More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1743 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1743  cytochrome P450  100 
 
 
409 aa  833    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6896  cytochrome P450  41.81 
 
 
406 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6858  cytochrome P450  39.9 
 
 
409 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0361  cytochrome P450  38.44 
 
 
406 aa  277  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3533  cytochrome P450  34.94 
 
 
398 aa  243  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1478  cytochrome P450  34.09 
 
 
417 aa  240  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128323  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2249  cytochrome P450  34.67 
 
 
396 aa  237  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.274245  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0514  cytochrome P450  30.77 
 
 
421 aa  211  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3682  cytochrome P450  33.08 
 
 
410 aa  202  9e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  32.29 
 
 
390 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  33.24 
 
 
397 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0872  cytochrome P450  30.41 
 
 
397 aa  183  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  36.39 
 
 
418 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  30.73 
 
 
399 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  30.97 
 
 
421 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  33.33 
 
 
407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1274  hypothetical protein  31.32 
 
 
461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  32.59 
 
 
412 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  30.79 
 
 
418 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  28.32 
 
 
399 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4052  cytochrome P450  30.91 
 
 
401 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal  0.478412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  28.64 
 
 
399 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  30.73 
 
 
404 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  30.73 
 
 
404 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  30.73 
 
 
404 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  29.1 
 
 
396 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  28.68 
 
 
398 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4131  cytochrome P450  28.17 
 
 
406 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  27.25 
 
 
399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11815  cytochrome P450 143 cyp143  30.67 
 
 
393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.581255  normal  0.84811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4979  cytochrome P450  31.04 
 
 
406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  30.37 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  28.68 
 
 
392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  31.11 
 
 
403 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  28.93 
 
 
395 aa  146  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  28.42 
 
 
396 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  29.72 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  29.85 
 
 
774 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1964  cytochrome P450  28.29 
 
 
421 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.512147  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  28.61 
 
 
398 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0903  cytochrome P450  27.96 
 
 
425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0338626  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4983  cytochrome P450  28.19 
 
 
387 aa  139  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  30.13 
 
 
427 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  27.83 
 
 
410 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  28.28 
 
 
398 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  30.28 
 
 
395 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  28.72 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  28.06 
 
 
405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  28.17 
 
 
401 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1768  cytochrome P450  30.68 
 
 
405 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  32.03 
 
 
412 aa  137  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  30.7 
 
 
404 aa  137  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  29.04 
 
 
398 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  28.46 
 
 
398 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  28.72 
 
 
788 aa  136  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  28.25 
 
 
388 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3006  linalool 8-monooxygenase  29.01 
 
 
433 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106832 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  30.88 
 
 
428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  33.43 
 
 
400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1764  cytochrome P450  28.92 
 
 
390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  27.86 
 
 
412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  29.33 
 
 
395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2991  linalool 8-monooxygenase  28.91 
 
 
433 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  29.29 
 
 
398 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3035  linalool 8-monooxygenase  28.91 
 
 
433 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  29.29 
 
 
398 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4160  cytochrome P450  29.38 
 
 
385 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  28.3 
 
 
780 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  27.35 
 
 
398 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  28.28 
 
 
782 aa  133  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  28.32 
 
 
413 aa  133  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  29.47 
 
 
397 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  29.47 
 
 
397 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  29.47 
 
 
397 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  27.53 
 
 
400 aa  132  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1062  cytochrome P450  27.23 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  28.38 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  27.73 
 
 
788 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  30.38 
 
 
433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  29.24 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  26.34 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  27.84 
 
 
783 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1201  cytochrome P450  27.86 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0703508  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1021  cytochrome P450  27.75 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0644973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4028  cytochrome P450  29.1 
 
 
392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  28.3 
 
 
783 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  26.96 
 
 
420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  27.42 
 
 
395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  28.34 
 
 
396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2668  cytochrome P450 family protein  27.73 
 
 
404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  32.46 
 
 
434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  27.97 
 
 
784 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  27.03 
 
 
794 aa  130  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2659  cytochrome P450 family protein  28.4 
 
 
404 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00743758  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2452  cytochrome P450 family protein  28.61 
 
 
404 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2650  cytochrome P450 family protein  28.61 
 
 
404 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000122634 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2632  cytochrome P450 family protein  28.61 
 
 
404 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  26.57 
 
 
418 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  27.68 
 
 
784 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  26.57 
 
 
406 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>