More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3069 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3069  cytochrome P450  100 
 
 
422 aa  850    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  49.15 
 
 
418 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  44.44 
 
 
418 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  43.13 
 
 
420 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  42.65 
 
 
424 aa  358  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  43.13 
 
 
420 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  43.13 
 
 
420 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.60659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1301  cytochrome P450  42.42 
 
 
420 aa  345  8e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.559778  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5053  cytochrome P450  41.71 
 
 
419 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1777  cytochrome P450  42.79 
 
 
413 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1796  cytochrome P450  42.79 
 
 
413 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1843  cytochrome P450  42.79 
 
 
413 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.491191  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  42.55 
 
 
412 aa  333  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  42.34 
 
 
412 aa  333  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  41.99 
 
 
416 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  41.99 
 
 
428 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  41.99 
 
 
416 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  40.71 
 
 
416 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1302  cytochrome P450  41 
 
 
420 aa  322  7e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  41.69 
 
 
449 aa  315  7e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2720  cytochrome P450  42.34 
 
 
408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7865  cytochrome P450-terp  42.11 
 
 
433 aa  312  9e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.790452  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5516  cytochrome P450  38.55 
 
 
429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  41.33 
 
 
428 aa  291  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7766  cytochrome P450  37.15 
 
 
430 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3162  cytochrome P450  37.71 
 
 
430 aa  268  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.394046  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  37.25 
 
 
414 aa  225  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  34.81 
 
 
401 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  34.94 
 
 
408 aa  210  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  36.48 
 
 
415 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  34.39 
 
 
401 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  35.48 
 
 
406 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  36.9 
 
 
415 aa  207  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  34.84 
 
 
408 aa  202  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  34.67 
 
 
418 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1995  cytochrome P450  34.08 
 
 
417 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228695  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  34.68 
 
 
400 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  34.89 
 
 
406 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5151  cytochrome P450  34.01 
 
 
410 aa  196  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2014  cytochrome P450  33.58 
 
 
417 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2060  cytochrome P450  33.58 
 
 
417 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.340582  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3721  cytochrome P450  31.65 
 
 
419 aa  194  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.540203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5062  cytochrome P450  30.51 
 
 
427 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268876  normal  0.872733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4677  cytochrome P450  30.51 
 
 
427 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4763  cytochrome P450  30.51 
 
 
427 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2917  cytochrome P450 family protein  33.08 
 
 
418 aa  192  7e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.136725 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4572  cytochrome P450  33.08 
 
 
411 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347976  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  34.05 
 
 
414 aa  192  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4660  cytochrome P450  33.08 
 
 
411 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.026328  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5258  cytochrome P450  31.55 
 
 
419 aa  192  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4955  cytochrome P450  33.08 
 
 
411 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3593  putative cytochrome P450  33.08 
 
 
420 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  33.33 
 
 
417 aa  190  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  33.33 
 
 
402 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0012  cytochrome P450  32.92 
 
 
422 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1508  cytochrome P450  30.79 
 
 
420 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  32.7 
 
 
403 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2431  cytochrome P450  33.16 
 
 
424 aa  189  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7141  cytochrome P450 CYP124E1  34.09 
 
 
416 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  33.58 
 
 
417 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1021  cytochrome P450  31.02 
 
 
425 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0609813  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1607  cytochrome P450  33.58 
 
 
414 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798045  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  32.12 
 
 
442 aa  187  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7140  cytochrome P450 CYP124E1  34.52 
 
 
428 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0813  cytochrome P450  33.16 
 
 
427 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2786  cytochrome P450  32.93 
 
 
422 aa  186  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00511123  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  33.23 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2128  cytochrome P450  29.5 
 
 
423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2722  cytochrome P450  30.85 
 
 
407 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2739  cytochrome P450 CYP125  32.42 
 
 
413 aa  184  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.251289  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  33.23 
 
 
404 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  33.23 
 
 
404 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13578  cytochrome P450 125 cyp125  30.79 
 
 
433 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0110795 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  32.51 
 
 
428 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  33.5 
 
 
412 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0020  cytochrome P450  31.18 
 
 
422 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0467456  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2723  putative cytochrome P450  30.9 
 
 
423 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.538168  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0773  putative cytochrome P450  32.14 
 
 
416 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  0.121605 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2767  putative cytochrome P450  30.9 
 
 
423 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.052524  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2753  putative cytochrome P450  30.66 
 
 
423 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  0.16215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4652  cytochrome P450  31.7 
 
 
424 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5035  cytochrome P450  31.7 
 
 
424 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854522  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4740  cytochrome P450  31.7 
 
 
424 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59592  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3821  cytochrome P450 monooxygenase  32.07 
 
 
407 aa  181  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3970  cytochrome P450  30 
 
 
436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  32.32 
 
 
398 aa  180  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3006  linalool 8-monooxygenase  31.92 
 
 
433 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  31.47 
 
 
433 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3974  cytochrome P450  32.16 
 
 
412 aa  178  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  32.07 
 
 
399 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2991  linalool 8-monooxygenase  31.34 
 
 
433 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1803  cytochrome P450  30.48 
 
 
421 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.677425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3035  linalool 8-monooxygenase  31.34 
 
 
433 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6660  cytochrome P-450  30.43 
 
 
423 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388051  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4043  cytochrome P450  33.93 
 
 
430 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3290  cytochrome P450  30.79 
 
 
417 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121591  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  31.22 
 
 
434 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  30.24 
 
 
397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5301  cytochrome P450  29.72 
 
 
418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.717822  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  31.4 
 
 
402 aa  173  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>