More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2693 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  87.37 
 
 		 398 aa  706    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  100 
 
 		 398 aa  816    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  74.24 
 
 		 399 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  74.24 
 
 		 399 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  73.23 
 
 		 399 aa  617  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  37.98 
 
 		 397 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  37.43 
 
 		 390 aa  250  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  39.04 
 
 		 399 aa  249  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  33.76 
 
 		 421 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  34.34 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4979  cytochrome P450  35.34 
 
 		 406 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1768  cytochrome P450  35.06 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  34.08 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4052  cytochrome P450  35.98 
 
 		 401 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal  0.478412 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  32.74 
 
 		 380 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  34.65 
 
 		 403 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0997  cytochrome P450  33.07 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148456  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4131  cytochrome P450  31.2 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  33.87 
 
 		 388 aa  196  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6858  cytochrome P450  32.89 
 
 		 409 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  33.85 
 
 		 399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.7 
 
 		 420 aa  189  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  31.74 
 
 		 398 aa  189  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  32.29 
 
 		 395 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  36.99 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  34.42 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  32.5 
 
 		 392 aa  184  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  33.42 
 
 		 398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  31.5 
 
 		 395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  32.48 
 
 		 398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3533  cytochrome P450  32.17 
 
 		 398 aa  183  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  31.3 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  31.95 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  33.06 
 
 		 418 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  30.92 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  32.45 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  29.53 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  33.86 
 
 		 398 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4983  cytochrome P450  32.44 
 
 		 387 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  34.18 
 
 		 411 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1964  cytochrome P450  30.79 
 
 		 421 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.512147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1274  hypothetical protein  31.58 
 
 		 461 aa  178  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  30.42 
 
 		 408 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  33.06 
 
 		 401 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1021  cytochrome P450  33.24 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  36.94 
 
 		 400 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  30.81 
 
 		 409 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  33.25 
 
 		 398 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  32.68 
 
 		 443 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  30.35 
 
 		 398 aa  176  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  30.2 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  31.77 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  31.78 
 
 		 411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  31.36 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  33.33 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3682  cytochrome P450  31.81 
 
 		 410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  33.33 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  35.09 
 
 		 400 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  33.77 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  33.33 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6896  cytochrome P450  29.95 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1764  cytochrome P450  32.68 
 
 		 390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  33.43 
 
 		 399 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  32.37 
 
 		 395 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  31.49 
 
 		 408 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  32.46 
 
 		 401 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  32.46 
 
 		 401 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  33.79 
 
 		 402 aa  173  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11815  cytochrome P450 143 cyp143  33.52 
 
 		 393 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.581255  normal  0.84811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  29.71 
 
 		 406 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  36.36 
 
 		 412 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3709  cytochrome P450  31.57 
 
 		 400 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  32.05 
 
 		 417 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4422  cytochrome P450  32.35 
 
 		 394 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  30.69 
 
 		 395 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  30.93 
 
 		 398 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4509  cytochrome P450  32.35 
 
 		 394 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  31.49 
 
 		 405 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  31.49 
 
 		 405 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  31.49 
 
 		 405 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  30.36 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  31.31 
 
 		 400 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  30.56 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  31.31 
 
 		 400 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  30.56 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  31.46 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  33.55 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  30.47 
 
 		 390 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  31.47 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  32.2 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  31.78 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  30.97 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  31.28 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  30.56 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  33.33 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0903  cytochrome P450  31.82 
 
 		 425 aa  171  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0338626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  32.11 
 
 		 403 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4803  cytochrome P450  32.35 
 
 		 394 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173439  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  32.05 
 
 		 411 aa  170  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  32.47 
 
 		 403 aa  170  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>