33 
 
 		 413 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.491191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  29.95 
 
 		 416 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5516  cytochrome P450  31.71 
 
 		 429 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7155  cytochrome P450 CYP124E1  33.33 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.486175  normal  0.0237063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  29.7 
 
 		 416 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  29.7 
 
 		 416 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1302  cytochrome P450  30.55 
 
 		 420 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  29.7 
 
 		 428 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  31.4 
 
 		 388 aa  186  9e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  31.44 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7865  cytochrome P450-terp  28.88 
 
 		 433 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.790452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  31.03 
 
 		 412 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4565  cytochrome P450  33.72 
 
 		 402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4653  cytochrome P450  33.72 
 
 		 402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.974362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5144  cytochrome P450  31.38 
 
 		 409 aa  183  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4948  cytochrome P450  34.01 
 
 		 402 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  31.89 
 
 		 433 aa  182  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  32.16 
 
 		 434 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  31.39 
 
 		 427 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  32.12 
 
 		 400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  31.15 
 
 		 406 aa  180  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  33.08 
 
 		 414 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  30.16 
 
 		 402 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  31.39 
 
 		 427 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  31.39 
 
 		 427 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1301  cytochrome P450  29.38 
 
 		 420 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.559778  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  29.74 
 
 		 412 aa  179  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  32.49 
 
 		 408 aa  179  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3012  cytochrome P450  33.33 
 
 		 419 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.839799  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5053  cytochrome P450  30.33 
 
 		 419 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  32.29 
 
 		 418 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  28.57 
 
 		 401 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13578  cytochrome P450 125 cyp125  29.69 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0110795 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1670  cytochrome P450  29.57 
 
 		 455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0452772  normal  0.0820261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2722  cytochrome P450  28.83 
 
 		 407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3290  cytochrome P450  32.58 
 
 		 417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121591  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4955  cytochrome P450  31.03 
 
 		 411 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  31.41 
 
 		 442 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  31.47 
 
 		 408 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  29.6 
 
 		 403 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1021  cytochrome P450  29.57 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0609813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2723  putative cytochrome P450  32.2 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.538168  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4572  cytochrome P450  30.77 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347976  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2753  putative cytochrome P450  32.2 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  0.16215 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2767  putative cytochrome P450  32.2 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.052524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  29.38 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4660  cytochrome P450  30.77 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.026328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7254  cytochrome P450  31.08 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3425  cytochrome P450  31.46 
 
 		 421 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2739  cytochrome P450 CYP125  35.22 
 
 		 413 aa  169  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.251289  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0012  cytochrome P450  33.58 
 
 		 422 aa  169  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5035  cytochrome P450  32.75 
 
 		 424 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4652  cytochrome P450  32.75 
 
 		 424 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>