More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3832 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3832  cytochrome P450  100 
 
 
396 aa  810    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0796027  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11220  cytochrome P450, putative (Eurofung)  46.68 
 
 
415 aa  352  5e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  32.58 
 
 
418 aa  190  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0388  heme-thiolate monooxygenase, putative  32.99 
 
 
387 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  33.33 
 
 
412 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  34.44 
 
 
407 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1895  cytochrome P450  32.82 
 
 
384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  31.59 
 
 
399 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  30.22 
 
 
399 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4131  cytochrome P450  30.38 
 
 
406 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  30.85 
 
 
398 aa  162  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  32.08 
 
 
392 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4141  cytochrome P450  30.3 
 
 
394 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  32.21 
 
 
390 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  29.59 
 
 
399 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3226  cytochrome P450  33.24 
 
 
386 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.787623  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2579  cytochrome P450  33.24 
 
 
386 aa  156  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  32.54 
 
 
413 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  32.29 
 
 
400 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  32.29 
 
 
400 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  31.85 
 
 
400 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  32.65 
 
 
406 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  32.19 
 
 
399 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  32.38 
 
 
388 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  31.06 
 
 
395 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1021  cytochrome P450  30.39 
 
 
415 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0644973 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  29.05 
 
 
424 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1274  hypothetical protein  28.21 
 
 
461 aa  150  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  32.04 
 
 
412 aa  150  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  29.57 
 
 
398 aa  149  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  30.91 
 
 
401 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  31.11 
 
 
412 aa  149  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  31.47 
 
 
402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  31.47 
 
 
402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  31.47 
 
 
402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  30.85 
 
 
396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  30.59 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  29 
 
 
397 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  29.56 
 
 
398 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  30.21 
 
 
399 aa  147  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  29.19 
 
 
403 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7766  cytochrome P450  30.38 
 
 
430 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  31.89 
 
 
403 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  30.03 
 
 
404 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  32.66 
 
 
405 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  32.66 
 
 
405 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  30.67 
 
 
405 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  29.76 
 
 
404 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  29.03 
 
 
414 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  29.76 
 
 
404 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  31.41 
 
 
404 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  29.41 
 
 
418 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  31.59 
 
 
426 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  32.41 
 
 
405 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  30.29 
 
 
415 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  29.56 
 
 
398 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  29.46 
 
 
396 aa  143  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  30.77 
 
 
401 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  30.77 
 
 
401 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  30.16 
 
 
396 aa  143  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  32.34 
 
 
411 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1964  cytochrome P450  28.47 
 
 
421 aa  143  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.512147  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  32.34 
 
 
394 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  34.1 
 
 
412 aa  142  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  29.98 
 
 
405 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  29.98 
 
 
405 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  29.98 
 
 
405 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  32.52 
 
 
394 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  28.61 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3420  cytochrome P450  30.77 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00557634  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  29.19 
 
 
400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  32.22 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5516  cytochrome P450  28.92 
 
 
429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  30.48 
 
 
380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  28.92 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  30.2 
 
 
399 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  30.08 
 
 
390 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  30.79 
 
 
393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6660  cytochrome P-450  27.45 
 
 
423 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388051  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  31.22 
 
 
401 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  30.39 
 
 
412 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  33.24 
 
 
395 aa  140  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  30.13 
 
 
412 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  29.69 
 
 
414 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  29.6 
 
 
412 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  30.96 
 
 
774 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3593  putative cytochrome P450  27.94 
 
 
420 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2001  cytochrome P450  31.03 
 
 
405 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1765  cytochrome P450  29.86 
 
 
421 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  27.14 
 
 
447 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  29.55 
 
 
406 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  28.91 
 
 
395 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  30.36 
 
 
402 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  28.95 
 
 
411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  28.92 
 
 
411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1871  cytochrome P450  32.11 
 
 
379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.309284  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  32.55 
 
 
399 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  31.02 
 
 
395 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  30.56 
 
 
403 aa  136  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3974  cytochrome P450  30.91 
 
 
413 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0514816  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>