More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0359 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0359  cytochrome P450  100 
 
 
431 aa  893    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  31 
 
 
388 aa  190  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  32.59 
 
 
401 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  30.77 
 
 
402 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  31.89 
 
 
411 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  31.51 
 
 
412 aa  176  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  31.51 
 
 
412 aa  176  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1994  cytochrome P450  29.9 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269689  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  30.27 
 
 
411 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  28.44 
 
 
411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  32.01 
 
 
417 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  29.43 
 
 
411 aa  162  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  29.68 
 
 
426 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  28.92 
 
 
398 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  28.09 
 
 
398 aa  161  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4485  cytochrome P450  29.02 
 
 
421 aa  160  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  0.78931 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  28.8 
 
 
411 aa  159  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  28.74 
 
 
411 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  28.74 
 
 
411 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  28.74 
 
 
411 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  28.74 
 
 
411 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  28.44 
 
 
411 aa  159  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  28.74 
 
 
411 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  28.44 
 
 
411 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  30.03 
 
 
411 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  31.77 
 
 
395 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  28.74 
 
 
418 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  26.18 
 
 
380 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  30.05 
 
 
400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  30.42 
 
 
412 aa  153  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  33.65 
 
 
404 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  31.04 
 
 
411 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  28.09 
 
 
398 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  28.85 
 
 
407 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  28.47 
 
 
407 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  28.85 
 
 
407 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  28.85 
 
 
407 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  28.44 
 
 
405 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  33.65 
 
 
404 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  33.65 
 
 
404 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12295  cytochrome P450 128 cyp128  29.95 
 
 
489 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  28.53 
 
 
403 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  28.5 
 
 
402 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  28.13 
 
 
405 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  27.25 
 
 
387 aa  149  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  28.85 
 
 
402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  28.85 
 
 
405 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  27.59 
 
 
410 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  30.77 
 
 
402 aa  146  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  30.56 
 
 
357 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  29.52 
 
 
423 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  32.3 
 
 
409 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  31.45 
 
 
407 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  27.74 
 
 
412 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  30.47 
 
 
392 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  31.45 
 
 
407 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  29.83 
 
 
399 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  28.96 
 
 
410 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  29.55 
 
 
408 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  27.62 
 
 
395 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  27 
 
 
401 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  30.77 
 
 
404 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  27.57 
 
 
415 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  31.89 
 
 
402 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  31.05 
 
 
409 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  29.32 
 
 
412 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  28.37 
 
 
405 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  27.75 
 
 
404 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  32.31 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  26.27 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  26.18 
 
 
408 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  28.13 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  33.72 
 
 
418 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  31.13 
 
 
403 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  28.13 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  43.41 
 
 
443 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  28.71 
 
 
417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  29.37 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  30.18 
 
 
399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  27.71 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  28.74 
 
 
401 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2656  cytochrome P450 family protein  30.48 
 
 
404 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  30.12 
 
 
393 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  27.27 
 
 
417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  31.83 
 
 
421 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4317  cytochrome P450  30.34 
 
 
426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2001  cytochrome P450  30.03 
 
 
405 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  29.35 
 
 
413 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  29.88 
 
 
393 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  32.48 
 
 
413 aa  139  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  35.19 
 
 
400 aa  139  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3706  cytochrome P450  28.07 
 
 
435 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  31.56 
 
 
401 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  31.45 
 
 
430 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3779  cytochrome P450  28.07 
 
 
435 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793715  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  29.53 
 
 
409 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  27.23 
 
 
417 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2668  cytochrome P450 family protein  30.25 
 
 
404 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  26.54 
 
 
412 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  26.87 
 
 
420 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>