More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0903 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0903  cytochrome P450  100 
 
 
425 aa  872    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0338626  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  39.32 
 
 
390 aa  237  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  35.45 
 
 
399 aa  225  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6858  cytochrome P450  34.31 
 
 
409 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.775 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  34.88 
 
 
421 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  33.33 
 
 
397 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6896  cytochrome P450  29.88 
 
 
406 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4052  cytochrome P450  34.26 
 
 
401 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal  0.478412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  31.78 
 
 
418 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3533  cytochrome P450  29.48 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3682  cytochrome P450  31.71 
 
 
410 aa  184  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  32.73 
 
 
399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  30.25 
 
 
403 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11815  cytochrome P450 143 cyp143  29.53 
 
 
393 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.581255  normal  0.84811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  33.24 
 
 
407 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  34.8 
 
 
412 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  33.84 
 
 
418 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0361  cytochrome P450  30.07 
 
 
406 aa  176  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  31.21 
 
 
399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0514  cytochrome P450  33.24 
 
 
421 aa  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  30.06 
 
 
398 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1478  cytochrome P450  31.05 
 
 
417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128323  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  29.3 
 
 
409 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0872  cytochrome P450  31.28 
 
 
397 aa  167  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  30.86 
 
 
399 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  29.71 
 
 
402 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1764  cytochrome P450  29.33 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  32.62 
 
 
398 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  31.82 
 
 
398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  31.25 
 
 
412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4028  cytochrome P450  32.43 
 
 
392 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  30.14 
 
 
403 aa  163  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4983  cytochrome P450  28.69 
 
 
387 aa  163  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  28.61 
 
 
420 aa  162  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  31.49 
 
 
388 aa  162  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  27.91 
 
 
410 aa  162  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  30.32 
 
 
404 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  30.96 
 
 
399 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  32.09 
 
 
424 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  31.48 
 
 
407 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1021  cytochrome P450  32.55 
 
 
425 aa  160  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0609813  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  31.48 
 
 
407 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  29.51 
 
 
404 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  29.51 
 
 
404 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  30.65 
 
 
412 aa  159  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1274  hypothetical protein  32.53 
 
 
461 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  30.87 
 
 
418 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  30.54 
 
 
399 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  30.03 
 
 
404 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  30.4 
 
 
380 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  29.56 
 
 
405 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  29.56 
 
 
405 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2249  cytochrome P450  29.63 
 
 
396 aa  157  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.274245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  29.38 
 
 
405 aa  156  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  28.19 
 
 
418 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  30.06 
 
 
398 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  31.64 
 
 
406 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  32.33 
 
 
395 aa  154  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  30.03 
 
 
412 aa  153  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  28.29 
 
 
405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  29.73 
 
 
408 aa  153  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4803  cytochrome P450  28.57 
 
 
394 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173439  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  31.02 
 
 
407 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  29.31 
 
 
428 aa  153  7e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  29.54 
 
 
398 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4160  cytochrome P450  28.42 
 
 
385 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  30.61 
 
 
394 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  30.54 
 
 
390 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4422  cytochrome P450  28.57 
 
 
394 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  30.67 
 
 
395 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4509  cytochrome P450  28.57 
 
 
394 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  28.87 
 
 
411 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  28.53 
 
 
408 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  28.86 
 
 
417 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  28.23 
 
 
406 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  30.56 
 
 
401 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  28.57 
 
 
408 aa  150  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  32.22 
 
 
398 aa  150  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  28.73 
 
 
420 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  28.73 
 
 
420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  28.73 
 
 
420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.60659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  28.11 
 
 
402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  31.38 
 
 
426 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1895  cytochrome P450  26.87 
 
 
384 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  32.15 
 
 
404 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  30.85 
 
 
415 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  29.67 
 
 
436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  27.7 
 
 
392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  30.14 
 
 
421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  27.65 
 
 
411 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  31.21 
 
 
411 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  27.65 
 
 
411 aa  146  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  28.3 
 
 
416 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  27.99 
 
 
417 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  28.3 
 
 
416 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  28.3 
 
 
428 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  31.55 
 
 
412 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  27.65 
 
 
411 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  30.89 
 
 
406 aa  146  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  27.35 
 
 
411 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>