More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4141 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4141  cytochrome P450  100 
 
 		 394 aa  810    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1895  cytochrome P450  53.54 
 
 		 384 aa  425  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0388  heme-thiolate monooxygenase, putative  55.17 
 
 		 387 aa  421  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3226  cytochrome P450  50.79 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.787623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2579  cytochrome P450  50.79 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5016  cytochrome P450  52.15 
 
 		 356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14547  normal  0.304515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0343  cytochrome P450  43.78 
 
 		 406 aa  300  4e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0929  cytochrome P450  43.2 
 
 		 382 aa  293  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1871  cytochrome P450  41.89 
 
 		 379 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.309284  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0149  cytochrome P450  42.74 
 
 		 383 aa  273  5.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19760  cytochrome P450  37.72 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1012  cytochrome P450  37.7 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  30.68 
 
 		 412 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  32.01 
 
 		 418 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  31.39 
 
 		 407 aa  176  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  29.84 
 
 		 380 aa  172  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  31.82 
 
 		 395 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  29.6 
 
 		 411 aa  170  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  28.65 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  30.64 
 
 		 403 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  32.6 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  32 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  29.33 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  28.34 
 
 		 408 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3832  cytochrome P450  30.3 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0796027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  30.75 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  31.4 
 
 		 388 aa  156  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11220  cytochrome P450, putative (Eurofung)  31.54 
 
 		 415 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  31.38 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3665  cytochrome P450  27.03 
 
 		 411 aa  153  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  31 
 
 		 398 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2659  cytochrome P450 family protein  29.55 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00743758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  29.33 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2452  cytochrome P450 family protein  29.8 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2632  cytochrome P450 family protein  29.8 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  31.99 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2650  cytochrome P450 family protein  29.8 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000122634 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2414  cytochrome P450  29.8 
 
 		 404 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000201211  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  29.24 
 
 		 399 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  31.4 
 
 		 406 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2508  cytochrome P450  29.75 
 
 		 404 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0157804  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4983  cytochrome P450  32.15 
 
 		 387 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  32.02 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2656  cytochrome P450 family protein  30.57 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  31.18 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2668  cytochrome P450 family protein  30.57 
 
 		 404 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1764  cytochrome P450  31.91 
 
 		 390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  31.76 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  29.95 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  28.29 
 
 		 421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2377  cytochrome P450 family protein  30 
 
 		 404 aa  146  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  28.24 
 
 		 392 aa  146  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  29.86 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  32.89 
 
 		 413 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  29.64 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  32.92 
 
 		 405 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  30.35 
 
 		 412 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0903  cytochrome P450  29.54 
 
 		 425 aa  143  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0338626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  26.74 
 
 		 397 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4422  cytochrome P450  31.38 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4509  cytochrome P450  31.38 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  30.39 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  29.28 
 
 		 398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  30.71 
 
 		 774 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  26.7 
 
 		 411 aa  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4803  cytochrome P450  31.09 
 
 		 394 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173439  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  30.19 
 
 		 401 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  30.59 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4131  cytochrome P450  28.01 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0603  cytochrome P450  32.04 
 
 		 397 aa  140  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  30.21 
 
 		 418 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4175  cytochrome P450  30.95 
 
 		 400 aa  139  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  27.48 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  29.23 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  28.34 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  28.34 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  28.34 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3974  cytochrome P450  28.65 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0514816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  31.54 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  29.43 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  31.54 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  29.97 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2799  cytochrome P450  28.53 
 
 		 409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0359  cytochrome P450  30 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6889  cytochrome P450  31.34 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  29.68 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3709  cytochrome P450  31.54 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  28.93 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  28.02 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  26.5 
 
 		 411 aa  136  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  27.73 
 
 		 398 aa  137  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  30.77 
 
 		 402 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  28.53 
 
 		 404 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  30.68 
 
 		 401 aa  135  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  29.44 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4160  cytochrome P450  32.01 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  29.44 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  27.52 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  28.73 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  29.1 
 
 		 418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>