More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1871 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1871  cytochrome P450  100 
 
 
379 aa  744    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.309284  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0343  cytochrome P450  53.64 
 
 
406 aa  353  4e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0929  cytochrome P450  50.4 
 
 
382 aa  350  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1012  cytochrome P450  45.09 
 
 
387 aa  317  2e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117007 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19760  cytochrome P450  48.07 
 
 
392 aa  310  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2579  cytochrome P450  45.26 
 
 
386 aa  298  8e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3226  cytochrome P450  45.26 
 
 
386 aa  297  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.787623  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1895  cytochrome P450  41.55 
 
 
384 aa  297  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4141  cytochrome P450  41.89 
 
 
394 aa  287  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0388  heme-thiolate monooxygenase, putative  42.55 
 
 
387 aa  280  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0149  cytochrome P450  42.86 
 
 
383 aa  276  4e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5016  cytochrome P450  45.14 
 
 
356 aa  268  8e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14547  normal  0.304515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  30.47 
 
 
412 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3832  cytochrome P450  32.11 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0796027  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  30.23 
 
 
428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4028  cytochrome P450  30.4 
 
 
392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  31.61 
 
 
399 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11220  cytochrome P450, putative (Eurofung)  29.36 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  29.67 
 
 
412 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  30.36 
 
 
436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  28.4 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  31.02 
 
 
443 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  28.94 
 
 
396 aa  119  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1274  hypothetical protein  31.18 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  33.43 
 
 
387 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  30.85 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  28.53 
 
 
390 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17810  cytochrome P450  25.19 
 
 
423 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  28.43 
 
 
414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  28.57 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  29.11 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  28.18 
 
 
417 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  28.46 
 
 
414 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  26.74 
 
 
421 aa  109  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  30 
 
 
398 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3719  cytochrome P450  30.32 
 
 
435 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3706  cytochrome P450  30.32 
 
 
435 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  27.34 
 
 
392 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3779  cytochrome P450  30.32 
 
 
435 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793715  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  28.32 
 
 
395 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0903  cytochrome P450  25.08 
 
 
425 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0338626  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  28.07 
 
 
447 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  27.18 
 
 
415 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7155  cytochrome P450 CYP124E1  30.96 
 
 
407 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.486175  normal  0.0237063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  30.87 
 
 
395 aa  106  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0813  cytochrome P450  27.07 
 
 
427 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  26.14 
 
 
395 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  29.65 
 
 
390 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  29.74 
 
 
398 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7659  cytochrome P450 CYP124E1  29.94 
 
 
412 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4317  cytochrome P450  29.46 
 
 
426 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4160  cytochrome P450  27.67 
 
 
385 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  27.01 
 
 
399 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  29.36 
 
 
413 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  26.34 
 
 
418 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4983  cytochrome P450  27.17 
 
 
387 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  29.9 
 
 
398 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  32.39 
 
 
394 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  27.62 
 
 
415 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0603  cytochrome P450  29.56 
 
 
397 aa  103  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  31.48 
 
 
398 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  25.43 
 
 
397 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0759  cytochrome P450  28.32 
 
 
403 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  24.87 
 
 
387 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  27.39 
 
 
401 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7140  cytochrome P450 CYP124E1  26.54 
 
 
428 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6858  cytochrome P450  26.85 
 
 
409 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.775 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6889  cytochrome P450  30.6 
 
 
414 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  27.8 
 
 
397 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  27.8 
 
 
397 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  27.82 
 
 
414 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3600  cytochrome P450  27.92 
 
 
422 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  27.8 
 
 
397 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1995  cytochrome P450  27.64 
 
 
417 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228695  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4180  cytochrome P450  30.26 
 
 
427 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0634116  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  26.92 
 
 
408 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  28.68 
 
 
411 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  28.68 
 
 
394 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3692  cytochrome P450  28.84 
 
 
433 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220019  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  27.51 
 
 
404 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4422  cytochrome P450  26.4 
 
 
394 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  27.51 
 
 
404 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4509  cytochrome P450  26.4 
 
 
394 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  25 
 
 
403 aa  99.8  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1929  cytochrome P450  28.08 
 
 
414 aa  99.8  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.12886  normal  0.128389 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  27.51 
 
 
404 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2014  cytochrome P450  27.37 
 
 
417 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2060  cytochrome P450  27.37 
 
 
417 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.340582  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  29.83 
 
 
390 aa  99.8  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5144  cytochrome P450  28.11 
 
 
409 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623851  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1764  cytochrome P450  26.79 
 
 
390 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  29.49 
 
 
418 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  28.72 
 
 
399 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  29.21 
 
 
398 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  26.8 
 
 
400 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2474  cytochrome P450  28.15 
 
 
427 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4803  cytochrome P450  26.4 
 
 
394 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173439  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  27.3 
 
 
398 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  28.13 
 
 
418 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  29.43 
 
 
404 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>