More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1478 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  828    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  44.06 
 
 		 390 aa  290  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  39.1 
 
 		 397 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  38.02 
 
 		 399 aa  260  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4052  cytochrome P450  37.19 
 
 		 401 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal  0.478412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  37.92 
 
 		 421 aa  247  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  38.81 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  38.11 
 
 		 398 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  37.42 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  38.25 
 
 		 399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6858  cytochrome P450  33.43 
 
 		 409 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.775 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  36.27 
 
 		 399 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4983  cytochrome P450  33.52 
 
 		 387 aa  189  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  36.27 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4979  cytochrome P450  33.68 
 
 		 406 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6896  cytochrome P450  33.15 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4803  cytochrome P450  32.59 
 
 		 394 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173439  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4028  cytochrome P450  36.84 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4422  cytochrome P450  32.59 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4509  cytochrome P450  32.59 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  36.22 
 
 		 418 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1768  cytochrome P450  33.59 
 
 		 405 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1764  cytochrome P450  32.11 
 
 		 390 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3682  cytochrome P450  35.42 
 
 		 410 aa  184  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0903  cytochrome P450  30.25 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0338626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  33.05 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  33.33 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11815  cytochrome P450 143 cyp143  32.59 
 
 		 393 aa  179  9e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.581255  normal  0.84811 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0872  cytochrome P450  30.12 
 
 		 397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  31.89 
 
 		 406 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4160  cytochrome P450  31.2 
 
 		 385 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2249  cytochrome P450  30.85 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.274245  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3252  cytochrome P450  35 
 
 		 402 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176211  normal  0.95794 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3241  cytochrome P450  35 
 
 		 402 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3303  cytochrome P450  35 
 
 		 402 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0174773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  31.5 
 
 		 406 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1021  cytochrome P450  30.36 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644973 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0514  cytochrome P450  33.64 
 
 		 421 aa  160  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  30.99 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  30.93 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0363  cytochrome P450  35.03 
 
 		 409 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  30.93 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3533  cytochrome P450  33.33 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  32.87 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  31.06 
 
 		 426 aa  157  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  30.9 
 
 		 402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1274  hypothetical protein  29.47 
 
 		 461 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  30.9 
 
 		 402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  30.9 
 
 		 402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4131  cytochrome P450  29.28 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  32.35 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  30.86 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  30.81 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  30.9 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  31.29 
 
 		 411 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  32.04 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  28.79 
 
 		 403 aa  153  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  31.38 
 
 		 398 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  31.12 
 
 		 411 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  30.79 
 
 		 411 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  31.12 
 
 		 411 aa  153  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0373  cytochrome P450  33.86 
 
 		 409 aa  153  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  28.73 
 
 		 403 aa  152  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  31.12 
 
 		 411 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  31.12 
 
 		 411 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  30.46 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1735  cytochrome P450  31.68 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  30.77 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  31.12 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1485  cytochrome P450  32.92 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1021  cytochrome P450  31.14 
 
 		 425 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0609813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1507  cytochrome P450  32.92 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1483  cytochrome P450  32.92 
 
 		 417 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  29.3 
 
 		 417 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  32.05 
 
 		 404 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  30.08 
 
 		 417 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  32.05 
 
 		 404 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  32.05 
 
 		 404 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  34.24 
 
 		 449 aa  149  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  36.82 
 
 		 392 aa  149  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  28.45 
 
 		 380 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  30.53 
 
 		 415 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  28.35 
 
 		 407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  34.17 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  26.07 
 
 		 420 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1743  cytochrome P450  31.11 
 
 		 409 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  32.36 
 
 		 398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  30.36 
 
 		 398 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3832  cytochrome P450  29.19 
 
 		 396 aa  146  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0796027  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  31.15 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  30.07 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  31.12 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0512  cytochrome P450  32.99 
 
 		 398 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13559  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  33.1 
 
 		 417 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11220  cytochrome P450, putative (Eurofung)  28.22 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4553  cytochrome P450  34.77 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174977  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0298  cytochrome P450  31.12 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  27.81 
 
 		 411 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  28.74 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  30.27 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>